More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_2051 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 285 aa  593  1e-169  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4314  formyltetrahydrofolate deformylase  69.86 
 
 		 283 aa  421  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000262425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4018  formyltetrahydrofolate deformylase  69.75 
 
 		 283 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0329939  normal  0.0297352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  69.75 
 
 		 282 aa  420  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00849533  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1367  formyltetrahydrofolate deformylase  69.15 
 
 		 283 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0129513  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4447  formyltetrahydrofolate deformylase  69.15 
 
 		 283 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000794151  decreased coverage  0.00000544491 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3312  formyltetrahydrofolate deformylase  68.44 
 
 		 283 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.929874  normal  0.815852 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4356  formyltetrahydrofolate deformylase  69.15 
 
 		 283 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805788  normal  0.0308915 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1007  formyltetrahydrofolate deformylase  68.79 
 
 		 283 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000029138  hitchhiker  0.000000000000593821 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  68.44 
 
 		 283 aa  407  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  68.44 
 
 		 283 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38280  formyltetrahydrofolate deformylase  66.19 
 
 		 283 aa  407  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  65.14 
 
 		 284 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  66.19 
 
 		 290 aa  399  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  63.96 
 
 		 288 aa  393  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5913  formyltetrahydrofolate deformylase  62.72 
 
 		 296 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  60.99 
 
 		 287 aa  375  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1740  formyltetrahydrofolate deformylase  62.06 
 
 		 286 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  61.84 
 
 		 283 aa  370  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1352  formyltetrahydrofolate deformylase  58.66 
 
 		 282 aa  358  4e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782528  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0056  formyltetrahydrofolate deformylase  60.64 
 
 		 289 aa  357  9.999999999999999e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.333172  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  59.93 
 
 		 287 aa  355  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0486  formyltetrahydrofolate deformylase  56.89 
 
 		 284 aa  353  2e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0584  formyltetrahydrofolate deformylase  58.74 
 
 		 291 aa  352  5e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0786  formyltetrahydrofolate deformylase  55.44 
 
 		 316 aa  338  7e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6765  formyltetrahydrofolate deformylase  53.5 
 
 		 291 aa  330  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2552  formyltetrahydrofolate deformylase  54.8 
 
 		 284 aa  323  3e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445829 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3654  formyltetrahydrofolate deformylase  54.06 
 
 		 290 aa  318  6e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02600  formyltetrahydrofolate deformylase  53 
 
 		 292 aa  315  5e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.304695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  53.05 
 
 		 300 aa  314  9e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00467  formyltetrahydrofolate deformylase  54.51 
 
 		 267 aa  313  1.9999999999999998e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  53.05 
 
 		 300 aa  311  5.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4965  formyltetrahydrofolate deformylase  52.82 
 
 		 289 aa  311  1e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  51.41 
 
 		 283 aa  310  1e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  50.54 
 
 		 283 aa  295  5e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  51.39 
 
 		 287 aa  295  7e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  51.8 
 
 		 287 aa  293  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  47.89 
 
 		 296 aa  293  3e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  51.44 
 
 		 303 aa  293  3e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 		 284 aa  292  5e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2419  formyltetrahydrofolate deformylase  50.53 
 
 		 287 aa  290  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  52.86 
 
 		 286 aa  290  2e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28050  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 		 302 aa  290  2e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0961827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  50.54 
 
 		 299 aa  288  6e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5200  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 		 281 aa  288  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1488  formyltetrahydrofolate deformylase  52.33 
 
 		 296 aa  287  1e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.973322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  47.35 
 
 		 282 aa  287  1e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 		 282 aa  286  4e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  49.1 
 
 		 282 aa  285  5e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  48.95 
 
 		 284 aa  285  7e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4352  formyltetrahydrofolate deformylase  50.88 
 
 		 299 aa  285  7e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  49.46 
 
 		 286 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  49.46 
 
 		 286 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0609  formyltetrahydrofolate deformylase  46.29 
 
 		 282 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  48.38 
 
 		 284 aa  282  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  48.38 
 
 		 284 aa  282  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0706  formyltetrahydrofolate deformylase  48.06 
 
 		 282 aa  282  5.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  45.58 
 
 		 282 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1977  formyltetrahydrofolate deformylase  49.28 
 
 		 284 aa  281  6.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  49.65 
 
 		 284 aa  281  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  46.5 
 
 		 284 aa  281  8.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  47.9 
 
 		 287 aa  281  9e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3621  formyltetrahydrofolate deformylase  47.54 
 
 		 284 aa  280  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.155921  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  47 
 
 		 282 aa  281  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  47 
 
 		 282 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0467  formyltetrahydrofolate deformylase  46.76 
 
 		 293 aa  280  2e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2122  formyltetrahydrofolate deformylase  48.04 
 
 		 297 aa  280  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.479975  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0944  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 		 294 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2508  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 		 288 aa  279  3e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.257697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  47.89 
 
 		 289 aa  279  3e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2971  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 		 294 aa  279  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.266607 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  48.2 
 
 		 297 aa  279  4e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2603  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 		 294 aa  278  7e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4562  formyltetrahydrofolate deformylase  49.29 
 
 		 287 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  48.57 
 
 		 286 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1114  formyltetrahydrofolate deformylase  45.77 
 
 		 286 aa  277  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.851375  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18880  formyltetrahydrofolate deformylase  48.06 
 
 		 282 aa  277  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0052951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  46.29 
 
 		 282 aa  277  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  49.46 
 
 		 284 aa  276  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0638  formyltetrahydrofolate deformylase  46.04 
 
 		 287 aa  276  3e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2613  formyltetrahydrofolate deformylase  49.46 
 
 		 294 aa  276  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4904  formyltetrahydrofolate deformylase  49.46 
 
 		 294 aa  276  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  47.14 
 
 		 287 aa  276  4e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  47.65 
 
 		 285 aa  276  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1153  formyltetrahydrofolate deformylase  47.16 
 
 		 284 aa  275  5e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.677496  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2425  formyltetrahydrofolate deformylase  47.12 
 
 		 284 aa  275  5e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  49.13 
 
 		 289 aa  275  5e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0678  formyltetrahydrofolate deformylase  48.25 
 
 		 285 aa  275  5e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2873  formyltetrahydrofolate deformylase  48.06 
 
 		 282 aa  275  6e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.571166  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1081  formyltetrahydrofolate deformylase  45.94 
 
 		 307 aa  275  6e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3717  formyltetrahydrofolate deformylase  47.31 
 
 		 309 aa  275  6e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0643  formyltetrahydrofolate deformylase  47.89 
 
 		 284 aa  275  6e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  48.38 
 
 		 284 aa  275  7e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1577  formyltetrahydrofolate deformylase  48.56 
 
 		 287 aa  275  8e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.621505 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6004  formyltetrahydrofolate deformylase  47.69 
 
 		 293 aa  275  9e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91162  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6579  formyltetrahydrofolate deformylase  47.69 
 
 		 294 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  normal  0.0500835 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1188  formyltetrahydrofolate deformylase  45.07 
 
 		 286 aa  274  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000131662 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1695  formyltetrahydrofolate deformylase  49.29 
 
 		 295 aa  273  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0684131  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2891  formyltetrahydrofolate deformylase  45.58 
 
 		 283 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.954133  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4206  formyltetrahydrofolate deformylase  47.7 
 
 		 294 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>