More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0822 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0822  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 
276 aa  566  1e-160  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.837326  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1370  formyltetrahydrofolate deformylase  68.98 
 
 
317 aa  395  1e-109  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1512  formyltetrahydrofolate deformylase  65.09 
 
 
280 aa  379  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000338325  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1249  formyltetrahydrofolate deformylase  66.67 
 
 
279 aa  374  1e-102  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1008  tRNA nucleotidyltransferase/formyltetrahydrofolate deformylase  63.5 
 
 
644 aa  358  4e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00246463  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0811  formyltetrahydrofolate deformylase  60.87 
 
 
274 aa  343  2e-93  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.245806  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0881  formyltetrahydrofolate deformylase  60.87 
 
 
274 aa  342  2.9999999999999997e-93  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1220  formyltetrahydrofolate deformylase  59.57 
 
 
274 aa  338  7e-92  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1098  formyltetrahydrofolate deformylase  55.27 
 
 
278 aa  315  4e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.13372  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2204  formyltetrahydrofolate deformylase  54.21 
 
 
283 aa  310  1e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2277  formyltetrahydrofolate deformylase  53.85 
 
 
282 aa  309  4e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.262231  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1976  formyltetrahydrofolate deformylase  53.85 
 
 
282 aa  308  4e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1134  formyltetrahydrofolate deformylase  55.31 
 
 
281 aa  309  4e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.409656  normal  0.540867 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2647  formyltetrahydrofolate deformylase  54.95 
 
 
300 aa  308  5e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2714  formyltetrahydrofolate deformylase  54.95 
 
 
300 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2821  formyltetrahydrofolate deformylase  54.95 
 
 
300 aa  308  8e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1962  formyltetrahydrofolate deformylase  53.48 
 
 
282 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3166  formyltetrahydrofolate deformylase  53.85 
 
 
277 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1476  formyltetrahydrofolate deformylase  54.58 
 
 
288 aa  305  6e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1440  formyltetrahydrofolate deformylase  54.58 
 
 
288 aa  305  6e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1445  formyltetrahydrofolate deformylase  54.58 
 
 
288 aa  304  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2713  formyltetrahydrofolate deformylase  52.75 
 
 
282 aa  304  9.000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.775319  hitchhiker  0.00024588 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1717  formyltetrahydrofolate deformylase  53.48 
 
 
280 aa  303  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0183504  normal  0.737156 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2907  formyltetrahydrofolate deformylase  54.58 
 
 
291 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.520596 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2311  formyltetrahydrofolate deformylase  53.48 
 
 
280 aa  303  1.0000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01208  formyltetrahydrofolate deformylase  53.48 
 
 
280 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.673887  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1909  formyltetrahydrofolate deformylase  53.48 
 
 
280 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0165731  normal  0.142161 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01218  hypothetical protein  53.48 
 
 
280 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534807  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1343  formyltetrahydrofolate deformylase  54.21 
 
 
316 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2395  formyltetrahydrofolate deformylase  53.48 
 
 
280 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000016766 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1340  formyltetrahydrofolate deformylase  53.48 
 
 
280 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00174787  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2417  formyltetrahydrofolate deformylase  53.11 
 
 
280 aa  302  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000875082  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1397  formyltetrahydrofolate deformylase  53.48 
 
 
280 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1381  formyltetrahydrofolate deformylase  53.48 
 
 
280 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0534896  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1624  formyltetrahydrofolate deformylase  53.9 
 
 
271 aa  301  6.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1946  formyltetrahydrofolate deformylase  52.75 
 
 
280 aa  301  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1889  formyltetrahydrofolate deformylase  52.75 
 
 
280 aa  301  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.291619 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1572  formyltetrahydrofolate deformylase  52.75 
 
 
280 aa  301  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1883  formyltetrahydrofolate deformylase  52.75 
 
 
280 aa  301  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.26854 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1389  formyltetrahydrofolate deformylase  52.38 
 
 
280 aa  299  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.336408  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0912  formyltetrahydrofolate deformylase  55.31 
 
 
277 aa  299  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1265  formyltetrahydrofolate deformylase  53.11 
 
 
290 aa  298  5e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90141  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1971  formyltetrahydrofolate deformylase  51.65 
 
 
282 aa  296  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0499985  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2334  formyltetrahydrofolate deformylase  51.65 
 
 
282 aa  296  2e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000680969  normal  0.0350893 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2080  formyltetrahydrofolate deformylase  51.65 
 
 
282 aa  296  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0789639  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1549  formyltetrahydrofolate deformylase  54.58 
 
 
285 aa  296  2e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1102  formyltetrahydrofolate deformylase  54.04 
 
 
278 aa  296  3e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.198189  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1577  formyltetrahydrofolate deformylase  53.73 
 
 
277 aa  295  5e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.200981  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3286  formyltetrahydrofolate deformylase  52.38 
 
 
277 aa  293  1e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647235  hitchhiker  0.00001604 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3078  formyltetrahydrofolate deformylase  52.38 
 
 
274 aa  293  2e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3669  formyltetrahydrofolate deformylase  51.48 
 
 
269 aa  292  5e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0400805  normal  0.143987 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01373  formyltetrahydrofolate deformylase  53.73 
 
 
277 aa  291  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0786  formyltetrahydrofolate deformylase  50.55 
 
 
278 aa  291  1e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004096  formyltetrahydrofolate deformylase  53.36 
 
 
277 aa  289  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0262931  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2640  formyltetrahydrofolate deformylase  51.65 
 
 
277 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.200065  normal  0.516834 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5699  formyltetrahydrofolate deformylase  46.84 
 
 
306 aa  276  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.657774 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3999  formyltetrahydrofolate deformylase  47.99 
 
 
274 aa  266  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  42.29 
 
 
284 aa  227  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1192  formyltetrahydrofolate deformylase  39.43 
 
 
283 aa  226  2e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0638  formyltetrahydrofolate deformylase  39.93 
 
 
287 aa  225  6e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1100  formyltetrahydrofolate deformylase  39.78 
 
 
283 aa  225  7e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.862849  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0692  formyltetrahydrofolate deformylase  39.93 
 
 
288 aa  224  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  41.99 
 
 
285 aa  224  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  42.91 
 
 
283 aa  223  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  40.36 
 
 
287 aa  222  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  42.81 
 
 
284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  39.49 
 
 
282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  40.71 
 
 
287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  38.63 
 
 
284 aa  219  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2199  formyltetrahydrofolate deformylase  40.29 
 
 
288 aa  219  3e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  41.58 
 
 
300 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  41.58 
 
 
287 aa  218  8.999999999999998e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  38.93 
 
 
283 aa  216  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  39.86 
 
 
289 aa  217  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  40.79 
 
 
300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  41.37 
 
 
284 aa  216  4e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  43.06 
 
 
286 aa  216  4e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1943  formyltetrahydrofolate deformylase  40.14 
 
 
286 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000066655 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  41.22 
 
 
309 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00390951  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1837  formyltetrahydrofolate deformylase  39.79 
 
 
290 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.78955 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  36.81 
 
 
289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1977  formyltetrahydrofolate deformylase  38.49 
 
 
284 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0486  formyltetrahydrofolate deformylase  39.35 
 
 
284 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2425  formyltetrahydrofolate deformylase  40.5 
 
 
284 aa  213  2.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  41.43 
 
 
283 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  38.06 
 
 
287 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1668  formyltetrahydrofolate deformylase  37.68 
 
 
292 aa  212  4.9999999999999996e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000107141  normal  0.242712 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  42.5 
 
 
283 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  40.28 
 
 
284 aa  211  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  40.28 
 
 
284 aa  211  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  41.43 
 
 
284 aa  211  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4234  formyltetrahydrofolate deformylase  38.71 
 
 
284 aa  210  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.761125  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0411  formyltetrahydrofolate deformylase  38.75 
 
 
295 aa  209  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.789305  normal  0.762078 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  38.21 
 
 
288 aa  208  7e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02600  formyltetrahydrofolate deformylase  38.3 
 
 
292 aa  208  8e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.304695  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  39.93 
 
 
289 aa  208  8e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0584  formyltetrahydrofolate deformylase  40.7 
 
 
291 aa  207  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1237  formyltetrahydrofolate deformylase  39.72 
 
 
284 aa  207  2e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144683  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0056  formyltetrahydrofolate deformylase  41.2 
 
 
289 aa  207  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.333172  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1052  formyltetrahydrofolate deformylase  39.86 
 
 
284 aa  207  2e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000281715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>