More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4357 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4357  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 286 aa  598  1e-170  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.578575  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2376  formyltetrahydrofolate deformylase  53.19 
 
 		 293 aa  301  7.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0552536 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  51.93 
 
 		 284 aa  295  7e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  52.13 
 
 		 282 aa  291  6e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2236  formyltetrahydrofolate deformylase  48.95 
 
 		 288 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  49.3 
 
 		 303 aa  288  5.0000000000000004e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28050  formyltetrahydrofolate deformylase  48.24 
 
 		 302 aa  288  9e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0961827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0609  formyltetrahydrofolate deformylase  51.25 
 
 		 282 aa  287  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 		 282 aa  285  7e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0411  formyltetrahydrofolate deformylase  48.98 
 
 		 295 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.789305  normal  0.762078 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  51.96 
 
 		 283 aa  283  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  51.06 
 
 		 297 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3590  formyltetrahydrofolate deformylase  48.08 
 
 		 298 aa  283  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3983  formyltetrahydrofolate deformylase  49.65 
 
 		 285 aa  283  3.0000000000000004e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.523347 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1153  formyltetrahydrofolate deformylase  47.72 
 
 		 284 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.677496  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  47.37 
 
 		 289 aa  282  4.0000000000000003e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1873  formyltetrahydrofolate deformylase  48.6 
 
 		 288 aa  281  6.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00824927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2211  formyltetrahydrofolate deformylase  47.9 
 
 		 288 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1188  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 		 286 aa  281  7.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000131662 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2356  formyltetrahydrofolate deformylase  51.59 
 
 		 285 aa  281  1e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1752  formyltetrahydrofolate deformylase  48.25 
 
 		 288 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1114  formyltetrahydrofolate deformylase  49.47 
 
 		 286 aa  280  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.851375  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  49.47 
 
 		 282 aa  280  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2508  formyltetrahydrofolate deformylase  48.77 
 
 		 288 aa  279  3e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.257697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3699  formyltetrahydrofolate deformylase  47.18 
 
 		 303 aa  279  3e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1192  formyltetrahydrofolate deformylase  51.6 
 
 		 283 aa  280  3e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1100  formyltetrahydrofolate deformylase  50.54 
 
 		 283 aa  279  5e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.862849  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2074  formyltetrahydrofolate deformylase  47.9 
 
 		 288 aa  278  5e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3457  formyltetrahydrofolate deformylase  47.33 
 
 		 284 aa  278  6e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1837  formyltetrahydrofolate deformylase  47.33 
 
 		 290 aa  278  9e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.78955 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2361  formyltetrahydrofolate deformylase  48.58 
 
 		 279 aa  277  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  47.87 
 
 		 284 aa  276  3e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0748  formyltetrahydrofolate deformylase  47.18 
 
 		 291 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.811069  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  48.39 
 
 		 282 aa  273  3e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3290  formyltetrahydrofolate deformylase  47.67 
 
 		 282 aa  272  6e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.38752 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  47.55 
 
 		 289 aa  271  8.000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  46.48 
 
 		 287 aa  271  9e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0706  formyltetrahydrofolate deformylase  48.39 
 
 		 282 aa  271  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  47.67 
 
 		 282 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3292  formyltetrahydrofolate deformylase  47.35 
 
 		 292 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  46.04 
 
 		 283 aa  271  1e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  48.97 
 
 		 287 aa  270  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2862  formyltetrahydrofolate deformylase  47.67 
 
 		 284 aa  270  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.413616  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  48.39 
 
 		 285 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3620  formyltetrahydrofolate deformylase  44.56 
 
 		 292 aa  269  2.9999999999999997e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3470  formyltetrahydrofolate deformylase  47.22 
 
 		 288 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2756  formyltetrahydrofolate deformylase  44.91 
 
 		 288 aa  269  4e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2106  formyltetrahydrofolate deformylase  47.33 
 
 		 288 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.815168  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2482  formyltetrahydrofolate deformylase  46.67 
 
 		 292 aa  268  5e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4036  formyltetrahydrofolate deformylase  46.67 
 
 		 292 aa  268  5e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0941  formyltetrahydrofolate deformylase  48.06 
 
 		 283 aa  268  5e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.417344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2613  formyltetrahydrofolate deformylase  48.03 
 
 		 294 aa  268  7e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4904  formyltetrahydrofolate deformylase  48.03 
 
 		 294 aa  268  7e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1145  formyltetrahydrofolate deformylase  46.1 
 
 		 287 aa  268  8e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.857181  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1081  formyltetrahydrofolate deformylase  48.03 
 
 		 307 aa  268  8.999999999999999e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4206  formyltetrahydrofolate deformylase  46.59 
 
 		 294 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2226  formyltetrahydrofolate deformylase  46.98 
 
 		 288 aa  267  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0326176  normal  0.659595 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0056  formyltetrahydrofolate deformylase  46.15 
 
 		 289 aa  267  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.333172  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  46.79 
 
 		 287 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2454  formyltetrahydrofolate deformylase  46.98 
 
 		 288 aa  266  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.160682  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4164  formyltetrahydrofolate deformylase  46.62 
 
 		 287 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.500211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0690  formyltetrahydrofolate deformylase  44.88 
 
 		 286 aa  266  2e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  46.95 
 
 		 282 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  46.13 
 
 		 287 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  46.95 
 
 		 282 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4496  formyltetrahydrofolate deformylase  45.91 
 
 		 294 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2167  formyltetrahydrofolate deformylase  45.05 
 
 		 294 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2841  formyltetrahydrofolate deformylase  45.39 
 
 		 294 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2781  formyltetrahydrofolate deformylase  45.05 
 
 		 294 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2699  formyltetrahydrofolate deformylase  45.39 
 
 		 294 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.622702  normal  0.252245 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  46.67 
 
 		 284 aa  266  4e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5642  formyltetrahydrofolate deformylase  46.4 
 
 		 294 aa  265  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.60464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1575  formyltetrahydrofolate deformylase  46.15 
 
 		 291 aa  265  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2792  formyltetrahydrofolate deformylase  45.05 
 
 		 294 aa  265  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.329734 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2993  formyltetrahydrofolate deformylase  46.26 
 
 		 280 aa  265  8e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  45.45 
 
 		 287 aa  264  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6111  formyltetrahydrofolate deformylase  45.05 
 
 		 294 aa  264  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481987  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5073  formyltetrahydrofolate deformylase  45.8 
 
 		 291 aa  264  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837668 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0534  formyltetrahydrofolate deformylase  44.37 
 
 		 294 aa  264  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1943  formyltetrahydrofolate deformylase  46.18 
 
 		 286 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000066655 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1583  formyltetrahydrofolate deformylase  46.07 
 
 		 287 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  45.49 
 
 		 289 aa  263  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1002  formyltetrahydrofolate deformylase  46.07 
 
 		 288 aa  263  3e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0584  formyltetrahydrofolate deformylase  44.48 
 
 		 291 aa  262  4e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1027  formyltetrahydrofolate deformylase  44.29 
 
 		 296 aa  262  4e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.423209  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0065  formyltetrahydrofolate deformylase  45.61 
 
 		 290 aa  261  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.957043 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  45.88 
 
 		 284 aa  261  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1883  formyltetrahydrofolate deformylase  45.55 
 
 		 291 aa  261  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6579  formyltetrahydrofolate deformylase  45.16 
 
 		 294 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  normal  0.0500835 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04640  formyltetrahydrofolate deformylase  47.6 
 
 		 301 aa  260  1e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.432525  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  44.29 
 
 		 288 aa  261  1e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2830  formyltetrahydrofolate deformylase  46.24 
 
 		 294 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.694192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2382  formyltetrahydrofolate deformylase  45.71 
 
 		 285 aa  260  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6011  formyltetrahydrofolate deformylase  45.55 
 
 		 294 aa  260  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6004  formyltetrahydrofolate deformylase  46.95 
 
 		 293 aa  260  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91162  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  45.14 
 
 		 289 aa  260  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  45.99 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3621  formyltetrahydrofolate deformylase  44.8 
 
 		 284 aa  259  3e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.155921  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4562  formyltetrahydrofolate deformylase  45.36 
 
 		 287 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5200  formyltetrahydrofolate deformylase  46.59 
 
 		 281 aa  259  4e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.569737 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>