More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_11670 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_11670  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 291 aa  589  1e-167  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1265  formyltetrahydrofolate deformylase  63.76 
 
 		 295 aa  377  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771362  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5090  formyltetrahydrofolate deformylase  63.07 
 
 		 295 aa  375  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0903812  normal  0.160405 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12978  formyltetrahydrofolate deformylase  61.27 
 
 		 310 aa  369  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  59.07 
 
 		 287 aa  333  2e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  59.43 
 
 		 286 aa  323  3e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4352  formyltetrahydrofolate deformylase  59.07 
 
 		 299 aa  320  1.9999999999999998e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1695  formyltetrahydrofolate deformylase  57.95 
 
 		 295 aa  314  9.999999999999999e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0684131  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1488  formyltetrahydrofolate deformylase  58.21 
 
 		 296 aa  312  4.999999999999999e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.973322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  56.27 
 
 		 286 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  56.27 
 
 		 286 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  54.8 
 
 		 289 aa  310  2e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  55.91 
 
 		 299 aa  307  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  55.32 
 
 		 300 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  52.53 
 
 		 300 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0414  formyltetrahydrofolate deformylase  53.36 
 
 		 294 aa  296  4e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175619 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  53.55 
 
 		 287 aa  294  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  54.12 
 
 		 286 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2122  formyltetrahydrofolate deformylase  56.54 
 
 		 297 aa  292  4e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.479975  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2419  formyltetrahydrofolate deformylase  52.67 
 
 		 287 aa  285  5e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1987  formyltetrahydrofolate deformylase  52.69 
 
 		 307 aa  285  5.999999999999999e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  50.89 
 
 		 283 aa  281  1e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  52.48 
 
 		 296 aa  280  2e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  52.5 
 
 		 289 aa  275  5e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0678  formyltetrahydrofolate deformylase  50.9 
 
 		 285 aa  271  9e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0638  formyltetrahydrofolate deformylase  48.57 
 
 		 287 aa  267  2e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4234  formyltetrahydrofolate deformylase  49.29 
 
 		 284 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.761125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1977  formyltetrahydrofolate deformylase  49.29 
 
 		 284 aa  265  5.999999999999999e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0692  formyltetrahydrofolate deformylase  47.14 
 
 		 288 aa  265  8.999999999999999e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 		 284 aa  263  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1668  formyltetrahydrofolate deformylase  47.5 
 
 		 292 aa  262  4e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000107141  normal  0.242712 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  47.86 
 
 		 309 aa  261  8.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00390951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2199  formyltetrahydrofolate deformylase  46.79 
 
 		 288 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2425  formyltetrahydrofolate deformylase  48.58 
 
 		 284 aa  256  3e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12031  predicted protein  52.45 
 
 		 297 aa  256  4e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0206302  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  48.58 
 
 		 284 aa  255  7e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  48.42 
 
 		 284 aa  255  8e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  48.42 
 
 		 284 aa  255  8e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2211  formyltetrahydrofolate deformylase  49.12 
 
 		 288 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  46.43 
 
 		 284 aa  253  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  50.89 
 
 		 290 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  47.55 
 
 		 289 aa  252  6e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  48.78 
 
 		 287 aa  251  7e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1883  formyltetrahydrofolate deformylase  50.91 
 
 		 291 aa  251  8.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3621  formyltetrahydrofolate deformylase  47.5 
 
 		 284 aa  251  8.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.155921  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1303  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 		 295 aa  251  9.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.154885 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1145  formyltetrahydrofolate deformylase  49.11 
 
 		 287 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.857181  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0467  formyltetrahydrofolate deformylase  46.43 
 
 		 293 aa  250  2e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  50.17 
 
 		 287 aa  250  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2236  formyltetrahydrofolate deformylase  48.41 
 
 		 288 aa  249  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 		 282 aa  248  6e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  46.18 
 
 		 289 aa  247  1e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2382  formyltetrahydrofolate deformylase  48.43 
 
 		 285 aa  247  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 		 284 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  47.69 
 
 		 282 aa  246  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00849533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  48.4 
 
 		 283 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  47.5 
 
 		 282 aa  245  6e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  48.57 
 
 		 283 aa  245  6.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  47.5 
 
 		 282 aa  244  8e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  48.75 
 
 		 288 aa  244  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1007  formyltetrahydrofolate deformylase  48.76 
 
 		 283 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000029138  hitchhiker  0.000000000000593821 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  47.86 
 
 		 282 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3312  formyltetrahydrofolate deformylase  47.33 
 
 		 283 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.929874  normal  0.815852 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1367  formyltetrahydrofolate deformylase  48.76 
 
 		 283 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0129513  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  48.04 
 
 		 283 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0786  formyltetrahydrofolate deformylase  47.87 
 
 		 316 aa  243  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4447  formyltetrahydrofolate deformylase  48.76 
 
 		 283 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000794151  decreased coverage  0.00000544491 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  45.91 
 
 		 285 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4164  formyltetrahydrofolate deformylase  48.04 
 
 		 287 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.500211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1114  formyltetrahydrofolate deformylase  47.6 
 
 		 286 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.851375  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4356  formyltetrahydrofolate deformylase  48.76 
 
 		 283 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805788  normal  0.0308915 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1577  formyltetrahydrofolate deformylase  47.7 
 
 		 287 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.621505 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1583  formyltetrahydrofolate deformylase  47.7 
 
 		 287 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38280  formyltetrahydrofolate deformylase  46.98 
 
 		 283 aa  242  5e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 		 282 aa  242  5e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  48.4 
 
 		 284 aa  242  6e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1153  formyltetrahydrofolate deformylase  46.98 
 
 		 284 aa  241  7.999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.677496  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3546  formyltetrahydrofolate deformylase  49.48 
 
 		 295 aa  241  9e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.299703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18931  formyltetrahydrofolate deformylase  46.72 
 
 		 284 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4314  formyltetrahydrofolate deformylase  47.33 
 
 		 283 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000262425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4018  formyltetrahydrofolate deformylase  47.33 
 
 		 283 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0329939  normal  0.0297352 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1752  formyltetrahydrofolate deformylase  47 
 
 		 288 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  48.75 
 
 		 287 aa  240  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2862  formyltetrahydrofolate deformylase  48.75 
 
 		 284 aa  240  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.413616  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  47.86 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4562  formyltetrahydrofolate deformylase  46.69 
 
 		 287 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  46.48 
 
 		 282 aa  239  4e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3290  formyltetrahydrofolate deformylase  47.14 
 
 		 282 aa  239  4e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.38752 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18381  formyltetrahydrofolate deformylase  47.81 
 
 		 284 aa  239  5e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1943  formyltetrahydrofolate deformylase  49.47 
 
 		 286 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000066655 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1873  formyltetrahydrofolate deformylase  47.55 
 
 		 288 aa  239  5e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00824927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  47.69 
 
 		 287 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5699  formyltetrahydrofolate deformylase  47.35 
 
 		 287 aa  239  5e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  48.74 
 
 		 289 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  48.74 
 
 		 289 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 		 303 aa  238  9e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  47.86 
 
 		 285 aa  238  9e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1081  formyltetrahydrofolate deformylase  47.14 
 
 		 307 aa  237  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1002  formyltetrahydrofolate deformylase  48.21 
 
 		 288 aa  238  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2074  formyltetrahydrofolate deformylase  46.29 
 
 		 288 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437396  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>