More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1577 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1577  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 
277 aa  573  1.0000000000000001e-162  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.200981  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01373  formyltetrahydrofolate deformylase  90.25 
 
 
277 aa  522  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004096  formyltetrahydrofolate deformylase  88.81 
 
 
277 aa  517  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0262931  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0912  formyltetrahydrofolate deformylase  75.09 
 
 
277 aa  447  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2334  formyltetrahydrofolate deformylase  73.65 
 
 
282 aa  432  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000680969  normal  0.0350893 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2080  formyltetrahydrofolate deformylase  73.65 
 
 
282 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0789639  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1971  formyltetrahydrofolate deformylase  73.65 
 
 
282 aa  433  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0499985  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1976  formyltetrahydrofolate deformylase  72.2 
 
 
282 aa  430  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2277  formyltetrahydrofolate deformylase  71.84 
 
 
282 aa  429  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.262231  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01208  formyltetrahydrofolate deformylase  72.56 
 
 
280 aa  424  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.673887  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1717  formyltetrahydrofolate deformylase  72.56 
 
 
280 aa  424  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0183504  normal  0.737156 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2395  formyltetrahydrofolate deformylase  72.56 
 
 
280 aa  424  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000016766 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2713  formyltetrahydrofolate deformylase  72.56 
 
 
282 aa  424  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.775319  hitchhiker  0.00024588 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01218  hypothetical protein  72.56 
 
 
280 aa  424  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534807  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1909  formyltetrahydrofolate deformylase  72.56 
 
 
280 aa  424  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0165731  normal  0.142161 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1340  formyltetrahydrofolate deformylase  72.56 
 
 
280 aa  424  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00174787  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1102  formyltetrahydrofolate deformylase  70.76 
 
 
278 aa  425  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.198189  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2417  formyltetrahydrofolate deformylase  72.2 
 
 
280 aa  423  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000875082  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1397  formyltetrahydrofolate deformylase  71.84 
 
 
280 aa  421  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1381  formyltetrahydrofolate deformylase  72.56 
 
 
280 aa  424  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0534896  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1962  formyltetrahydrofolate deformylase  72.2 
 
 
282 aa  423  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2204  formyltetrahydrofolate deformylase  70.4 
 
 
283 aa  419  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3166  formyltetrahydrofolate deformylase  69.68 
 
 
277 aa  418  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1883  formyltetrahydrofolate deformylase  70.4 
 
 
280 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.26854 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1946  formyltetrahydrofolate deformylase  70.4 
 
 
280 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1889  formyltetrahydrofolate deformylase  70.4 
 
 
280 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.291619 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0786  formyltetrahydrofolate deformylase  70.4 
 
 
278 aa  414  9.999999999999999e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1572  formyltetrahydrofolate deformylase  70.4 
 
 
280 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1389  formyltetrahydrofolate deformylase  70.04 
 
 
280 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.336408  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3286  formyltetrahydrofolate deformylase  68.59 
 
 
277 aa  411  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647235  hitchhiker  0.00001604 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2311  formyltetrahydrofolate deformylase  69.68 
 
 
280 aa  411  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2907  formyltetrahydrofolate deformylase  69.68 
 
 
291 aa  407  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.520596 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1440  formyltetrahydrofolate deformylase  69.68 
 
 
288 aa  407  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1476  formyltetrahydrofolate deformylase  69.68 
 
 
288 aa  407  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2647  formyltetrahydrofolate deformylase  69.68 
 
 
300 aa  408  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2821  formyltetrahydrofolate deformylase  69.68 
 
 
300 aa  407  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1445  formyltetrahydrofolate deformylase  69.68 
 
 
288 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2714  formyltetrahydrofolate deformylase  69.68 
 
 
300 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1343  formyltetrahydrofolate deformylase  68.95 
 
 
316 aa  403  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1265  formyltetrahydrofolate deformylase  68.95 
 
 
290 aa  404  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90141  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1624  formyltetrahydrofolate deformylase  70.11 
 
 
271 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1549  formyltetrahydrofolate deformylase  68.73 
 
 
285 aa  397  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2640  formyltetrahydrofolate deformylase  68.23 
 
 
277 aa  393  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.200065  normal  0.516834 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1134  formyltetrahydrofolate deformylase  68.12 
 
 
281 aa  387  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.409656  normal  0.540867 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1370  formyltetrahydrofolate deformylase  55.23 
 
 
317 aa  318  7e-86  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5699  formyltetrahydrofolate deformylase  53.47 
 
 
306 aa  317  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.657774 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1008  tRNA nucleotidyltransferase/formyltetrahydrofolate deformylase  51.99 
 
 
644 aa  314  9.999999999999999e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00246463  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3669  formyltetrahydrofolate deformylase  57.68 
 
 
269 aa  310  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0400805  normal  0.143987 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1249  formyltetrahydrofolate deformylase  51.61 
 
 
279 aa  308  5e-83  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1512  formyltetrahydrofolate deformylase  54.48 
 
 
280 aa  308  8e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000338325  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0811  formyltetrahydrofolate deformylase  53.28 
 
 
274 aa  308  9e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.245806  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0881  formyltetrahydrofolate deformylase  53.28 
 
 
274 aa  307  2.0000000000000002e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1220  formyltetrahydrofolate deformylase  51.46 
 
 
274 aa  300  2e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3078  formyltetrahydrofolate deformylase  54.41 
 
 
274 aa  299  3e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0822  formyltetrahydrofolate deformylase  53.73 
 
 
276 aa  295  5e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.837326  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3999  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
274 aa  288  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1098  formyltetrahydrofolate deformylase  49.28 
 
 
278 aa  281  7.000000000000001e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.13372  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  42.2 
 
 
300 aa  233  3e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  42.05 
 
 
300 aa  229  4e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  40.14 
 
 
284 aa  228  7e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  43.37 
 
 
286 aa  225  6e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  41.43 
 
 
289 aa  225  7e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0692  formyltetrahydrofolate deformylase  44.04 
 
 
288 aa  225  8e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4314  formyltetrahydrofolate deformylase  41.61 
 
 
283 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000262425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4018  formyltetrahydrofolate deformylase  41.61 
 
 
283 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0329939  normal  0.0297352 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1740  formyltetrahydrofolate deformylase  41.55 
 
 
286 aa  224  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  41.43 
 
 
284 aa  224  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3590  formyltetrahydrofolate deformylase  41.39 
 
 
298 aa  223  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  39.3 
 
 
296 aa  223  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  40.49 
 
 
288 aa  223  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  43.88 
 
 
284 aa  222  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  41.26 
 
 
283 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  41.26 
 
 
283 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1352  formyltetrahydrofolate deformylase  42.65 
 
 
282 aa  221  7e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782528  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1052  formyltetrahydrofolate deformylase  44.44 
 
 
284 aa  221  9e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000281715  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  41.37 
 
 
289 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  40.56 
 
 
287 aa  221  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  40.15 
 
 
284 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2613  formyltetrahydrofolate deformylase  38.89 
 
 
294 aa  221  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4904  formyltetrahydrofolate deformylase  38.89 
 
 
294 aa  221  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  39.58 
 
 
287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  41.18 
 
 
287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02600  formyltetrahydrofolate deformylase  40.91 
 
 
292 aa  219  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.304695  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  43.21 
 
 
284 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  43.21 
 
 
284 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  42.2 
 
 
285 aa  219  3e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  39.44 
 
 
289 aa  219  3.9999999999999997e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  42.24 
 
 
283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  43.53 
 
 
284 aa  219  3.9999999999999997e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2419  formyltetrahydrofolate deformylase  43.06 
 
 
287 aa  219  5e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0534  formyltetrahydrofolate deformylase  41.64 
 
 
294 aa  218  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232127  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  41.49 
 
 
299 aa  218  7e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3310  formyltetrahydrofolate deformylase  39.08 
 
 
294 aa  218  7.999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1837  formyltetrahydrofolate deformylase  41.79 
 
 
290 aa  218  7.999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.78955 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  41.13 
 
 
286 aa  218  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  41.13 
 
 
286 aa  218  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  39.72 
 
 
282 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00849533  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  38.41 
 
 
283 aa  218  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  38.79 
 
 
282 aa  217  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0056  formyltetrahydrofolate deformylase  41.07 
 
 
289 aa  217  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.333172  normal  0.573023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>