More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0523 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 289 aa  593  1e-168  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  73.85 
 
 		 287 aa  441  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  71.73 
 
 		 286 aa  424  1e-117  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  66.9 
 
 		 299 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  65.48 
 
 		 286 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  64.79 
 
 		 286 aa  387  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  65.48 
 
 		 286 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1695  formyltetrahydrofolate deformylase  64.89 
 
 		 295 aa  369  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0684131  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  61.21 
 
 		 300 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  61.57 
 
 		 300 aa  355  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  59.57 
 
 		 287 aa  354  7.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1488  formyltetrahydrofolate deformylase  61.13 
 
 		 296 aa  352  4e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.973322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5090  formyltetrahydrofolate deformylase  58.93 
 
 		 295 aa  342  5e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0903812  normal  0.160405 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0414  formyltetrahydrofolate deformylase  57.09 
 
 		 294 aa  339  2.9999999999999998e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1265  formyltetrahydrofolate deformylase  58.57 
 
 		 295 aa  339  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771362  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2419  formyltetrahydrofolate deformylase  58.87 
 
 		 287 aa  333  2e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1987  formyltetrahydrofolate deformylase  56.49 
 
 		 307 aa  331  1e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12978  formyltetrahydrofolate deformylase  57.95 
 
 		 310 aa  328  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4352  formyltetrahydrofolate deformylase  58.8 
 
 		 299 aa  317  2e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2122  formyltetrahydrofolate deformylase  55.63 
 
 		 297 aa  314  9.999999999999999e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.479975  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  52.98 
 
 		 283 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11670  formyltetrahydrofolate deformylase  54.8 
 
 		 291 aa  310  1e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  52.98 
 
 		 296 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  53.98 
 
 		 289 aa  302  4.0000000000000003e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  52.48 
 
 		 284 aa  298  9e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  52.48 
 
 		 284 aa  298  9e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  53.19 
 
 		 290 aa  293  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  50.52 
 
 		 288 aa  291  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  51.23 
 
 		 284 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1977  formyltetrahydrofolate deformylase  53.19 
 
 		 284 aa  290  2e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4234  formyltetrahydrofolate deformylase  51.77 
 
 		 284 aa  290  3e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.761125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0638  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 		 287 aa  288  7e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  49.29 
 
 		 283 aa  286  2e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2199  formyltetrahydrofolate deformylase  49.83 
 
 		 288 aa  286  2e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  50.9 
 
 		 282 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  51.06 
 
 		 282 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00849533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  51.97 
 
 		 287 aa  282  4.0000000000000003e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1367  formyltetrahydrofolate deformylase  51.42 
 
 		 283 aa  280  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0129513  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4356  formyltetrahydrofolate deformylase  51.42 
 
 		 283 aa  280  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805788  normal  0.0308915 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  52.67 
 
 		 287 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 		 284 aa  280  1e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4447  formyltetrahydrofolate deformylase  51.42 
 
 		 283 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000794151  decreased coverage  0.00000544491 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2425  formyltetrahydrofolate deformylase  50.35 
 
 		 284 aa  280  2e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1007  formyltetrahydrofolate deformylase  51.06 
 
 		 283 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000029138  hitchhiker  0.000000000000593821 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4314  formyltetrahydrofolate deformylase  51.42 
 
 		 283 aa  279  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000262425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4018  formyltetrahydrofolate deformylase  51.42 
 
 		 283 aa  279  4e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0329939  normal  0.0297352 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1081  formyltetrahydrofolate deformylase  51.25 
 
 		 307 aa  279  4e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0692  formyltetrahydrofolate deformylase  48.39 
 
 		 288 aa  277  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38280  formyltetrahydrofolate deformylase  50.35 
 
 		 283 aa  276  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  51.25 
 
 		 284 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3290  formyltetrahydrofolate deformylase  50.35 
 
 		 282 aa  277  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.38752 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  49.29 
 
 		 283 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  49.13 
 
 		 285 aa  275  5e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  46.32 
 
 		 309 aa  275  5e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00390951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3312  formyltetrahydrofolate deformylase  49.29 
 
 		 283 aa  275  5e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.929874  normal  0.815852 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  47.86 
 
 		 284 aa  274  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  49.29 
 
 		 283 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  52.13 
 
 		 287 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  50.9 
 
 		 282 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  51.97 
 
 		 285 aa  273  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1352  formyltetrahydrofolate deformylase  47.02 
 
 		 282 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782528  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  50.54 
 
 		 282 aa  273  3e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  50.9 
 
 		 282 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1668  formyltetrahydrofolate deformylase  48.24 
 
 		 292 aa  272  5.000000000000001e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000107141  normal  0.242712 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  49.29 
 
 		 282 aa  272  5.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  51.97 
 
 		 282 aa  272  5.000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5913  formyltetrahydrofolate deformylase  50.9 
 
 		 296 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  51.79 
 
 		 297 aa  271  9e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  51.79 
 
 		 283 aa  271  9e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2382  formyltetrahydrofolate deformylase  52.31 
 
 		 285 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0584  formyltetrahydrofolate deformylase  48.76 
 
 		 291 aa  269  4e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4164  formyltetrahydrofolate deformylase  50.53 
 
 		 287 aa  269  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.500211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0609  formyltetrahydrofolate deformylase  49.1 
 
 		 282 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  48.58 
 
 		 284 aa  268  8.999999999999999e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  51.25 
 
 		 282 aa  267  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0706  formyltetrahydrofolate deformylase  51.24 
 
 		 282 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  50.89 
 
 		 287 aa  267  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 		 289 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0467  formyltetrahydrofolate deformylase  48.23 
 
 		 293 aa  265  5.999999999999999e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3983  formyltetrahydrofolate deformylase  50.87 
 
 		 285 aa  265  7e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.523347 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6004  formyltetrahydrofolate deformylase  49.1 
 
 		 293 aa  265  8e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91162  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 		 289 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1740  formyltetrahydrofolate deformylase  49.29 
 
 		 286 aa  264  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  49.1 
 
 		 284 aa  264  2e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1145  formyltetrahydrofolate deformylase  49.3 
 
 		 287 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.857181  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  47.86 
 
 		 289 aa  263  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1303  formyltetrahydrofolate deformylase  48.78 
 
 		 295 aa  263  4e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.154885 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0056  formyltetrahydrofolate deformylase  48.91 
 
 		 289 aa  263  4e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.333172  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  48.6 
 
 		 284 aa  262  4e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4562  formyltetrahydrofolate deformylase  49.65 
 
 		 287 aa  262  6e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3621  formyltetrahydrofolate deformylase  48.93 
 
 		 284 aa  261  8.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.155921  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3590  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 		 298 aa  261  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2993  formyltetrahydrofolate deformylase  50.9 
 
 		 280 aa  261  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0852  formyltetrahydrofolate deformylase  50.54 
 
 		 294 aa  259  3e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0909  formyltetrahydrofolate deformylase  50.54 
 
 		 294 aa  259  3e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3546  formyltetrahydrofolate deformylase  50.17 
 
 		 295 aa  259  3e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.299703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1458  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 		 294 aa  259  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1583  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 		 287 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  49.1 
 
 		 287 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2613  formyltetrahydrofolate deformylase  49.46 
 
 		 294 aa  259  4e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>