More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1522 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 
287 aa  586  1e-166  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  79.09 
 
 
286 aa  468  1.0000000000000001e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  73.85 
 
 
289 aa  441  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  68.33 
 
 
286 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  67.26 
 
 
286 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  68.33 
 
 
299 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  68.33 
 
 
286 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1695  formyltetrahydrofolate deformylase  65.96 
 
 
295 aa  382  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0684131  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  63.07 
 
 
287 aa  381  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1488  formyltetrahydrofolate deformylase  65.48 
 
 
296 aa  380  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.973322  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  61.97 
 
 
300 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  60.21 
 
 
300 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5090  formyltetrahydrofolate deformylase  60.78 
 
 
295 aa  355  5.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0903812  normal  0.160405 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1265  formyltetrahydrofolate deformylase  60.85 
 
 
295 aa  352  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771362  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2419  formyltetrahydrofolate deformylase  59.79 
 
 
287 aa  352  5.9999999999999994e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2122  formyltetrahydrofolate deformylase  61.62 
 
 
297 aa  350  1e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.479975  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0414  formyltetrahydrofolate deformylase  59.79 
 
 
294 aa  348  6e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0175619 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12978  formyltetrahydrofolate deformylase  59.43 
 
 
310 aa  347  2e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4352  formyltetrahydrofolate deformylase  61.92 
 
 
299 aa  345  4e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157663  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1987  formyltetrahydrofolate deformylase  59.79 
 
 
307 aa  342  4e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11670  formyltetrahydrofolate deformylase  59.07 
 
 
291 aa  333  2e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  55.44 
 
 
296 aa  330  2e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  55.36 
 
 
283 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2199  formyltetrahydrofolate deformylase  55.63 
 
 
288 aa  318  3.9999999999999996e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  55.87 
 
 
290 aa  312  4.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  54.45 
 
 
288 aa  311  5.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0638  formyltetrahydrofolate deformylase  53.68 
 
 
287 aa  310  2e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  56.03 
 
 
289 aa  309  2.9999999999999997e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  55.71 
 
 
287 aa  308  5e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  52.28 
 
 
284 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  52.28 
 
 
284 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  52.46 
 
 
284 aa  305  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4234  formyltetrahydrofolate deformylase  52.31 
 
 
284 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.761125  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  55.36 
 
 
282 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00849533  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0692  formyltetrahydrofolate deformylase  52.69 
 
 
288 aa  302  4.0000000000000003e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  52.08 
 
 
284 aa  301  7.000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0467  formyltetrahydrofolate deformylase  52.84 
 
 
293 aa  301  9e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1977  formyltetrahydrofolate deformylase  52.84 
 
 
284 aa  301  1e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  54.84 
 
 
282 aa  300  3e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  53.76 
 
 
284 aa  299  3e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  55.56 
 
 
283 aa  298  6e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  53.52 
 
 
284 aa  298  7e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4164  formyltetrahydrofolate deformylase  55.36 
 
 
287 aa  298  9e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.500211  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  52.14 
 
 
284 aa  297  1e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2425  formyltetrahydrofolate deformylase  50.87 
 
 
284 aa  297  1e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2382  formyltetrahydrofolate deformylase  55.71 
 
 
285 aa  296  3e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  52.5 
 
 
283 aa  296  3e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  53.38 
 
 
283 aa  295  5e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  51.39 
 
 
285 aa  295  7e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38280  formyltetrahydrofolate deformylase  54.45 
 
 
283 aa  294  9e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1352  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 
282 aa  294  1e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782528  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  54.48 
 
 
284 aa  293  2e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1668  formyltetrahydrofolate deformylase  51.6 
 
 
292 aa  293  2e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000107141  normal  0.242712 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  53.02 
 
 
283 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  54.77 
 
 
287 aa  292  4e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3312  formyltetrahydrofolate deformylase  53.38 
 
 
283 aa  292  6e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.929874  normal  0.815852 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  52.33 
 
 
282 aa  291  6e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  48.58 
 
 
309 aa  291  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00390951  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  51.07 
 
 
289 aa  290  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1145  formyltetrahydrofolate deformylase  51.57 
 
 
287 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.857181  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4314  formyltetrahydrofolate deformylase  53.74 
 
 
283 aa  289  4e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000262425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4018  formyltetrahydrofolate deformylase  53.74 
 
 
283 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0329939  normal  0.0297352 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1367  formyltetrahydrofolate deformylase  53.74 
 
 
283 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0129513  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  50.87 
 
 
284 aa  287  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4356  formyltetrahydrofolate deformylase  53.74 
 
 
283 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805788  normal  0.0308915 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4447  formyltetrahydrofolate deformylase  53.74 
 
 
283 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000794151  decreased coverage  0.00000544491 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  51.43 
 
 
282 aa  286  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1007  formyltetrahydrofolate deformylase  53.38 
 
 
283 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000029138  hitchhiker  0.000000000000593821 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1583  formyltetrahydrofolate deformylase  52.67 
 
 
287 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  51.97 
 
 
287 aa  286  2.9999999999999996e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4562  formyltetrahydrofolate deformylase  51.6 
 
 
287 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5913  formyltetrahydrofolate deformylase  52.33 
 
 
296 aa  285  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0706  formyltetrahydrofolate deformylase  52.3 
 
 
282 aa  284  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1883  formyltetrahydrofolate deformylase  52.69 
 
 
291 aa  283  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  52.69 
 
 
287 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6004  formyltetrahydrofolate deformylase  51.25 
 
 
293 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91162  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1081  formyltetrahydrofolate deformylase  50.9 
 
 
307 aa  283  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  53.05 
 
 
282 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0944  formyltetrahydrofolate deformylase  52.33 
 
 
294 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  53.21 
 
 
297 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1628  formyltetrahydrofolate deformylase  51.25 
 
 
298 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0459247  normal  0.542854 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1577  formyltetrahydrofolate deformylase  51.43 
 
 
287 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.621505 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2603  formyltetrahydrofolate deformylase  52.33 
 
 
294 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426643  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28050  formyltetrahydrofolate deformylase  52.69 
 
 
302 aa  281  7.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0961827  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1740  formyltetrahydrofolate deformylase  49.65 
 
 
286 aa  281  8.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2993  formyltetrahydrofolate deformylase  52.33 
 
 
280 aa  281  9e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2971  formyltetrahydrofolate deformylase  51.97 
 
 
294 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.266607 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0678  formyltetrahydrofolate deformylase  50.9 
 
 
285 aa  281  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1153  formyltetrahydrofolate deformylase  47.33 
 
 
284 aa  280  2e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.677496  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  49.65 
 
 
282 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 
282 aa  279  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 
282 aa  279  4e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0584  formyltetrahydrofolate deformylase  48.45 
 
 
291 aa  278  6e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4206  formyltetrahydrofolate deformylase  50.54 
 
 
294 aa  278  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3621  formyltetrahydrofolate deformylase  48.57 
 
 
284 aa  278  8e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.155921  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0609  formyltetrahydrofolate deformylase  48.57 
 
 
282 aa  276  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3983  formyltetrahydrofolate deformylase  51.42 
 
 
285 aa  276  3e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.523347 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6579  formyltetrahydrofolate deformylase  48.75 
 
 
294 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  normal  0.0500835 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2862  formyltetrahydrofolate deformylase  51.59 
 
 
284 aa  275  4e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.413616  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0786  formyltetrahydrofolate deformylase  52.48 
 
 
316 aa  275  6e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>