More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_18381 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_18381  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 
284 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30021  formyltetrahydrofolate deformylase  73.31 
 
 
296 aa  415  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.53116 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21841  formyltetrahydrofolate deformylase  69.37 
 
 
284 aa  411  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.310068  normal  0.572618 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1311  formyltetrahydrofolate deformylase  69.01 
 
 
284 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2300  formyltetrahydrofolate deformylase  73.59 
 
 
285 aa  406  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.195931  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2671  formyltetrahydrofolate deformylase  72.89 
 
 
284 aa  406  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0749436  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  63.96 
 
 
284 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.571525  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18931  formyltetrahydrofolate deformylase  64.31 
 
 
284 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.857167  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19121  formyltetrahydrofolate deformylase  63.08 
 
 
290 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18931  formyltetrahydrofolate deformylase  62.54 
 
 
284 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4234  formyltetrahydrofolate deformylase  59.72 
 
 
284 aa  357  9e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.761125  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2425  formyltetrahydrofolate deformylase  59.36 
 
 
284 aa  348  5e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  57.75 
 
 
284 aa  339  2e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  55.63 
 
 
284 aa  339  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  55.63 
 
 
284 aa  339  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  56.34 
 
 
284 aa  335  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1977  formyltetrahydrofolate deformylase  52.5 
 
 
284 aa  302  3.0000000000000004e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  50.7 
 
 
289 aa  291  8e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 
296 aa  290  3e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1668  formyltetrahydrofolate deformylase  49.29 
 
 
292 aa  284  9e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000107141  normal  0.242712 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0638  formyltetrahydrofolate deformylase  48.94 
 
 
287 aa  279  5e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  48.24 
 
 
309 aa  275  7e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00390951  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  48.23 
 
 
283 aa  268  7e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  45.45 
 
 
284 aa  264  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2199  formyltetrahydrofolate deformylase  47.35 
 
 
288 aa  263  2e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0692  formyltetrahydrofolate deformylase  46.24 
 
 
288 aa  261  6.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1052  formyltetrahydrofolate deformylase  44.33 
 
 
284 aa  259  4e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000281715  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  46.32 
 
 
287 aa  259  4e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0678  formyltetrahydrofolate deformylase  48.06 
 
 
285 aa  258  6e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  47.14 
 
 
287 aa  257  2e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  46.72 
 
 
300 aa  255  5e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1488  formyltetrahydrofolate deformylase  46.1 
 
 
296 aa  255  7e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.973322  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1023  formyltetrahydrofolate deformylase  45.2 
 
 
284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.124115  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  44.96 
 
 
300 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1695  formyltetrahydrofolate deformylase  47.67 
 
 
295 aa  251  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0684131  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  46.37 
 
 
286 aa  250  2e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1237  formyltetrahydrofolate deformylase  42.55 
 
 
284 aa  248  8e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144683  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0467  formyltetrahydrofolate deformylase  45.36 
 
 
293 aa  248  9e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  45.42 
 
 
289 aa  248  1e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1352  formyltetrahydrofolate deformylase  44.17 
 
 
282 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782528  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  45.3 
 
 
286 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2552  formyltetrahydrofolate deformylase  48.93 
 
 
284 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445829 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  45.3 
 
 
286 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38280  formyltetrahydrofolate deformylase  42.7 
 
 
283 aa  242  6e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12978  formyltetrahydrofolate deformylase  47.52 
 
 
310 aa  241  7.999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5200  formyltetrahydrofolate deformylase  45.96 
 
 
281 aa  241  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5090  formyltetrahydrofolate deformylase  45.65 
 
 
295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0903812  normal  0.160405 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  44.76 
 
 
285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11670  formyltetrahydrofolate deformylase  47.81 
 
 
291 aa  239  5e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12031  predicted protein  44.28 
 
 
297 aa  238  1e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0206302  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  42.6 
 
 
287 aa  236  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  43.86 
 
 
287 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  44.6 
 
 
299 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  42.34 
 
 
288 aa  236  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  43.88 
 
 
283 aa  236  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1007  formyltetrahydrofolate deformylase  42.14 
 
 
283 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000029138  hitchhiker  0.000000000000593821 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  44.33 
 
 
282 aa  236  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1367  formyltetrahydrofolate deformylase  42.14 
 
 
283 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0129513  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4447  formyltetrahydrofolate deformylase  42.14 
 
 
283 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000794151  decreased coverage  0.00000544491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4356  formyltetrahydrofolate deformylase  42.14 
 
 
283 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805788  normal  0.0308915 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1265  formyltetrahydrofolate deformylase  45.29 
 
 
295 aa  236  4e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771362  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  42.5 
 
 
290 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  43.36 
 
 
286 aa  235  6e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44906  formyltetrahydrofolate deformylase  43.97 
 
 
304 aa  235  7e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104572  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  42.45 
 
 
284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  43.21 
 
 
283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3312  formyltetrahydrofolate deformylase  41.43 
 
 
283 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.929874  normal  0.815852 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1192  formyltetrahydrofolate deformylase  44.6 
 
 
283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  42.86 
 
 
282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4314  formyltetrahydrofolate deformylase  42.16 
 
 
283 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000262425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4018  formyltetrahydrofolate deformylase  42.01 
 
 
283 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0329939  normal  0.0297352 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  42.86 
 
 
282 aa  233  3e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  43.21 
 
 
283 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  41.43 
 
 
282 aa  232  5e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00849533  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  45 
 
 
284 aa  232  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  42.61 
 
 
285 aa  232  6e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  41.9 
 
 
287 aa  232  6e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2419  formyltetrahydrofolate deformylase  44.8 
 
 
287 aa  232  7.000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  42.76 
 
 
297 aa  231  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1153  formyltetrahydrofolate deformylase  41.32 
 
 
284 aa  231  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.677496  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2122  formyltetrahydrofolate deformylase  45.09 
 
 
297 aa  231  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.479975  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2211  formyltetrahydrofolate deformylase  41.81 
 
 
288 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  44.84 
 
 
287 aa  230  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02600  formyltetrahydrofolate deformylase  43.93 
 
 
292 aa  230  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.304695  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2993  formyltetrahydrofolate deformylase  43.17 
 
 
280 aa  229  3e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1100  formyltetrahydrofolate deformylase  43.53 
 
 
283 aa  229  4e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.862849  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3290  formyltetrahydrofolate deformylase  43.21 
 
 
282 aa  229  5e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.38752 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  42.71 
 
 
289 aa  228  8e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  40.91 
 
 
289 aa  228  8e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  43.17 
 
 
282 aa  228  8e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  40.71 
 
 
284 aa  228  9e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  44.8 
 
 
289 aa  228  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3983  formyltetrahydrofolate deformylase  42.16 
 
 
285 aa  228  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.523347 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  42.09 
 
 
282 aa  227  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  41.58 
 
 
282 aa  227  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0706  formyltetrahydrofolate deformylase  43.45 
 
 
282 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1883  formyltetrahydrofolate deformylase  46.13 
 
 
291 aa  226  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5913  formyltetrahydrofolate deformylase  43.32 
 
 
296 aa  226  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4164  formyltetrahydrofolate deformylase  44.09 
 
 
287 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.500211  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6765  formyltetrahydrofolate deformylase  42.4 
 
 
291 aa  227  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>