More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1837 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1837  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 290 aa  587  1e-167  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.78955 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  56.89 
 
 		 297 aa  339  4e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2376  formyltetrahydrofolate deformylase  58.57 
 
 		 293 aa  334  7.999999999999999e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0552536 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  58.01 
 
 		 284 aa  325  7e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  57.3 
 
 		 303 aa  323  1e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  56.94 
 
 		 282 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  54.17 
 
 		 287 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4164  formyltetrahydrofolate deformylase  55.32 
 
 		 287 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.500211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  55.99 
 
 		 287 aa  311  9e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1752  formyltetrahydrofolate deformylase  55.44 
 
 		 288 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2074  formyltetrahydrofolate deformylase  55.09 
 
 		 288 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  54.39 
 
 		 287 aa  310  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0534  formyltetrahydrofolate deformylase  54.33 
 
 		 294 aa  308  5e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4496  formyltetrahydrofolate deformylase  52.84 
 
 		 294 aa  308  9e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  50.87 
 
 		 289 aa  307  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  54.58 
 
 		 285 aa  306  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  54.58 
 
 		 287 aa  306  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1157  formyltetrahydrofolate deformylase  56.84 
 
 		 284 aa  306  3e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.604603  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0609  formyltetrahydrofolate deformylase  53.33 
 
 		 282 aa  306  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5200  formyltetrahydrofolate deformylase  54.26 
 
 		 281 aa  303  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1873  formyltetrahydrofolate deformylase  54.04 
 
 		 288 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00824927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6111  formyltetrahydrofolate deformylase  53.98 
 
 		 294 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481987  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2792  formyltetrahydrofolate deformylase  53.29 
 
 		 294 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.329734 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2167  formyltetrahydrofolate deformylase  53.29 
 
 		 294 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2781  formyltetrahydrofolate deformylase  53.29 
 
 		 294 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6579  formyltetrahydrofolate deformylase  51.77 
 
 		 294 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  normal  0.0500835 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6004  formyltetrahydrofolate deformylase  51.96 
 
 		 293 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91162  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2382  formyltetrahydrofolate deformylase  54.39 
 
 		 285 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  52.65 
 
 		 282 aa  302  3.0000000000000004e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  52.65 
 
 		 282 aa  302  5.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1081  formyltetrahydrofolate deformylase  53 
 
 		 307 aa  302  5.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  52.3 
 
 		 282 aa  301  7.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2699  formyltetrahydrofolate deformylase  53.29 
 
 		 294 aa  300  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.622702  normal  0.252245 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2841  formyltetrahydrofolate deformylase  53.29 
 
 		 294 aa  300  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3470  formyltetrahydrofolate deformylase  52.13 
 
 		 288 aa  299  3e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1458  formyltetrahydrofolate deformylase  53.02 
 
 		 294 aa  300  3e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5699  formyltetrahydrofolate deformylase  54.77 
 
 		 287 aa  299  3e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  53.74 
 
 		 283 aa  299  3e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0706  formyltetrahydrofolate deformylase  55.12 
 
 		 282 aa  300  3e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5642  formyltetrahydrofolate deformylase  51.79 
 
 		 294 aa  299  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.60464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1303  formyltetrahydrofolate deformylase  53.85 
 
 		 295 aa  299  4e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.154885 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  51.72 
 
 		 287 aa  298  5e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  52.45 
 
 		 282 aa  298  8e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5913  formyltetrahydrofolate deformylase  51.74 
 
 		 296 aa  298  9e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4206  formyltetrahydrofolate deformylase  51.06 
 
 		 294 aa  298  9e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2830  formyltetrahydrofolate deformylase  51.06 
 
 		 294 aa  297  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.694192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  53.5 
 
 		 289 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2236  formyltetrahydrofolate deformylase  53.31 
 
 		 288 aa  297  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2111  formyltetrahydrofolate deformylase  53.87 
 
 		 301 aa  296  2e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.229424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 		 284 aa  296  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  53.5 
 
 		 289 aa  296  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28050  formyltetrahydrofolate deformylase  54.77 
 
 		 302 aa  296  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0961827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  50.87 
 
 		 288 aa  296  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1145  formyltetrahydrofolate deformylase  51.58 
 
 		 287 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.857181  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  51.55 
 
 		 290 aa  295  5e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1857  formyltetrahydrofolate deformylase  52.58 
 
 		 291 aa  295  5e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.329749  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 		 283 aa  295  5e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0482  formyltetrahydrofolate deformylase  53.9 
 
 		 291 aa  295  6e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2119  formyltetrahydrofolate deformylase  53.9 
 
 		 291 aa  295  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.843106  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0699  formyltetrahydrofolate deformylase  53.9 
 
 		 291 aa  295  6e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154521  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1968  formyltetrahydrofolate deformylase  53.9 
 
 		 291 aa  295  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0467721  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0995  formyltetrahydrofolate deformylase  53.9 
 
 		 291 aa  295  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380176  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0839  formyltetrahydrofolate deformylase  53.9 
 
 		 291 aa  295  6e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0751  formyltetrahydrofolate deformylase  53.9 
 
 		 291 aa  295  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.194216  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3546  formyltetrahydrofolate deformylase  54.27 
 
 		 295 aa  294  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.299703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  53.74 
 
 		 282 aa  294  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2211  formyltetrahydrofolate deformylase  52.63 
 
 		 288 aa  293  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1577  formyltetrahydrofolate deformylase  52.63 
 
 		 287 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.621505 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4562  formyltetrahydrofolate deformylase  52.28 
 
 		 287 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3312  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 		 283 aa  293  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.929874  normal  0.815852 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3290  formyltetrahydrofolate deformylase  52.82 
 
 		 282 aa  293  2e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.38752 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 		 283 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6011  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 		 294 aa  293  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  52.65 
 
 		 284 aa  293  3e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3310  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 		 294 aa  293  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1883  formyltetrahydrofolate deformylase  52.36 
 
 		 291 aa  292  4e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0584  formyltetrahydrofolate deformylase  48.43 
 
 		 291 aa  292  4e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1583  formyltetrahydrofolate deformylase  52.63 
 
 		 287 aa  292  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0909  formyltetrahydrofolate deformylase  51.6 
 
 		 294 aa  292  6e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2361  formyltetrahydrofolate deformylase  54.29 
 
 		 279 aa  292  6e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0852  formyltetrahydrofolate deformylase  51.6 
 
 		 294 aa  292  6e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  51.21 
 
 		 289 aa  291  7e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0065  formyltetrahydrofolate deformylase  51.23 
 
 		 290 aa  290  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.957043 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  52.48 
 
 		 284 aa  290  2e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0496  formyltetrahydrofolate deformylase  52.08 
 
 		 293 aa  290  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.275042  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0411  formyltetrahydrofolate deformylase  52.92 
 
 		 295 aa  289  3e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.789305  normal  0.762078 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1114  formyltetrahydrofolate deformylase  51.59 
 
 		 286 aa  289  3e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.851375  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3292  formyltetrahydrofolate deformylase  51.58 
 
 		 292 aa  290  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4812  formyltetrahydrofolate deformylase  52.65 
 
 		 290 aa  288  5.0000000000000004e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0896795  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1524  formyltetrahydrofolate deformylase  52.78 
 
 		 293 aa  288  6e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3097  formyltetrahydrofolate deformylase  52.78 
 
 		 293 aa  288  6e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1575  formyltetrahydrofolate deformylase  51.55 
 
 		 291 aa  288  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2952  formyltetrahydrofolate deformylase  52.78 
 
 		 293 aa  288  6e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.855251  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2971  formyltetrahydrofolate deformylase  51.96 
 
 		 294 aa  288  6e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.266607 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0066  formyltetrahydrofolate deformylase  52.78 
 
 		 293 aa  288  6e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0591  formyltetrahydrofolate deformylase  52.78 
 
 		 293 aa  288  7e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232311  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0777  formyltetrahydrofolate deformylase  52.78 
 
 		 293 aa  288  7e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0607  formyltetrahydrofolate deformylase  52.78 
 
 		 293 aa  288  7e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0944  formyltetrahydrofolate deformylase  50.88 
 
 		 294 aa  288  8e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1628  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 		 298 aa  288  8e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0459247  normal  0.542854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>