More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1098 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1098  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 
278 aa  568  1e-161  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.13372  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1512  formyltetrahydrofolate deformylase  57.82 
 
 
280 aa  343  1e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000338325  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1370  formyltetrahydrofolate deformylase  55.04 
 
 
317 aa  325  4.0000000000000003e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0822  formyltetrahydrofolate deformylase  55.27 
 
 
276 aa  315  4e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.837326  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1008  tRNA nucleotidyltransferase/formyltetrahydrofolate deformylase  53.24 
 
 
644 aa  310  1e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00246463  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1249  formyltetrahydrofolate deformylase  53.57 
 
 
279 aa  310  1e-83  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1102  formyltetrahydrofolate deformylase  50.72 
 
 
278 aa  303  3.0000000000000004e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.198189  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1343  formyltetrahydrofolate deformylase  51.28 
 
 
316 aa  300  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3669  formyltetrahydrofolate deformylase  54.24 
 
 
269 aa  298  5e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0400805  normal  0.143987 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1134  formyltetrahydrofolate deformylase  53.24 
 
 
281 aa  298  5e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.409656  normal  0.540867 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0881  formyltetrahydrofolate deformylase  54.24 
 
 
274 aa  297  1e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1476  formyltetrahydrofolate deformylase  50.92 
 
 
288 aa  295  6e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1440  formyltetrahydrofolate deformylase  50.92 
 
 
288 aa  295  6e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1445  formyltetrahydrofolate deformylase  50.92 
 
 
288 aa  294  9e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0811  formyltetrahydrofolate deformylase  53.51 
 
 
274 aa  294  9e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.245806  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2907  formyltetrahydrofolate deformylase  50.92 
 
 
291 aa  294  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.520596 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1220  formyltetrahydrofolate deformylase  53.51 
 
 
274 aa  293  2e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1549  formyltetrahydrofolate deformylase  51.28 
 
 
285 aa  291  8e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3166  formyltetrahydrofolate deformylase  51.08 
 
 
277 aa  291  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2647  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
300 aa  290  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1624  formyltetrahydrofolate deformylase  50.37 
 
 
271 aa  290  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2277  formyltetrahydrofolate deformylase  52.06 
 
 
282 aa  290  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.262231  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1976  formyltetrahydrofolate deformylase  52.06 
 
 
282 aa  290  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2714  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
300 aa  290  2e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2821  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
300 aa  290  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01373  formyltetrahydrofolate deformylase  49.28 
 
 
277 aa  288  6e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1265  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
290 aa  288  7e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90141  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3286  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 
277 aa  286  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647235  hitchhiker  0.00001604 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2204  formyltetrahydrofolate deformylase  52.06 
 
 
283 aa  287  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0912  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 
277 aa  286  2.9999999999999996e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0786  formyltetrahydrofolate deformylase  52.38 
 
 
278 aa  286  2.9999999999999996e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3078  formyltetrahydrofolate deformylase  51.65 
 
 
274 aa  285  7e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1717  formyltetrahydrofolate deformylase  51.69 
 
 
280 aa  285  7e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0183504  normal  0.737156 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1962  formyltetrahydrofolate deformylase  52.06 
 
 
282 aa  285  8e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01208  formyltetrahydrofolate deformylase  51.69 
 
 
280 aa  284  9e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.673887  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2395  formyltetrahydrofolate deformylase  51.69 
 
 
280 aa  284  9e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000016766 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01218  hypothetical protein  51.69 
 
 
280 aa  284  9e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534807  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1909  formyltetrahydrofolate deformylase  51.69 
 
 
280 aa  284  9e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0165731  normal  0.142161 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1340  formyltetrahydrofolate deformylase  51.69 
 
 
280 aa  284  9e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00174787  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2417  formyltetrahydrofolate deformylase  51.69 
 
 
280 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000875082  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1381  formyltetrahydrofolate deformylase  51.69 
 
 
280 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0534896  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004096  formyltetrahydrofolate deformylase  48.2 
 
 
277 aa  284  1.0000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0262931  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1397  formyltetrahydrofolate deformylase  51.31 
 
 
280 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1883  formyltetrahydrofolate deformylase  51.31 
 
 
280 aa  281  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.26854 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1889  formyltetrahydrofolate deformylase  51.31 
 
 
280 aa  281  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.291619 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1946  formyltetrahydrofolate deformylase  51.31 
 
 
280 aa  281  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1577  formyltetrahydrofolate deformylase  49.28 
 
 
277 aa  281  7.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.200981  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1572  formyltetrahydrofolate deformylase  51.31 
 
 
280 aa  281  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2713  formyltetrahydrofolate deformylase  51.31 
 
 
282 aa  281  8.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.775319  hitchhiker  0.00024588 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5699  formyltetrahydrofolate deformylase  49 
 
 
306 aa  281  8.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.657774 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1389  formyltetrahydrofolate deformylase  51.31 
 
 
280 aa  281  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.336408  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2640  formyltetrahydrofolate deformylase  51.26 
 
 
277 aa  277  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.200065  normal  0.516834 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2311  formyltetrahydrofolate deformylase  49.44 
 
 
280 aa  276  3e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1971  formyltetrahydrofolate deformylase  49.81 
 
 
282 aa  275  8e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0499985  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2080  formyltetrahydrofolate deformylase  49.81 
 
 
282 aa  275  9e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0789639  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2334  formyltetrahydrofolate deformylase  49.81 
 
 
282 aa  275  9e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000680969  normal  0.0350893 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3999  formyltetrahydrofolate deformylase  48.72 
 
 
274 aa  258  6e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  46.24 
 
 
283 aa  242  6e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  45.74 
 
 
300 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  44.56 
 
 
283 aa  227  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  42.96 
 
 
284 aa  224  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  44.56 
 
 
283 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  43.62 
 
 
300 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  41.43 
 
 
285 aa  221  8e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3312  formyltetrahydrofolate deformylase  42.46 
 
 
283 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.929874  normal  0.815852 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38280  formyltetrahydrofolate deformylase  42.46 
 
 
283 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  42.91 
 
 
296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0638  formyltetrahydrofolate deformylase  40.86 
 
 
287 aa  219  3e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4314  formyltetrahydrofolate deformylase  42.66 
 
 
283 aa  219  5e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000262425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4018  formyltetrahydrofolate deformylase  42.66 
 
 
283 aa  218  6e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0329939  normal  0.0297352 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  43.51 
 
 
284 aa  218  7e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  43.82 
 
 
286 aa  217  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1007  formyltetrahydrofolate deformylase  43.01 
 
 
283 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000029138  hitchhiker  0.000000000000593821 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1367  formyltetrahydrofolate deformylase  43.01 
 
 
283 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0129513  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4356  formyltetrahydrofolate deformylase  43.01 
 
 
283 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805788  normal  0.0308915 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4447  formyltetrahydrofolate deformylase  43.01 
 
 
283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000794151  decreased coverage  0.00000544491 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  40.93 
 
 
287 aa  216  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  42.31 
 
 
282 aa  216  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00849533  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12978  formyltetrahydrofolate deformylase  40.99 
 
 
310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3654  formyltetrahydrofolate deformylase  38.68 
 
 
290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  41.26 
 
 
290 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  38.04 
 
 
283 aa  212  3.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1052  formyltetrahydrofolate deformylase  41.79 
 
 
284 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000281715  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  39.15 
 
 
299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1740  formyltetrahydrofolate deformylase  42.96 
 
 
286 aa  212  5.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  39.93 
 
 
288 aa  212  5.999999999999999e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  37.98 
 
 
286 aa  211  7e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  37.98 
 
 
286 aa  211  7e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0692  formyltetrahydrofolate deformylase  41.2 
 
 
288 aa  211  9e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11670  formyltetrahydrofolate deformylase  41.9 
 
 
291 aa  211  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  40 
 
 
283 aa  210  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  41.49 
 
 
284 aa  209  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  40.36 
 
 
284 aa  209  3e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1265  formyltetrahydrofolate deformylase  39.86 
 
 
295 aa  209  5e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771362  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  40.21 
 
 
289 aa  208  6e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  41.01 
 
 
284 aa  208  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  41.01 
 
 
284 aa  208  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5090  formyltetrahydrofolate deformylase  39.93 
 
 
295 aa  208  9e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0903812  normal  0.160405 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1023  formyltetrahydrofolate deformylase  39.37 
 
 
284 aa  208  9e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.124115  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1100  formyltetrahydrofolate deformylase  38.57 
 
 
283 aa  207  1e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.862849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>