More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0452 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0452  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 286 aa  592  1e-168  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2111  formyltetrahydrofolate deformylase  66.55 
 
 		 301 aa  397  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.229424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0941  formyltetrahydrofolate deformylase  56.32 
 
 		 283 aa  319  3e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.417344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1883  formyltetrahydrofolate deformylase  57.45 
 
 		 291 aa  316  3e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6004  formyltetrahydrofolate deformylase  53.24 
 
 		 293 aa  311  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91162  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  55.16 
 
 		 284 aa  310  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5642  formyltetrahydrofolate deformylase  51.43 
 
 		 294 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.60464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  52.98 
 
 		 287 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6011  formyltetrahydrofolate deformylase  51.97 
 
 		 294 aa  307  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1458  formyltetrahydrofolate deformylase  53.05 
 
 		 294 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6579  formyltetrahydrofolate deformylase  51.07 
 
 		 294 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  normal  0.0500835 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3310  formyltetrahydrofolate deformylase  52.14 
 
 		 294 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4206  formyltetrahydrofolate deformylase  51.43 
 
 		 294 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  54.23 
 
 		 287 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4496  formyltetrahydrofolate deformylase  51.25 
 
 		 294 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2613  formyltetrahydrofolate deformylase  51.79 
 
 		 294 aa  304  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4904  formyltetrahydrofolate deformylase  51.79 
 
 		 294 aa  304  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3470  formyltetrahydrofolate deformylase  55 
 
 		 288 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  53.07 
 
 		 284 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2211  formyltetrahydrofolate deformylase  53.31 
 
 		 288 aa  302  5.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2074  formyltetrahydrofolate deformylase  53.12 
 
 		 288 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  54.48 
 
 		 284 aa  301  1e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0411  formyltetrahydrofolate deformylase  52.2 
 
 		 295 aa  300  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.789305  normal  0.762078 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1752  formyltetrahydrofolate deformylase  53.12 
 
 		 288 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2236  formyltetrahydrofolate deformylase  52.61 
 
 		 288 aa  300  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1873  formyltetrahydrofolate deformylase  53.12 
 
 		 288 aa  299  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00824927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5699  formyltetrahydrofolate deformylase  52.45 
 
 		 287 aa  299  4e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2971  formyltetrahydrofolate deformylase  53.24 
 
 		 294 aa  299  4e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.266607 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2862  formyltetrahydrofolate deformylase  55.4 
 
 		 284 aa  298  7e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.413616  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  52.14 
 
 		 289 aa  298  8e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  52.84 
 
 		 282 aa  297  1e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  53.9 
 
 		 287 aa  296  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1943  formyltetrahydrofolate deformylase  53.96 
 
 		 286 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000066655 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2382  formyltetrahydrofolate deformylase  52.98 
 
 		 285 aa  296  3e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2830  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 		 294 aa  296  4e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.694192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3457  formyltetrahydrofolate deformylase  54.32 
 
 		 284 aa  295  5e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  55.11 
 
 		 282 aa  295  9e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2106  formyltetrahydrofolate deformylase  54.29 
 
 		 288 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.815168  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4164  formyltetrahydrofolate deformylase  50.7 
 
 		 287 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.500211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  54.71 
 
 		 303 aa  294  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  52.94 
 
 		 289 aa  294  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0944  formyltetrahydrofolate deformylase  51.44 
 
 		 294 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2603  formyltetrahydrofolate deformylase  51.44 
 
 		 294 aa  292  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1145  formyltetrahydrofolate deformylase  51.8 
 
 		 287 aa  291  7e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.857181  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  52.25 
 
 		 289 aa  290  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5200  formyltetrahydrofolate deformylase  51.07 
 
 		 281 aa  290  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0534  formyltetrahydrofolate deformylase  52.9 
 
 		 294 aa  290  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1157  formyltetrahydrofolate deformylase  51.77 
 
 		 284 aa  289  4e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.604603  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1628  formyltetrahydrofolate deformylase  48.94 
 
 		 298 aa  288  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0459247  normal  0.542854 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0909  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 		 294 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2356  formyltetrahydrofolate deformylase  54.23 
 
 		 285 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0852  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 		 294 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2792  formyltetrahydrofolate deformylase  50.86 
 
 		 294 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.329734 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0690  formyltetrahydrofolate deformylase  53.99 
 
 		 286 aa  286  2.9999999999999996e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2454  formyltetrahydrofolate deformylase  53.21 
 
 		 288 aa  285  4e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.160682  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6111  formyltetrahydrofolate deformylase  51.2 
 
 		 294 aa  286  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481987  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2167  formyltetrahydrofolate deformylase  50.86 
 
 		 294 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2781  formyltetrahydrofolate deformylase  50.86 
 
 		 294 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2873  formyltetrahydrofolate deformylase  51.08 
 
 		 282 aa  285  8e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.571166  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2226  formyltetrahydrofolate deformylase  52.86 
 
 		 288 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0326176  normal  0.659595 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1153  formyltetrahydrofolate deformylase  48.77 
 
 		 284 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.677496  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3717  formyltetrahydrofolate deformylase  51.61 
 
 		 309 aa  284  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  51.93 
 
 		 297 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2094  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 		 298 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689957  normal  0.0344586 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  53.79 
 
 		 283 aa  282  4.0000000000000003e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2699  formyltetrahydrofolate deformylase  50.52 
 
 		 294 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.622702  normal  0.252245 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2841  formyltetrahydrofolate deformylase  50.52 
 
 		 294 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3290  formyltetrahydrofolate deformylase  51.97 
 
 		 282 aa  281  9e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.38752 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0496  formyltetrahydrofolate deformylase  51.21 
 
 		 293 aa  280  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.275042  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3621  formyltetrahydrofolate deformylase  51.07 
 
 		 284 aa  280  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.155921  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2482  formyltetrahydrofolate deformylase  50.7 
 
 		 292 aa  279  4e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4036  formyltetrahydrofolate deformylase  50.7 
 
 		 292 aa  279  4e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1577  formyltetrahydrofolate deformylase  50.53 
 
 		 287 aa  278  5e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.621505 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1837  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 		 290 aa  279  5e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.78955 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1188  formyltetrahydrofolate deformylase  51.79 
 
 		 286 aa  278  7e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000131662 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2764  formyltetrahydrofolate deformylase  50.36 
 
 		 283 aa  278  8e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.999032  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  50.35 
 
 		 289 aa  277  1e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3620  formyltetrahydrofolate deformylase  49.65 
 
 		 292 aa  278  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2376  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 		 293 aa  277  1e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0552536 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4562  formyltetrahydrofolate deformylase  49.47 
 
 		 287 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3983  formyltetrahydrofolate deformylase  52.1 
 
 		 285 aa  277  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.523347 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  51.08 
 
 		 282 aa  277  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1583  formyltetrahydrofolate deformylase  50.53 
 
 		 287 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1114  formyltetrahydrofolate deformylase  50.52 
 
 		 286 aa  276  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.851375  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3462  formyltetrahydrofolate deformylase  50.35 
 
 		 306 aa  276  4e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0591  formyltetrahydrofolate deformylase  50.87 
 
 		 293 aa  275  6e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232311  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0777  formyltetrahydrofolate deformylase  50.87 
 
 		 293 aa  275  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0607  formyltetrahydrofolate deformylase  50.87 
 
 		 293 aa  275  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  51.45 
 
 		 300 aa  274  9e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1303  formyltetrahydrofolate deformylase  49.66 
 
 		 295 aa  274  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.154885 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3097  formyltetrahydrofolate deformylase  50.52 
 
 		 293 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1524  formyltetrahydrofolate deformylase  50.52 
 
 		 293 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0066  formyltetrahydrofolate deformylase  50.52 
 
 		 293 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2952  formyltetrahydrofolate deformylase  50.52 
 
 		 293 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.855251  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0995  formyltetrahydrofolate deformylase  50.53 
 
 		 291 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380176  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0482  formyltetrahydrofolate deformylase  50.53 
 
 		 291 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1968  formyltetrahydrofolate deformylase  50.53 
 
 		 291 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0467721  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0839  formyltetrahydrofolate deformylase  50.53 
 
 		 291 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0751  formyltetrahydrofolate deformylase  50.53 
 
 		 291 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.194216  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0699  formyltetrahydrofolate deformylase  50.53 
 
 		 291 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>