More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1134 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1134  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 281 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.409656  normal  0.540867 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1440  formyltetrahydrofolate deformylase  77.42 
 
 		 288 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1445  formyltetrahydrofolate deformylase  77.42 
 
 		 288 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1476  formyltetrahydrofolate deformylase  77.42 
 
 		 288 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2907  formyltetrahydrofolate deformylase  77.42 
 
 		 291 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.520596 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2647  formyltetrahydrofolate deformylase  77.5 
 
 		 300 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2714  formyltetrahydrofolate deformylase  77.5 
 
 		 300 aa  450  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2821  formyltetrahydrofolate deformylase  77.5 
 
 		 300 aa  448  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1343  formyltetrahydrofolate deformylase  77.9 
 
 		 316 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1549  formyltetrahydrofolate deformylase  75.89 
 
 		 285 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3166  formyltetrahydrofolate deformylase  75.36 
 
 		 277 aa  443  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1624  formyltetrahydrofolate deformylase  77.86 
 
 		 271 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1265  formyltetrahydrofolate deformylase  74.55 
 
 		 290 aa  433  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90141  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2640  formyltetrahydrofolate deformylase  76.45 
 
 		 277 aa  428  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.200065  normal  0.516834 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3286  formyltetrahydrofolate deformylase  73.19 
 
 		 277 aa  429  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647235  hitchhiker  0.00001604 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01208  formyltetrahydrofolate deformylase  68 
 
 		 280 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.673887  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2417  formyltetrahydrofolate deformylase  68 
 
 		 280 aa  397  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000875082  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1909  formyltetrahydrofolate deformylase  68 
 
 		 280 aa  397  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0165731  normal  0.142161 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1717  formyltetrahydrofolate deformylase  67.64 
 
 		 280 aa  396  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0183504  normal  0.737156 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2395  formyltetrahydrofolate deformylase  68 
 
 		 280 aa  397  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000016766 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1397  formyltetrahydrofolate deformylase  67.64 
 
 		 280 aa  395  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01218  hypothetical protein  68 
 
 		 280 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534807  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1381  formyltetrahydrofolate deformylase  67.64 
 
 		 280 aa  395  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0534896  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1340  formyltetrahydrofolate deformylase  68 
 
 		 280 aa  397  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00174787  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1946  formyltetrahydrofolate deformylase  66.07 
 
 		 280 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1883  formyltetrahydrofolate deformylase  66.07 
 
 		 280 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.26854 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1889  formyltetrahydrofolate deformylase  66.07 
 
 		 280 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.291619 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1572  formyltetrahydrofolate deformylase  66.07 
 
 		 280 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1389  formyltetrahydrofolate deformylase  65.71 
 
 		 280 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.336408  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1976  formyltetrahydrofolate deformylase  66.67 
 
 		 282 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2277  formyltetrahydrofolate deformylase  66.31 
 
 		 282 aa  389  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.262231  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2311  formyltetrahydrofolate deformylase  65.36 
 
 		 280 aa  388  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2204  formyltetrahydrofolate deformylase  65.95 
 
 		 283 aa  389  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1577  formyltetrahydrofolate deformylase  68.12 
 
 		 277 aa  387  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.200981  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1102  formyltetrahydrofolate deformylase  65.58 
 
 		 278 aa  390  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.198189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1971  formyltetrahydrofolate deformylase  65.23 
 
 		 282 aa  384  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0499985  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2713  formyltetrahydrofolate deformylase  66.67 
 
 		 282 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.775319  hitchhiker  0.00024588 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2334  formyltetrahydrofolate deformylase  65.59 
 
 		 282 aa  385  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000680969  normal  0.0350893 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2080  formyltetrahydrofolate deformylase  65.59 
 
 		 282 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0789639  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01373  formyltetrahydrofolate deformylase  65.58 
 
 		 277 aa  384  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1962  formyltetrahydrofolate deformylase  65.25 
 
 		 282 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0912  formyltetrahydrofolate deformylase  63.41 
 
 		 277 aa  379  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004096  formyltetrahydrofolate deformylase  64.49 
 
 		 277 aa  379  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0262931  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0786  formyltetrahydrofolate deformylase  64.49 
 
 		 278 aa  376  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3078  formyltetrahydrofolate deformylase  59.34 
 
 		 274 aa  331  9e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5699  formyltetrahydrofolate deformylase  55.78 
 
 		 306 aa  330  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.657774 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1512  formyltetrahydrofolate deformylase  57.88 
 
 		 280 aa  329  3e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000338325  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1370  formyltetrahydrofolate deformylase  55.07 
 
 		 317 aa  316  3e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3669  formyltetrahydrofolate deformylase  57.25 
 
 		 269 aa  315  5e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0400805  normal  0.143987 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1008  tRNA nucleotidyltransferase/formyltetrahydrofolate deformylase  53.41 
 
 		 644 aa  314  9.999999999999999e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00246463  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0822  formyltetrahydrofolate deformylase  55.31 
 
 		 276 aa  309  4e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.837326  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1249  formyltetrahydrofolate deformylase  53.07 
 
 		 279 aa  305  8.000000000000001e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0811  formyltetrahydrofolate deformylase  53.11 
 
 		 274 aa  299  4e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.245806  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1098  formyltetrahydrofolate deformylase  53.24 
 
 		 278 aa  298  5e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.13372  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0881  formyltetrahydrofolate deformylase  53.11 
 
 		 274 aa  298  6e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1220  formyltetrahydrofolate deformylase  52.04 
 
 		 274 aa  293  3e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3999  formyltetrahydrofolate deformylase  50.73 
 
 		 274 aa  286  4e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  45.83 
 
 		 286 aa  237  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  46.04 
 
 		 284 aa  236  4e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1837  formyltetrahydrofolate deformylase  44.64 
 
 		 290 aa  230  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.78955 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  41.11 
 
 		 300 aa  229  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  43.77 
 
 		 289 aa  229  4e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  43.82 
 
 		 284 aa  228  6e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6765  formyltetrahydrofolate deformylase  42.96 
 
 		 291 aa  226  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0692  formyltetrahydrofolate deformylase  41.52 
 
 		 288 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  44.68 
 
 		 286 aa  225  6e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  45.71 
 
 		 283 aa  224  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  42.41 
 
 		 287 aa  223  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  43.06 
 
 		 285 aa  224  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  41.67 
 
 		 288 aa  224  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  42.61 
 
 		 287 aa  223  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  42.14 
 
 		 300 aa  223  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  44.64 
 
 		 286 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2199  formyltetrahydrofolate deformylase  40.42 
 
 		 288 aa  223  3e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  44.64 
 
 		 286 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1943  formyltetrahydrofolate deformylase  41.81 
 
 		 286 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000066655 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0786  formyltetrahydrofolate deformylase  42.12 
 
 		 316 aa  222  6e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  42.2 
 
 		 287 aa  221  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  43.01 
 
 		 284 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  43.01 
 
 		 284 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2419  formyltetrahydrofolate deformylase  43.21 
 
 		 287 aa  221  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02600  formyltetrahydrofolate deformylase  43.31 
 
 		 292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.304695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0414  formyltetrahydrofolate deformylase  42.47 
 
 		 294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175619 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  44.6 
 
 		 299 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1114  formyltetrahydrofolate deformylase  41.99 
 
 		 286 aa  219  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.851375  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  41.13 
 
 		 283 aa  219  3e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  41.09 
 
 		 284 aa  219  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  41.58 
 
 		 284 aa  217  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0056  formyltetrahydrofolate deformylase  42.91 
 
 		 289 aa  217  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.333172  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4314  formyltetrahydrofolate deformylase  41.52 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000262425  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0638  formyltetrahydrofolate deformylase  40.77 
 
 		 287 aa  217  2e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4018  formyltetrahydrofolate deformylase  41.52 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0329939  normal  0.0297352 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  41.16 
 
 		 284 aa  217  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  41.4 
 
 		 289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  41.52 
 
 		 283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  42.45 
 
 		 287 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  41.52 
 
 		 283 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  42.29 
 
 		 289 aa  215  5.9999999999999996e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1668  formyltetrahydrofolate deformylase  40.97 
 
 		 292 aa  215  7e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000107141  normal  0.242712 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0411  formyltetrahydrofolate deformylase  40.28 
 
 		 295 aa  214  9e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.789305  normal  0.762078 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>