More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3286 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3286  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 277 aa  568  1e-161  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647235  hitchhiker  0.00001604 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3166  formyltetrahydrofolate deformylase  86.64 
 
 		 277 aa  510  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2907  formyltetrahydrofolate deformylase  75.45 
 
 		 291 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.520596 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1476  formyltetrahydrofolate deformylase  75.45 
 
 		 288 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1440  formyltetrahydrofolate deformylase  75.45 
 
 		 288 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2647  formyltetrahydrofolate deformylase  75.45 
 
 		 300 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2714  formyltetrahydrofolate deformylase  75.45 
 
 		 300 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1445  formyltetrahydrofolate deformylase  75.45 
 
 		 288 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2821  formyltetrahydrofolate deformylase  75.45 
 
 		 300 aa  457  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1265  formyltetrahydrofolate deformylase  76.53 
 
 		 290 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90141  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1343  formyltetrahydrofolate deformylase  74.37 
 
 		 316 aa  449  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2640  formyltetrahydrofolate deformylase  80.14 
 
 		 277 aa  447  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.200065  normal  0.516834 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1549  formyltetrahydrofolate deformylase  75.27 
 
 		 285 aa  448  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1624  formyltetrahydrofolate deformylase  75.65 
 
 		 271 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1134  formyltetrahydrofolate deformylase  73.19 
 
 		 281 aa  429  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.409656  normal  0.540867 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01373  formyltetrahydrofolate deformylase  67.87 
 
 		 277 aa  412  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1577  formyltetrahydrofolate deformylase  68.59 
 
 		 277 aa  411  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.200981  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004096  formyltetrahydrofolate deformylase  67.51 
 
 		 277 aa  408  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0262931  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0912  formyltetrahydrofolate deformylase  66.79 
 
 		 277 aa  405  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1102  formyltetrahydrofolate deformylase  67.87 
 
 		 278 aa  404  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.198189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2204  formyltetrahydrofolate deformylase  63.9 
 
 		 283 aa  398  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2713  formyltetrahydrofolate deformylase  64.98 
 
 		 282 aa  397  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.775319  hitchhiker  0.00024588 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1976  formyltetrahydrofolate deformylase  64.62 
 
 		 282 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2277  formyltetrahydrofolate deformylase  64.26 
 
 		 282 aa  398  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.262231  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2417  formyltetrahydrofolate deformylase  65.34 
 
 		 280 aa  395  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000875082  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2080  formyltetrahydrofolate deformylase  64.62 
 
 		 282 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0789639  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1971  formyltetrahydrofolate deformylase  64.62 
 
 		 282 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0499985  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1717  formyltetrahydrofolate deformylase  64.98 
 
 		 280 aa  394  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0183504  normal  0.737156 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2334  formyltetrahydrofolate deformylase  64.62 
 
 		 282 aa  396  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000680969  normal  0.0350893 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01208  formyltetrahydrofolate deformylase  64.98 
 
 		 280 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.673887  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1909  formyltetrahydrofolate deformylase  64.98 
 
 		 280 aa  394  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0165731  normal  0.142161 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1381  formyltetrahydrofolate deformylase  64.62 
 
 		 280 aa  392  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0534896  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1397  formyltetrahydrofolate deformylase  64.62 
 
 		 280 aa  392  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01218  hypothetical protein  64.98 
 
 		 280 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534807  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1340  formyltetrahydrofolate deformylase  64.98 
 
 		 280 aa  394  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00174787  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1962  formyltetrahydrofolate deformylase  63.9 
 
 		 282 aa  392  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0786  formyltetrahydrofolate deformylase  65.34 
 
 		 278 aa  392  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2395  formyltetrahydrofolate deformylase  64.98 
 
 		 280 aa  394  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000016766 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1889  formyltetrahydrofolate deformylase  63.9 
 
 		 280 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.291619 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1572  formyltetrahydrofolate deformylase  63.9 
 
 		 280 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1883  formyltetrahydrofolate deformylase  63.9 
 
 		 280 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.26854 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1389  formyltetrahydrofolate deformylase  63.54 
 
 		 280 aa  387  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.336408  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1946  formyltetrahydrofolate deformylase  63.9 
 
 		 280 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2311  formyltetrahydrofolate deformylase  63.18 
 
 		 280 aa  386  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1512  formyltetrahydrofolate deformylase  58.61 
 
 		 280 aa  328  6e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000338325  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3078  formyltetrahydrofolate deformylase  55.68 
 
 		 274 aa  325  5e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1008  tRNA nucleotidyltransferase/formyltetrahydrofolate deformylase  54.51 
 
 		 644 aa  320  1.9999999999999998e-86  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00246463  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5699  formyltetrahydrofolate deformylase  51.49 
 
 		 306 aa  316  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.657774 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3669  formyltetrahydrofolate deformylase  55.39 
 
 		 269 aa  311  6.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0400805  normal  0.143987 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1370  formyltetrahydrofolate deformylase  51.99 
 
 		 317 aa  303  1.0000000000000001e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0811  formyltetrahydrofolate deformylase  53.38 
 
 		 274 aa  300  1e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.245806  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0881  formyltetrahydrofolate deformylase  53.38 
 
 		 274 aa  300  2e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1249  formyltetrahydrofolate deformylase  50.9 
 
 		 279 aa  297  1e-79  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1220  formyltetrahydrofolate deformylase  51.67 
 
 		 274 aa  295  6e-79  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0822  formyltetrahydrofolate deformylase  52.38 
 
 		 276 aa  293  1e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.837326  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3999  formyltetrahydrofolate deformylase  48.72 
 
 		 274 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1098  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 		 278 aa  286  2e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.13372  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  42.2 
 
 		 300 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  43.51 
 
 		 284 aa  229  3e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0638  formyltetrahydrofolate deformylase  40.5 
 
 		 287 aa  228  6e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0692  formyltetrahydrofolate deformylase  42.65 
 
 		 288 aa  228  8e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  39.64 
 
 		 284 aa  226  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  42.7 
 
 		 289 aa  226  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0786  formyltetrahydrofolate deformylase  40.85 
 
 		 316 aa  226  4e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  41.49 
 
 		 309 aa  225  7e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00390951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  41.4 
 
 		 284 aa  224  9e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  42.35 
 
 		 289 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  44.09 
 
 		 284 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2199  formyltetrahydrofolate deformylase  41.58 
 
 		 288 aa  224  2e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  43.17 
 
 		 284 aa  223  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  40.07 
 
 		 288 aa  223  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  39.58 
 
 		 283 aa  223  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1237  formyltetrahydrofolate deformylase  42.11 
 
 		 284 aa  223  3e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144683  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  41.55 
 
 		 287 aa  223  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  39.86 
 
 		 300 aa  223  4e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  41.79 
 
 		 287 aa  221  8e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  39.3 
 
 		 289 aa  221  9.999999999999999e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  42.6 
 
 		 283 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  40.57 
 
 		 285 aa  221  9.999999999999999e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  39.72 
 
 		 282 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0534  formyltetrahydrofolate deformylase  41.26 
 
 		 294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  40 
 
 		 287 aa  219  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  40.78 
 
 		 287 aa  219  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1192  formyltetrahydrofolate deformylase  39.07 
 
 		 283 aa  219  5e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1488  formyltetrahydrofolate deformylase  42.76 
 
 		 296 aa  218  8.999999999999998e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.973322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1668  formyltetrahydrofolate deformylase  40.36 
 
 		 292 aa  218  1e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000107141  normal  0.242712 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2971  formyltetrahydrofolate deformylase  39.15 
 
 		 294 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.266607 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0944  formyltetrahydrofolate deformylase  39.72 
 
 		 294 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2167  formyltetrahydrofolate deformylase  41.26 
 
 		 294 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2603  formyltetrahydrofolate deformylase  39.72 
 
 		 294 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  39.72 
 
 		 289 aa  217  1e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2781  formyltetrahydrofolate deformylase  41.26 
 
 		 294 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  40.7 
 
 		 284 aa  217  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  40.85 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  38.57 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1837  formyltetrahydrofolate deformylase  40.71 
 
 		 290 aa  216  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.78955 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  40.85 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  40.28 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2613  formyltetrahydrofolate deformylase  39.5 
 
 		 294 aa  216  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4904  formyltetrahydrofolate deformylase  39.5 
 
 		 294 aa  216  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>