More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3078 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3078  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 274 aa  564  1e-160  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1134  formyltetrahydrofolate deformylase  59.34 
 
 		 281 aa  331  8e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.409656  normal  0.540867 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1476  formyltetrahydrofolate deformylase  59.12 
 
 		 288 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1440  formyltetrahydrofolate deformylase  59.12 
 
 		 288 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2907  formyltetrahydrofolate deformylase  59.12 
 
 		 291 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.520596 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1445  formyltetrahydrofolate deformylase  59.12 
 
 		 288 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1343  formyltetrahydrofolate deformylase  58.76 
 
 		 316 aa  328  7e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2714  formyltetrahydrofolate deformylase  58.39 
 
 		 300 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2647  formyltetrahydrofolate deformylase  58.39 
 
 		 300 aa  326  3e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2821  formyltetrahydrofolate deformylase  58.39 
 
 		 300 aa  325  3e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1624  formyltetrahydrofolate deformylase  58.82 
 
 		 271 aa  325  5e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3286  formyltetrahydrofolate deformylase  55.68 
 
 		 277 aa  325  5e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647235  hitchhiker  0.00001604 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1549  formyltetrahydrofolate deformylase  58.39 
 
 		 285 aa  322  3e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3166  formyltetrahydrofolate deformylase  56.04 
 
 		 277 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2640  formyltetrahydrofolate deformylase  56.41 
 
 		 277 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.200065  normal  0.516834 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1265  formyltetrahydrofolate deformylase  55.47 
 
 		 290 aa  310  2e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90141  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1512  formyltetrahydrofolate deformylase  51.65 
 
 		 280 aa  300  1e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000338325  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1577  formyltetrahydrofolate deformylase  54.41 
 
 		 277 aa  299  3e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.200981  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1102  formyltetrahydrofolate deformylase  53.11 
 
 		 278 aa  298  9e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.198189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3669  formyltetrahydrofolate deformylase  53.7 
 
 		 269 aa  297  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0400805  normal  0.143987 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01373  formyltetrahydrofolate deformylase  52.57 
 
 		 277 aa  296  3e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1976  formyltetrahydrofolate deformylase  52.24 
 
 		 282 aa  295  5e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3999  formyltetrahydrofolate deformylase  52.36 
 
 		 274 aa  295  7e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2277  formyltetrahydrofolate deformylase  52.24 
 
 		 282 aa  295  7e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.262231  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1962  formyltetrahydrofolate deformylase  52.99 
 
 		 282 aa  294  8e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2204  formyltetrahydrofolate deformylase  51.87 
 
 		 283 aa  294  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1370  formyltetrahydrofolate deformylase  50.55 
 
 		 317 aa  293  1e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1717  formyltetrahydrofolate deformylase  51.87 
 
 		 280 aa  293  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0183504  normal  0.737156 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0822  formyltetrahydrofolate deformylase  52.38 
 
 		 276 aa  293  2e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.837326  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01208  formyltetrahydrofolate deformylase  51.49 
 
 		 280 aa  292  3e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.673887  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1381  formyltetrahydrofolate deformylase  51.49 
 
 		 280 aa  293  3e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0534896  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1340  formyltetrahydrofolate deformylase  51.49 
 
 		 280 aa  292  3e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00174787  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2395  formyltetrahydrofolate deformylase  51.49 
 
 		 280 aa  292  3e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000016766 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01218  hypothetical protein  51.49 
 
 		 280 aa  292  3e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534807  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1909  formyltetrahydrofolate deformylase  51.49 
 
 		 280 aa  292  3e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0165731  normal  0.142161 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2713  formyltetrahydrofolate deformylase  51.87 
 
 		 282 aa  292  4e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.775319  hitchhiker  0.00024588 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1008  tRNA nucleotidyltransferase/formyltetrahydrofolate deformylase  50.92 
 
 		 644 aa  291  6e-78  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00246463  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2417  formyltetrahydrofolate deformylase  51.12 
 
 		 280 aa  291  7e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000875082  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1397  formyltetrahydrofolate deformylase  51.12 
 
 		 280 aa  291  1e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0912  formyltetrahydrofolate deformylase  51.65 
 
 		 277 aa  290  1e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1971  formyltetrahydrofolate deformylase  52.61 
 
 		 282 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0499985  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0786  formyltetrahydrofolate deformylase  51.28 
 
 		 278 aa  290  2e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1572  formyltetrahydrofolate deformylase  50.75 
 
 		 280 aa  289  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1946  formyltetrahydrofolate deformylase  50.75 
 
 		 280 aa  289  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1889  formyltetrahydrofolate deformylase  50.75 
 
 		 280 aa  289  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.291619 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2334  formyltetrahydrofolate deformylase  52.61 
 
 		 282 aa  289  3e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000680969  normal  0.0350893 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1883  formyltetrahydrofolate deformylase  50.75 
 
 		 280 aa  289  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.26854 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2080  formyltetrahydrofolate deformylase  52.61 
 
 		 282 aa  289  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0789639  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004096  formyltetrahydrofolate deformylase  51.1 
 
 		 277 aa  289  4e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0262931  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1389  formyltetrahydrofolate deformylase  50.75 
 
 		 280 aa  288  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.336408  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2311  formyltetrahydrofolate deformylase  50.37 
 
 		 280 aa  286  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1098  formyltetrahydrofolate deformylase  51.65 
 
 		 278 aa  285  7e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.13372  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5699  formyltetrahydrofolate deformylase  48.67 
 
 		 306 aa  281  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.657774 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0811  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 		 274 aa  280  1e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.245806  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0881  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 		 274 aa  277  1e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1249  formyltetrahydrofolate deformylase  49.09 
 
 		 279 aa  277  1e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1220  formyltetrahydrofolate deformylase  48.72 
 
 		 274 aa  275  7e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  41.45 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  41.01 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  41.28 
 
 		 287 aa  226  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1837  formyltetrahydrofolate deformylase  39.29 
 
 		 290 aa  226  3e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.78955 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3983  formyltetrahydrofolate deformylase  40.14 
 
 		 285 aa  223  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.523347 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0692  formyltetrahydrofolate deformylase  39.43 
 
 		 288 aa  224  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5200  formyltetrahydrofolate deformylase  38.41 
 
 		 281 aa  223  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0452  formyltetrahydrofolate deformylase  41.67 
 
 		 286 aa  223  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  40.22 
 
 		 284 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18880  formyltetrahydrofolate deformylase  40.79 
 
 		 282 aa  222  4.9999999999999996e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0052951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2873  formyltetrahydrofolate deformylase  40.07 
 
 		 282 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.571166  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3590  formyltetrahydrofolate deformylase  38.49 
 
 		 298 aa  222  6e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2613  formyltetrahydrofolate deformylase  40.22 
 
 		 294 aa  222  7e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4904  formyltetrahydrofolate deformylase  40.22 
 
 		 294 aa  222  7e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0786  formyltetrahydrofolate deformylase  40.78 
 
 		 316 aa  221  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  40.71 
 
 		 300 aa  219  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  37.77 
 
 		 282 aa  219  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  40 
 
 		 284 aa  219  3.9999999999999997e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6111  formyltetrahydrofolate deformylase  38.54 
 
 		 294 aa  219  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481987  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0534  formyltetrahydrofolate deformylase  38.19 
 
 		 294 aa  219  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2792  formyltetrahydrofolate deformylase  38.68 
 
 		 294 aa  218  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.329734 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3699  formyltetrahydrofolate deformylase  37.77 
 
 		 303 aa  218  7e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2167  formyltetrahydrofolate deformylase  38.68 
 
 		 294 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2781  formyltetrahydrofolate deformylase  38.68 
 
 		 294 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0944  formyltetrahydrofolate deformylase  37.63 
 
 		 294 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  37.94 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2862  formyltetrahydrofolate deformylase  41.46 
 
 		 284 aa  217  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.413616  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  39.22 
 
 		 289 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1188  formyltetrahydrofolate deformylase  39.27 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000131662 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  41.28 
 
 		 303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  40.86 
 
 		 283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2603  formyltetrahydrofolate deformylase  37.28 
 
 		 294 aa  215  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2376  formyltetrahydrofolate deformylase  38.79 
 
 		 293 aa  216  5e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0552536 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  40.93 
 
 		 300 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  37.76 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0411  formyltetrahydrofolate deformylase  37.02 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.789305  normal  0.762078 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  39.5 
 
 		 287 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2891  formyltetrahydrofolate deformylase  37.41 
 
 		 283 aa  214  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.954133  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2971  formyltetrahydrofolate deformylase  36.92 
 
 		 294 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.266607 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  40.07 
 
 		 284 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  38.87 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0486  formyltetrahydrofolate deformylase  38.85 
 
 		 284 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2236  formyltetrahydrofolate deformylase  38.38 
 
 		 288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0525619 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>