More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1023 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1023  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 284 aa  589  1e-167  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.124115  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1237  formyltetrahydrofolate deformylase  94.37 
 
 		 284 aa  538  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144683  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1052  formyltetrahydrofolate deformylase  93.66 
 
 		 284 aa  532  1e-150  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000281715  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  49.65 
 
 		 289 aa  311  1e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  47.02 
 
 		 284 aa  294  9e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0692  formyltetrahydrofolate deformylase  48.93 
 
 		 288 aa  294  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  48.06 
 
 		 296 aa  293  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  48.06 
 
 		 284 aa  291  8e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1977  formyltetrahydrofolate deformylase  46.81 
 
 		 284 aa  289  4e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0638  formyltetrahydrofolate deformylase  47.33 
 
 		 287 aa  288  6e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1488  formyltetrahydrofolate deformylase  45.96 
 
 		 296 aa  287  1e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.973322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4234  formyltetrahydrofolate deformylase  46.81 
 
 		 284 aa  286  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.761125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  45.39 
 
 		 284 aa  285  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  45.39 
 
 		 284 aa  285  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1668  formyltetrahydrofolate deformylase  47.16 
 
 		 292 aa  285  5.999999999999999e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000107141  normal  0.242712 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  47 
 
 		 284 aa  285  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  48.04 
 
 		 309 aa  285  7e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00390951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2199  formyltetrahydrofolate deformylase  48.04 
 
 		 288 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0467  formyltetrahydrofolate deformylase  45.39 
 
 		 293 aa  278  5e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2425  formyltetrahydrofolate deformylase  46.45 
 
 		 284 aa  278  8e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  46.81 
 
 		 300 aa  271  7e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  46.24 
 
 		 283 aa  271  1e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18381  formyltetrahydrofolate deformylase  45.2 
 
 		 284 aa  266  4e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1311  formyltetrahydrofolate deformylase  45.58 
 
 		 284 aa  265  8e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21841  formyltetrahydrofolate deformylase  45.23 
 
 		 284 aa  264  1e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.310068  normal  0.572618 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  45.74 
 
 		 287 aa  258  6e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  45.74 
 
 		 284 aa  258  8e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.571525  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  44.68 
 
 		 300 aa  257  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  43.73 
 
 		 287 aa  257  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44906  formyltetrahydrofolate deformylase  43.31 
 
 		 304 aa  256  3e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104572  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18931  formyltetrahydrofolate deformylase  45.04 
 
 		 284 aa  255  5e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.857167  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  41.7 
 
 		 284 aa  254  8e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2300  formyltetrahydrofolate deformylase  44.52 
 
 		 285 aa  254  9e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.195931  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19121  formyltetrahydrofolate deformylase  45.04 
 
 		 290 aa  253  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5913  formyltetrahydrofolate deformylase  46.32 
 
 		 296 aa  253  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  45.07 
 
 		 289 aa  251  7e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2671  formyltetrahydrofolate deformylase  42.76 
 
 		 284 aa  251  1e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0749436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  44.17 
 
 		 287 aa  251  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12031  predicted protein  43.11 
 
 		 297 aa  250  2e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0206302  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  45.42 
 
 		 286 aa  249  3e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0678  formyltetrahydrofolate deformylase  41.38 
 
 		 285 aa  247  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18931  formyltetrahydrofolate deformylase  42.2 
 
 		 284 aa  247  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1695  formyltetrahydrofolate deformylase  41.99 
 
 		 295 aa  246  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0684131  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1352  formyltetrahydrofolate deformylase  41.7 
 
 		 282 aa  246  4e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782528  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  42.05 
 
 		 284 aa  246  4e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0414  formyltetrahydrofolate deformylase  44.56 
 
 		 294 aa  245  8e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175619 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  41.28 
 
 		 285 aa  244  8e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38280  formyltetrahydrofolate deformylase  42.61 
 
 		 283 aa  243  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2756  formyltetrahydrofolate deformylase  41.07 
 
 		 288 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  43.11 
 
 		 286 aa  242  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  43.11 
 
 		 286 aa  242  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  41.94 
 
 		 290 aa  242  5e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  41.22 
 
 		 288 aa  241  7e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2764  formyltetrahydrofolate deformylase  44.17 
 
 		 283 aa  241  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.999032  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  40.85 
 
 		 283 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  42.4 
 
 		 299 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  40.85 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3312  formyltetrahydrofolate deformylase  40.49 
 
 		 283 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.929874  normal  0.815852 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  43.37 
 
 		 287 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0486  formyltetrahydrofolate deformylase  39.78 
 
 		 284 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  40.07 
 
 		 289 aa  239  4e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0811  formyltetrahydrofolate deformylase  43.86 
 
 		 274 aa  238  6.999999999999999e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.245806  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4447  formyltetrahydrofolate deformylase  41.2 
 
 		 283 aa  238  8e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000794151  decreased coverage  0.00000544491 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  39.79 
 
 		 283 aa  238  8e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30021  formyltetrahydrofolate deformylase  42.65 
 
 		 296 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.53116 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  39.44 
 
 		 282 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00849533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1007  formyltetrahydrofolate deformylase  40.85 
 
 		 283 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000029138  hitchhiker  0.000000000000593821 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  40.85 
 
 		 286 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1381  formyltetrahydrofolate deformylase  43.01 
 
 		 280 aa  238  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0534896  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01208  formyltetrahydrofolate deformylase  43.01 
 
 		 280 aa  237  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.673887  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2417  formyltetrahydrofolate deformylase  43.01 
 
 		 280 aa  237  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000875082  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1367  formyltetrahydrofolate deformylase  40.85 
 
 		 283 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0129513  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1340  formyltetrahydrofolate deformylase  43.01 
 
 		 280 aa  237  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00174787  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01218  hypothetical protein  43.01 
 
 		 280 aa  237  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534807  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4356  formyltetrahydrofolate deformylase  40.85 
 
 		 283 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805788  normal  0.0308915 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1909  formyltetrahydrofolate deformylase  43.01 
 
 		 280 aa  237  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0165731  normal  0.142161 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2395  formyltetrahydrofolate deformylase  43.01 
 
 		 280 aa  237  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000016766 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1987  formyltetrahydrofolate deformylase  42.96 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1397  formyltetrahydrofolate deformylase  43.01 
 
 		 280 aa  237  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  40.28 
 
 		 287 aa  236  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1717  formyltetrahydrofolate deformylase  42.66 
 
 		 280 aa  236  3e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0183504  normal  0.737156 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2482  formyltetrahydrofolate deformylase  41.64 
 
 		 292 aa  236  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4036  formyltetrahydrofolate deformylase  41.64 
 
 		 292 aa  236  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2603  formyltetrahydrofolate deformylase  41.55 
 
 		 294 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1220  formyltetrahydrofolate deformylase  43.51 
 
 		 274 aa  235  6e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1512  formyltetrahydrofolate deformylase  43.31 
 
 		 280 aa  235  7e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000338325  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  39.78 
 
 		 282 aa  235  8e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2122  formyltetrahydrofolate deformylase  40.14 
 
 		 297 aa  235  8e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.479975  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0944  formyltetrahydrofolate deformylase  42.25 
 
 		 294 aa  234  9e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1943  formyltetrahydrofolate deformylase  43.06 
 
 		 286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000066655 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0881  formyltetrahydrofolate deformylase  43.51 
 
 		 274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0056  formyltetrahydrofolate deformylase  43.46 
 
 		 289 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.333172  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1145  formyltetrahydrofolate deformylase  41.2 
 
 		 287 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.857181  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3717  formyltetrahydrofolate deformylase  40.71 
 
 		 309 aa  233  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2311  formyltetrahydrofolate deformylase  41.75 
 
 		 280 aa  234  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6765  formyltetrahydrofolate deformylase  39.93 
 
 		 291 aa  233  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1883  formyltetrahydrofolate deformylase  42.31 
 
 		 280 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.26854 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1889  formyltetrahydrofolate deformylase  42.31 
 
 		 280 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.291619 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1946  formyltetrahydrofolate deformylase  42.31 
 
 		 280 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1572  formyltetrahydrofolate deformylase  42.31 
 
 		 280 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>