More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1311 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1311  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 284 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21841  formyltetrahydrofolate deformylase  98.59 
 
 		 284 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.310068  normal  0.572618 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18381  formyltetrahydrofolate deformylase  69.01 
 
 		 284 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2671  formyltetrahydrofolate deformylase  69.37 
 
 		 284 aa  395  1e-109  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0749436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2300  formyltetrahydrofolate deformylase  70.07 
 
 		 285 aa  392  1e-108  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.195931  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30021  formyltetrahydrofolate deformylase  67.38 
 
 		 296 aa  381  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.53116 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  63.96 
 
 		 284 aa  378  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.571525  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19121  formyltetrahydrofolate deformylase  64.16 
 
 		 290 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18931  formyltetrahydrofolate deformylase  63.96 
 
 		 284 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.857167  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18931  formyltetrahydrofolate deformylase  62.19 
 
 		 284 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2425  formyltetrahydrofolate deformylase  57.6 
 
 		 284 aa  338  8e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4234  formyltetrahydrofolate deformylase  57.24 
 
 		 284 aa  337  9.999999999999999e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.761125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  57.04 
 
 		 284 aa  333  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  55.63 
 
 		 284 aa  330  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  55.63 
 
 		 284 aa  330  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  54.93 
 
 		 284 aa  323  2e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 		 289 aa  290  2e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1977  formyltetrahydrofolate deformylase  49.29 
 
 		 284 aa  288  7e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  48.57 
 
 		 296 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  46.1 
 
 		 309 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00390951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0638  formyltetrahydrofolate deformylase  47.18 
 
 		 287 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  51.28 
 
 		 283 aa  271  9e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0692  formyltetrahydrofolate deformylase  46.95 
 
 		 288 aa  270  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1668  formyltetrahydrofolate deformylase  46.43 
 
 		 292 aa  269  4e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000107141  normal  0.242712 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  48.18 
 
 		 300 aa  264  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  46.18 
 
 		 284 aa  263  3e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2199  formyltetrahydrofolate deformylase  46.04 
 
 		 288 aa  262  4.999999999999999e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  47.81 
 
 		 300 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1052  formyltetrahydrofolate deformylase  46.26 
 
 		 284 aa  259  3e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000281715  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0678  formyltetrahydrofolate deformylase  47.33 
 
 		 285 aa  258  9e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1488  formyltetrahydrofolate deformylase  45.42 
 
 		 296 aa  255  7e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.973322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0467  formyltetrahydrofolate deformylase  45.71 
 
 		 293 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1023  formyltetrahydrofolate deformylase  45.58 
 
 		 284 aa  253  3e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.124115  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1237  formyltetrahydrofolate deformylase  44.01 
 
 		 284 aa  251  1e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144683  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  45.52 
 
 		 287 aa  251  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1695  formyltetrahydrofolate deformylase  46.91 
 
 		 295 aa  250  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0684131  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  45.92 
 
 		 287 aa  250  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12031  predicted protein  45.76 
 
 		 297 aa  248  1e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0206302  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  45.52 
 
 		 286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  46.34 
 
 		 286 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  46.34 
 
 		 286 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44906  formyltetrahydrofolate deformylase  44.68 
 
 		 304 aa  240  2e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104572  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38280  formyltetrahydrofolate deformylase  42.76 
 
 		 283 aa  239  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02600  formyltetrahydrofolate deformylase  45.58 
 
 		 292 aa  239  2.9999999999999997e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.304695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  43.82 
 
 		 289 aa  238  8e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2552  formyltetrahydrofolate deformylase  45.88 
 
 		 284 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445829 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  44.64 
 
 		 285 aa  236  3e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00467  formyltetrahydrofolate deformylase  44.57 
 
 		 267 aa  235  7e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  45.2 
 
 		 299 aa  234  9e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  43.8 
 
 		 288 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  44.4 
 
 		 287 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0486  formyltetrahydrofolate deformylase  41.84 
 
 		 284 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  42.14 
 
 		 284 aa  232  5e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  43.6 
 
 		 283 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3312  formyltetrahydrofolate deformylase  42.21 
 
 		 283 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.929874  normal  0.815852 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  42.05 
 
 		 287 aa  231  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2122  formyltetrahydrofolate deformylase  44.36 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.479975  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  42.91 
 
 		 283 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0786  formyltetrahydrofolate deformylase  40.41 
 
 		 316 aa  228  7e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3983  formyltetrahydrofolate deformylase  41.46 
 
 		 285 aa  228  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.523347 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  41.37 
 
 		 284 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5200  formyltetrahydrofolate deformylase  43.51 
 
 		 281 aa  226  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  41.73 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1352  formyltetrahydrofolate deformylase  42.4 
 
 		 282 aa  226  3e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782528  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2993  formyltetrahydrofolate deformylase  41.73 
 
 		 280 aa  226  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  41.96 
 
 		 286 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  40.78 
 
 		 282 aa  226  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  43.16 
 
 		 287 aa  226  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  40.42 
 
 		 289 aa  226  5.0000000000000005e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  43.17 
 
 		 282 aa  225  6e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1740  formyltetrahydrofolate deformylase  41.05 
 
 		 286 aa  224  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  40.29 
 
 		 290 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12978  formyltetrahydrofolate deformylase  44.33 
 
 		 310 aa  224  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  42.96 
 
 		 285 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1007  formyltetrahydrofolate deformylase  41.49 
 
 		 283 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000029138  hitchhiker  0.000000000000593821 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11670  formyltetrahydrofolate deformylase  46.74 
 
 		 291 aa  224  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1153  formyltetrahydrofolate deformylase  41.26 
 
 		 284 aa  224  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.677496  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4018  formyltetrahydrofolate deformylase  42.21 
 
 		 283 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0329939  normal  0.0297352 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1883  formyltetrahydrofolate deformylase  44.57 
 
 		 291 aa  223  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1367  formyltetrahydrofolate deformylase  41.49 
 
 		 283 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0129513  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4314  formyltetrahydrofolate deformylase  42.21 
 
 		 283 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000262425  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  40.71 
 
 		 282 aa  223  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4356  formyltetrahydrofolate deformylase  41.49 
 
 		 283 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805788  normal  0.0308915 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  40.71 
 
 		 282 aa  223  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4447  formyltetrahydrofolate deformylase  41.49 
 
 		 283 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000794151  decreased coverage  0.00000544491 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6765  formyltetrahydrofolate deformylase  40.91 
 
 		 291 aa  223  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0414  formyltetrahydrofolate deformylase  43.64 
 
 		 294 aa  222  6e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175619 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  40.57 
 
 		 282 aa  221  9e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1752  formyltetrahydrofolate deformylase  41.46 
 
 		 288 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2792  formyltetrahydrofolate deformylase  40.62 
 
 		 294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.329734 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  40.07 
 
 		 282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00849533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5090  formyltetrahydrofolate deformylase  44.09 
 
 		 295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0903812  normal  0.160405 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1943  formyltetrahydrofolate deformylase  44.68 
 
 		 286 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000066655 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4357  formyltetrahydrofolate deformylase  41.37 
 
 		 286 aa  219  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.578575  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  42.71 
 
 		 289 aa  219  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5913  formyltetrahydrofolate deformylase  42.61 
 
 		 296 aa  220  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  41.37 
 
 		 282 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2167  formyltetrahydrofolate deformylase  40.62 
 
 		 294 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0452  formyltetrahydrofolate deformylase  41.05 
 
 		 286 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2781  formyltetrahydrofolate deformylase  40.62 
 
 		 294 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>