More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1251 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1251  formyl transferase domain protein  100 
 
 		 327 aa  642    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2219  formyl transferase domain protein  65.81 
 
 		 317 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.46256  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0654  formyl transferase domain protein  66.13 
 
 		 316 aa  401  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1421  formyl transferase domain protein  64.86 
 
 		 324 aa  397  1e-109  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2645  formyl transferase domain protein  66.13 
 
 		 316 aa  394  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4711  formyl transferase domain protein  62.62 
 
 		 325 aa  372  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00446668  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0223  formyl transferase domain-containing protein  38.68 
 
 		 289 aa  222  7e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  39.51 
 
 		 287 aa  178  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  38.24 
 
 		 300 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  38.71 
 
 		 286 aa  176  7e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0638  formyltetrahydrofolate deformylase  38.78 
 
 		 287 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  37.99 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  38.46 
 
 		 286 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  38.46 
 
 		 286 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  39.16 
 
 		 286 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  39.19 
 
 		 299 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  37.32 
 
 		 289 aa  171  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  36.63 
 
 		 284 aa  169  5e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0467  formyltetrahydrofolate deformylase  38.25 
 
 		 293 aa  169  5e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1249  formyltetrahydrofolate deformylase  35.77 
 
 		 279 aa  169  6e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  38.66 
 
 		 283 aa  169  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2199  formyltetrahydrofolate deformylase  37.5 
 
 		 288 aa  168  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  34.86 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  34.86 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0692  formyltetrahydrofolate deformylase  38.72 
 
 		 288 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0811  formyltetrahydrofolate deformylase  33.81 
 
 		 274 aa  166  4e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.245806  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  34.39 
 
 		 285 aa  166  4e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  36.63 
 
 		 284 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  36.01 
 
 		 284 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0881  formyltetrahydrofolate deformylase  33.45 
 
 		 274 aa  163  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1220  formyltetrahydrofolate deformylase  33.1 
 
 		 274 aa  163  5.0000000000000005e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004096  formyltetrahydrofolate deformylase  35.29 
 
 		 277 aa  162  9e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0262931  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01373  formyltetrahydrofolate deformylase  35.66 
 
 		 277 aa  161  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1134  formyltetrahydrofolate deformylase  38.29 
 
 		 281 aa  161  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.409656  normal  0.540867 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  35.98 
 
 		 309 aa  160  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00390951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  35.48 
 
 		 287 aa  159  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0786  formyltetrahydrofolate deformylase  36.53 
 
 		 278 aa  160  4e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1008  tRNA nucleotidyltransferase/formyltetrahydrofolate deformylase  34.06 
 
 		 644 aa  159  5e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00246463  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01208  formyltetrahydrofolate deformylase  37.68 
 
 		 280 aa  159  7e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.673887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1340  formyltetrahydrofolate deformylase  37.68 
 
 		 280 aa  159  7e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00174787  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2395  formyltetrahydrofolate deformylase  37.68 
 
 		 280 aa  159  7e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000016766 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1717  formyltetrahydrofolate deformylase  37.68 
 
 		 280 aa  159  7e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0183504  normal  0.737156 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01218  hypothetical protein  37.68 
 
 		 280 aa  159  7e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534807  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1397  formyltetrahydrofolate deformylase  37.68 
 
 		 280 aa  159  7e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1909  formyltetrahydrofolate deformylase  37.68 
 
 		 280 aa  159  7e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0165731  normal  0.142161 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2417  formyltetrahydrofolate deformylase  37.68 
 
 		 280 aa  158  9e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000875082  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1381  formyltetrahydrofolate deformylase  37.68 
 
 		 280 aa  158  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0534896  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2311  formyltetrahydrofolate deformylase  38.49 
 
 		 280 aa  157  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1311  formyltetrahydrofolate deformylase  33.92 
 
 		 284 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2236  formyltetrahydrofolate deformylase  35.29 
 
 		 288 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1265  formyltetrahydrofolate deformylase  35.56 
 
 		 290 aa  156  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90141  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21841  formyltetrahydrofolate deformylase  33.57 
 
 		 284 aa  156  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.310068  normal  0.572618 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  39.55 
 
 		 289 aa  156  5.0000000000000005e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1098  formyltetrahydrofolate deformylase  34.31 
 
 		 278 aa  155  6e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.13372  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1052  formyltetrahydrofolate deformylase  33.81 
 
 		 284 aa  155  8e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000281715  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1695  formyltetrahydrofolate deformylase  36.43 
 
 		 295 aa  155  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0684131  normal  0.212705 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  34.31 
 
 		 289 aa  155  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1370  formyltetrahydrofolate deformylase  37.46 
 
 		 317 aa  154  1e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1343  formyltetrahydrofolate deformylase  37.96 
 
 		 316 aa  155  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  30.29 
 
 		 284 aa  154  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2907  formyltetrahydrofolate deformylase  36.67 
 
 		 291 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.520596 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2204  formyltetrahydrofolate deformylase  37.18 
 
 		 283 aa  154  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1512  formyltetrahydrofolate deformylase  35.9 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000338325  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19121  formyltetrahydrofolate deformylase  32.62 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2713  formyltetrahydrofolate deformylase  35.4 
 
 		 282 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.775319  hitchhiker  0.00024588 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  31.9 
 
 		 284 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.571525  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  33.57 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  36 
 
 		 287 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1962  formyltetrahydrofolate deformylase  37.09 
 
 		 282 aa  153  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1445  formyltetrahydrofolate deformylase  36.3 
 
 		 288 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12031  predicted protein  32.28 
 
 		 297 aa  153  4e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0206302  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1440  formyltetrahydrofolate deformylase  36.3 
 
 		 288 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1476  formyltetrahydrofolate deformylase  36.3 
 
 		 288 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4357  formyltetrahydrofolate deformylase  34.3 
 
 		 286 aa  153  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.578575  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0534  formyltetrahydrofolate deformylase  36.52 
 
 		 294 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  33.57 
 
 		 283 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1668  formyltetrahydrofolate deformylase  34.81 
 
 		 292 aa  152  8e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000107141  normal  0.242712 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2080  formyltetrahydrofolate deformylase  36.46 
 
 		 282 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0789639  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6765  formyltetrahydrofolate deformylase  34.51 
 
 		 291 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00467  formyltetrahydrofolate deformylase  32.59 
 
 		 267 aa  152  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3286  formyltetrahydrofolate deformylase  34.8 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647235  hitchhiker  0.00001604 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  33.94 
 
 		 296 aa  152  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0486  formyltetrahydrofolate deformylase  30.77 
 
 		 284 aa  151  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2647  formyltetrahydrofolate deformylase  36.73 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2714  formyltetrahydrofolate deformylase  36.86 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2334  formyltetrahydrofolate deformylase  36.46 
 
 		 282 aa  151  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000680969  normal  0.0350893 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1946  formyltetrahydrofolate deformylase  36.82 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2873  formyltetrahydrofolate deformylase  37.55 
 
 		 282 aa  151  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.571166  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3312  formyltetrahydrofolate deformylase  31.43 
 
 		 283 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.929874  normal  0.815852 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1889  formyltetrahydrofolate deformylase  36.82 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.291619 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1572  formyltetrahydrofolate deformylase  36.82 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1976  formyltetrahydrofolate deformylase  36.82 
 
 		 282 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1883  formyltetrahydrofolate deformylase  36.82 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.26854 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3717  formyltetrahydrofolate deformylase  35.79 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2821  formyltetrahydrofolate deformylase  36.73 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1389  formyltetrahydrofolate deformylase  36.82 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.336408  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18931  formyltetrahydrofolate deformylase  31.34 
 
 		 284 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1023  formyltetrahydrofolate deformylase  33.45 
 
 		 284 aa  150  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.124115  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1971  formyltetrahydrofolate deformylase  37.22 
 
 		 282 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0499985  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44906  formyltetrahydrofolate deformylase  33.78 
 
 		 304 aa  150  3e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>