More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01208 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01208  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 280 aa  577  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.673887  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1909  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 280 aa  577  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0165731  normal  0.142161 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1340  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 280 aa  577  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00174787  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01218  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  577  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534807  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2395  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 280 aa  577  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000016766 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2417  formyltetrahydrofolate deformylase  99.64 
 
 		 280 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000875082  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1381  formyltetrahydrofolate deformylase  99.64 
 
 		 280 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0534896  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1717  formyltetrahydrofolate deformylase  99.64 
 
 		 280 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0183504  normal  0.737156 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1397  formyltetrahydrofolate deformylase  99.29 
 
 		 280 aa  574  1.0000000000000001e-163  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1883  formyltetrahydrofolate deformylase  96.43 
 
 		 280 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.26854 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1889  formyltetrahydrofolate deformylase  96.43 
 
 		 280 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.291619 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1572  formyltetrahydrofolate deformylase  96.43 
 
 		 280 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1389  formyltetrahydrofolate deformylase  96.07 
 
 		 280 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.336408  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1946  formyltetrahydrofolate deformylase  96.43 
 
 		 280 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2311  formyltetrahydrofolate deformylase  92.86 
 
 		 280 aa  542  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1976  formyltetrahydrofolate deformylase  88.53 
 
 		 282 aa  521  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2277  formyltetrahydrofolate deformylase  88.17 
 
 		 282 aa  519  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.262231  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2713  formyltetrahydrofolate deformylase  88.49 
 
 		 282 aa  518  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.775319  hitchhiker  0.00024588 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2204  formyltetrahydrofolate deformylase  88.13 
 
 		 283 aa  519  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1962  formyltetrahydrofolate deformylase  89.21 
 
 		 282 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2334  formyltetrahydrofolate deformylase  84.95 
 
 		 282 aa  501  1e-141  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000680969  normal  0.0350893 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2080  formyltetrahydrofolate deformylase  84.95 
 
 		 282 aa  501  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0789639  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1971  formyltetrahydrofolate deformylase  84.59 
 
 		 282 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0499985  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0786  formyltetrahydrofolate deformylase  73.29 
 
 		 278 aa  429  1e-119  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1577  formyltetrahydrofolate deformylase  72.56 
 
 		 277 aa  424  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.200981  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1102  formyltetrahydrofolate deformylase  70.04 
 
 		 278 aa  427  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.198189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0912  formyltetrahydrofolate deformylase  70.04 
 
 		 277 aa  419  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01373  formyltetrahydrofolate deformylase  70.4 
 
 		 277 aa  412  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004096  formyltetrahydrofolate deformylase  69.68 
 
 		 277 aa  408  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0262931  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1445  formyltetrahydrofolate deformylase  68.35 
 
 		 288 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1476  formyltetrahydrofolate deformylase  68.35 
 
 		 288 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2907  formyltetrahydrofolate deformylase  68.35 
 
 		 291 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.520596 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1440  formyltetrahydrofolate deformylase  68.35 
 
 		 288 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3166  formyltetrahydrofolate deformylase  66.06 
 
 		 277 aa  402  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2647  formyltetrahydrofolate deformylase  68.35 
 
 		 300 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2714  formyltetrahydrofolate deformylase  68.35 
 
 		 300 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2821  formyltetrahydrofolate deformylase  68.35 
 
 		 300 aa  402  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1343  formyltetrahydrofolate deformylase  67.15 
 
 		 316 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1265  formyltetrahydrofolate deformylase  66.19 
 
 		 290 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90141  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1134  formyltetrahydrofolate deformylase  68 
 
 		 281 aa  397  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.409656  normal  0.540867 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1624  formyltetrahydrofolate deformylase  68.52 
 
 		 271 aa  391  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3286  formyltetrahydrofolate deformylase  64.98 
 
 		 277 aa  394  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647235  hitchhiker  0.00001604 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1549  formyltetrahydrofolate deformylase  66.18 
 
 		 285 aa  390  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2640  formyltetrahydrofolate deformylase  64.62 
 
 		 277 aa  374  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.200065  normal  0.516834 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1370  formyltetrahydrofolate deformylase  55.04 
 
 		 317 aa  323  1e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1249  formyltetrahydrofolate deformylase  53.05 
 
 		 279 aa  315  4e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3669  formyltetrahydrofolate deformylase  56.55 
 
 		 269 aa  308  4e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0400805  normal  0.143987 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1512  formyltetrahydrofolate deformylase  52.75 
 
 		 280 aa  308  6.999999999999999e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000338325  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5699  formyltetrahydrofolate deformylase  50.16 
 
 		 306 aa  307  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.657774 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1008  tRNA nucleotidyltransferase/formyltetrahydrofolate deformylase  50.54 
 
 		 644 aa  304  1.0000000000000001e-81  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00246463  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0822  formyltetrahydrofolate deformylase  53.48 
 
 		 276 aa  303  2.0000000000000002e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.837326  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0811  formyltetrahydrofolate deformylase  52.38 
 
 		 274 aa  301  8.000000000000001e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.245806  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0881  formyltetrahydrofolate deformylase  52.38 
 
 		 274 aa  300  2e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1220  formyltetrahydrofolate deformylase  50.55 
 
 		 274 aa  294  1e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3078  formyltetrahydrofolate deformylase  51.49 
 
 		 274 aa  292  3e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3999  formyltetrahydrofolate deformylase  50.19 
 
 		 274 aa  291  9e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1098  formyltetrahydrofolate deformylase  51.69 
 
 		 278 aa  284  9e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.13372  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  45.74 
 
 		 300 aa  243  3e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  47.25 
 
 		 284 aa  239  4e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  44.69 
 
 		 288 aa  238  5.999999999999999e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  44.88 
 
 		 300 aa  237  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0056  formyltetrahydrofolate deformylase  44.64 
 
 		 289 aa  235  7e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.333172  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1352  formyltetrahydrofolate deformylase  42.39 
 
 		 282 aa  234  8e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782528  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  43.32 
 
 		 284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  45.68 
 
 		 284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  45.68 
 
 		 284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  46.18 
 
 		 283 aa  233  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02600  formyltetrahydrofolate deformylase  45.45 
 
 		 292 aa  232  4.0000000000000004e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.304695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  43.21 
 
 		 287 aa  232  5e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  42.81 
 
 		 285 aa  230  2e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  40.43 
 
 		 284 aa  230  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0411  formyltetrahydrofolate deformylase  40.97 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.789305  normal  0.762078 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  41.32 
 
 		 284 aa  229  3e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2603  formyltetrahydrofolate deformylase  41.05 
 
 		 294 aa  229  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0944  formyltetrahydrofolate deformylase  41.05 
 
 		 294 aa  228  6e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1023  formyltetrahydrofolate deformylase  43.01 
 
 		 284 aa  228  6e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.124115  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1052  formyltetrahydrofolate deformylase  44.29 
 
 		 284 aa  228  6e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000281715  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  43.59 
 
 		 287 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  41.96 
 
 		 284 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  42.96 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0584  formyltetrahydrofolate deformylase  40.69 
 
 		 291 aa  227  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0786  formyltetrahydrofolate deformylase  42.61 
 
 		 316 aa  227  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  42.81 
 
 		 296 aa  226  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5913  formyltetrahydrofolate deformylase  42.01 
 
 		 296 aa  226  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  42.96 
 
 		 283 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4314  formyltetrahydrofolate deformylase  42.24 
 
 		 283 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000262425  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  42.12 
 
 		 282 aa  226  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00849533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4018  formyltetrahydrofolate deformylase  42.24 
 
 		 283 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0329939  normal  0.0297352 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3654  formyltetrahydrofolate deformylase  44.64 
 
 		 290 aa  225  5.0000000000000005e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  43.9 
 
 		 286 aa  225  7e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  40.65 
 
 		 283 aa  224  8e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3590  formyltetrahydrofolate deformylase  42.45 
 
 		 298 aa  224  9e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  45.05 
 
 		 284 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  43.57 
 
 		 289 aa  224  1e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1237  formyltetrahydrofolate deformylase  43.21 
 
 		 284 aa  223  2e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144683  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1192  formyltetrahydrofolate deformylase  40.5 
 
 		 283 aa  224  2e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5200  formyltetrahydrofolate deformylase  43.27 
 
 		 281 aa  223  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6765  formyltetrahydrofolate deformylase  43.4 
 
 		 291 aa  223  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4234  formyltetrahydrofolate deformylase  42.86 
 
 		 284 aa  222  4e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.761125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  38.6 
 
 		 284 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>