More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2361 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2361  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 
279 aa  570  1e-161  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2376  formyltetrahydrofolate deformylase  55.52 
 
 
293 aa  320  1.9999999999999998e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0552536 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  52.5 
 
 
282 aa  308  5e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2211  formyltetrahydrofolate deformylase  51.93 
 
 
288 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  54.64 
 
 
297 aa  298  5e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2236  formyltetrahydrofolate deformylase  50.88 
 
 
288 aa  298  5e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28050  formyltetrahydrofolate deformylase  52.71 
 
 
302 aa  296  3e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0961827  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  50.9 
 
 
284 aa  295  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  53.85 
 
 
287 aa  295  7e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2971  formyltetrahydrofolate deformylase  51.79 
 
 
294 aa  295  8e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.266607 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  50.89 
 
 
282 aa  294  8e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  52.88 
 
 
303 aa  294  9e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2508  formyltetrahydrofolate deformylase  50.72 
 
 
288 aa  292  4e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.257697  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1837  formyltetrahydrofolate deformylase  54.29 
 
 
290 aa  292  5e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.78955 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0944  formyltetrahydrofolate deformylase  51.44 
 
 
294 aa  291  7e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0690  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
286 aa  291  7e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2603  formyltetrahydrofolate deformylase  51.44 
 
 
294 aa  291  9e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426643  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1114  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 
286 aa  288  6e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.851375  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1153  formyltetrahydrofolate deformylase  49.11 
 
 
284 aa  287  1e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.677496  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2830  formyltetrahydrofolate deformylase  52.81 
 
 
294 aa  287  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.694192  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  51.79 
 
 
287 aa  288  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1873  formyltetrahydrofolate deformylase  50.35 
 
 
288 aa  287  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00824927  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  48.24 
 
 
289 aa  287  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3290  formyltetrahydrofolate deformylase  51.96 
 
 
282 aa  287  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.38752 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 
282 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2862  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 
284 aa  286  4e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.413616  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2792  formyltetrahydrofolate deformylase  50.52 
 
 
294 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.329734 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2167  formyltetrahydrofolate deformylase  50.52 
 
 
294 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2781  formyltetrahydrofolate deformylase  50.52 
 
 
294 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1188  formyltetrahydrofolate deformylase  48.93 
 
 
286 aa  284  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000131662 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2993  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 
280 aa  284  1.0000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6111  formyltetrahydrofolate deformylase  50.17 
 
 
294 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481987  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1752  formyltetrahydrofolate deformylase  49.65 
 
 
288 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2074  formyltetrahydrofolate deformylase  49.3 
 
 
288 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437396  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0065  formyltetrahydrofolate deformylase  50.88 
 
 
290 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.957043 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3983  formyltetrahydrofolate deformylase  50.72 
 
 
285 aa  283  3.0000000000000004e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.523347 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2699  formyltetrahydrofolate deformylase  49.83 
 
 
294 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.622702  normal  0.252245 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0534  formyltetrahydrofolate deformylase  49.83 
 
 
294 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232127  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2841  formyltetrahydrofolate deformylase  49.83 
 
 
294 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1458  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 
294 aa  281  6.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3590  formyltetrahydrofolate deformylase  49.28 
 
 
298 aa  281  8.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0941  formyltetrahydrofolate deformylase  51.24 
 
 
283 aa  281  9e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.417344  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0609  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 
282 aa  281  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 
289 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  49.65 
 
 
289 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6004  formyltetrahydrofolate deformylase  49.81 
 
 
293 aa  280  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91162  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3310  formyltetrahydrofolate deformylase  48.75 
 
 
294 aa  279  4e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0995  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 
291 aa  278  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380176  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0482  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 
291 aa  278  5e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0699  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 
291 aa  278  5e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154521  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2119  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 
291 aa  278  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.843106  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0751  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 
291 aa  278  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.194216  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1968  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 
291 aa  278  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0467721  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0839  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 
291 aa  278  5e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  48.4 
 
 
282 aa  278  5e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  48.4 
 
 
282 aa  278  7e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  50.53 
 
 
284 aa  278  9e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6011  formyltetrahydrofolate deformylase  48.58 
 
 
294 aa  278  9e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4357  formyltetrahydrofolate deformylase  48.58 
 
 
286 aa  277  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.578575  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2106  formyltetrahydrofolate deformylase  51.6 
 
 
288 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.815168  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5642  formyltetrahydrofolate deformylase  49.06 
 
 
294 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.60464  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2111  formyltetrahydrofolate deformylase  49.1 
 
 
301 aa  275  4e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.229424  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4496  formyltetrahydrofolate deformylase  48.23 
 
 
294 aa  275  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2613  formyltetrahydrofolate deformylase  49.28 
 
 
294 aa  275  7e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4904  formyltetrahydrofolate deformylase  49.28 
 
 
294 aa  275  7e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1081  formyltetrahydrofolate deformylase  49.11 
 
 
307 aa  275  8e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  49.11 
 
 
282 aa  274  9e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  48.6 
 
 
287 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1857  formyltetrahydrofolate deformylase  49.65 
 
 
291 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.329749  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0496  formyltetrahydrofolate deformylase  50.7 
 
 
293 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.275042  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0411  formyltetrahydrofolate deformylase  48.61 
 
 
295 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.789305  normal  0.762078 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0706  formyltetrahydrofolate deformylase  49.47 
 
 
282 aa  273  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0643  formyltetrahydrofolate deformylase  49.47 
 
 
284 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3457  formyltetrahydrofolate deformylase  48.23 
 
 
284 aa  273  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 
285 aa  273  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4812  formyltetrahydrofolate deformylase  49.29 
 
 
290 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0896795  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0748  formyltetrahydrofolate deformylase  48.36 
 
 
291 aa  272  5.000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.811069  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3292  formyltetrahydrofolate deformylase  49.11 
 
 
292 aa  271  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0777  formyltetrahydrofolate deformylase  51.05 
 
 
293 aa  271  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0607  formyltetrahydrofolate deformylase  51.05 
 
 
293 aa  271  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0591  formyltetrahydrofolate deformylase  51.05 
 
 
293 aa  271  7e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232311  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2952  formyltetrahydrofolate deformylase  51.05 
 
 
293 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.855251  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3097  formyltetrahydrofolate deformylase  51.05 
 
 
293 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1524  formyltetrahydrofolate deformylase  51.05 
 
 
293 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0066  formyltetrahydrofolate deformylase  51.05 
 
 
293 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  49.65 
 
 
283 aa  271  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4206  formyltetrahydrofolate deformylase  48.69 
 
 
294 aa  270  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3699  formyltetrahydrofolate deformylase  49.28 
 
 
303 aa  271  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0909  formyltetrahydrofolate deformylase  48.03 
 
 
294 aa  270  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2454  formyltetrahydrofolate deformylase  47.35 
 
 
288 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.160682  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0852  formyltetrahydrofolate deformylase  48.03 
 
 
294 aa  270  2e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0585  formyltetrahydrofolate deformylase  49.12 
 
 
294 aa  270  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3470  formyltetrahydrofolate deformylase  48.94 
 
 
288 aa  270  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2764  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 
283 aa  270  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.999032  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  48.06 
 
 
288 aa  270  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4486  formyltetrahydrofolate deformylase  48.95 
 
 
294 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5011  formyltetrahydrofolate deformylase  48.95 
 
 
294 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1575  formyltetrahydrofolate deformylase  49.29 
 
 
291 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  48.57 
 
 
282 aa  269  4e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8736  formyltetrahydrofolate deformylase  48.4 
 
 
294 aa  268  5.9999999999999995e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.52802  normal  0.356392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>