More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1421 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1421  formyl transferase domain protein  100 
 
 		 324 aa  650    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2219  formyl transferase domain protein  83.44 
 
 		 317 aa  538  9.999999999999999e-153  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.46256  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0654  formyl transferase domain protein  76.58 
 
 		 316 aa  489  1e-137  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2645  formyl transferase domain protein  75.16 
 
 		 316 aa  476  1e-133  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4711  formyl transferase domain protein  70.83 
 
 		 325 aa  442  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00446668  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1251  formyl transferase domain protein  64.86 
 
 		 327 aa  397  1e-109  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0223  formyl transferase domain-containing protein  40.99 
 
 		 289 aa  227  3e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  39.64 
 
 		 287 aa  196  6e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0811  formyltetrahydrofolate deformylase  38.99 
 
 		 274 aa  193  3e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.245806  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1220  formyltetrahydrofolate deformylase  38.99 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0881  formyltetrahydrofolate deformylase  38.63 
 
 		 274 aa  191  2e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  39.34 
 
 		 289 aa  191  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  39.43 
 
 		 300 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1008  tRNA nucleotidyltransferase/formyltetrahydrofolate deformylase  38.77 
 
 		 644 aa  187  2e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00246463  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  38.7 
 
 		 286 aa  185  7e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  40.14 
 
 		 299 aa  185  7e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  38.38 
 
 		 300 aa  185  7e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  38.7 
 
 		 286 aa  185  7e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  38.73 
 
 		 286 aa  185  9e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2873  formyltetrahydrofolate deformylase  39.86 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.571166  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0638  formyltetrahydrofolate deformylase  39.63 
 
 		 287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0467  formyltetrahydrofolate deformylase  39.63 
 
 		 293 aa  183  3e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  37.41 
 
 		 284 aa  182  5.0000000000000004e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  39.05 
 
 		 289 aa  182  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1249  formyltetrahydrofolate deformylase  36.03 
 
 		 279 aa  181  1e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0786  formyltetrahydrofolate deformylase  38.24 
 
 		 278 aa  181  1e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0534  formyltetrahydrofolate deformylase  37.05 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2199  formyltetrahydrofolate deformylase  39.63 
 
 		 288 aa  181  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  38.69 
 
 		 289 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  40 
 
 		 282 aa  180  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  39.41 
 
 		 283 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3462  formyltetrahydrofolate deformylase  39.19 
 
 		 306 aa  179  4e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  37.28 
 
 		 287 aa  179  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1134  formyltetrahydrofolate deformylase  39.43 
 
 		 281 aa  179  7e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.409656  normal  0.540867 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  38.11 
 
 		 286 aa  178  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  38.71 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0822  formyltetrahydrofolate deformylase  39.03 
 
 		 276 aa  177  2e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.837326  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1343  formyltetrahydrofolate deformylase  39.41 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2907  formyltetrahydrofolate deformylase  39.18 
 
 		 291 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.520596 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1476  formyltetrahydrofolate deformylase  39.18 
 
 		 288 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1445  formyltetrahydrofolate deformylase  39.18 
 
 		 288 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3078  formyltetrahydrofolate deformylase  37.94 
 
 		 274 aa  176  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1440  formyltetrahydrofolate deformylase  39.18 
 
 		 288 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3717  formyltetrahydrofolate deformylase  36.46 
 
 		 309 aa  177  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  39.03 
 
 		 284 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2699  formyltetrahydrofolate deformylase  35.97 
 
 		 294 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.622702  normal  0.252245 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2841  formyltetrahydrofolate deformylase  35.97 
 
 		 294 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3669  formyltetrahydrofolate deformylase  39.19 
 
 		 269 aa  175  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0400805  normal  0.143987 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0692  formyltetrahydrofolate deformylase  38.6 
 
 		 288 aa  175  8e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6111  formyltetrahydrofolate deformylase  37.05 
 
 		 294 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481987  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2167  formyltetrahydrofolate deformylase  36.69 
 
 		 294 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2781  formyltetrahydrofolate deformylase  36.69 
 
 		 294 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2080  formyltetrahydrofolate deformylase  38.81 
 
 		 282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0789639  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2334  formyltetrahydrofolate deformylase  38.81 
 
 		 282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000680969  normal  0.0350893 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1971  formyltetrahydrofolate deformylase  38.81 
 
 		 282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0499985  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1370  formyltetrahydrofolate deformylase  36.3 
 
 		 317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  38.89 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00390951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0584  formyltetrahydrofolate deformylase  36.47 
 
 		 291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2647  formyltetrahydrofolate deformylase  38.81 
 
 		 300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  38.85 
 
 		 283 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2714  formyltetrahydrofolate deformylase  38.81 
 
 		 300 aa  172  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  38.32 
 
 		 289 aa  172  5e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2821  formyltetrahydrofolate deformylase  38.81 
 
 		 300 aa  173  5e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2713  formyltetrahydrofolate deformylase  39.63 
 
 		 282 aa  172  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.775319  hitchhiker  0.00024588 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  36.4 
 
 		 287 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1752  formyltetrahydrofolate deformylase  37.06 
 
 		 288 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2417  formyltetrahydrofolate deformylase  38.77 
 
 		 280 aa  172  9e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000875082  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3286  formyltetrahydrofolate deformylase  37.27 
 
 		 277 aa  171  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647235  hitchhiker  0.00001604 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2792  formyltetrahydrofolate deformylase  36.33 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.329734 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1624  formyltetrahydrofolate deformylase  38.6 
 
 		 271 aa  172  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1695  formyltetrahydrofolate deformylase  37.94 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0684131  normal  0.212705 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01208  formyltetrahydrofolate deformylase  38.41 
 
 		 280 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.673887  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4357  formyltetrahydrofolate deformylase  35.87 
 
 		 286 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.578575  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01218  hypothetical protein  38.41 
 
 		 280 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534807  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1340  formyltetrahydrofolate deformylase  38.41 
 
 		 280 aa  170  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00174787  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2395  formyltetrahydrofolate deformylase  38.41 
 
 		 280 aa  170  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000016766 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00467  formyltetrahydrofolate deformylase  34.96 
 
 		 267 aa  171  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1909  formyltetrahydrofolate deformylase  38.41 
 
 		 280 aa  170  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0165731  normal  0.142161 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1381  formyltetrahydrofolate deformylase  39.26 
 
 		 280 aa  170  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0534896  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1397  formyltetrahydrofolate deformylase  38.41 
 
 		 280 aa  171  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1717  formyltetrahydrofolate deformylase  38.41 
 
 		 280 aa  170  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0183504  normal  0.737156 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1052  formyltetrahydrofolate deformylase  34.93 
 
 		 284 aa  170  3e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000281715  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3999  formyltetrahydrofolate deformylase  38.13 
 
 		 274 aa  170  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1352  formyltetrahydrofolate deformylase  34.05 
 
 		 282 aa  169  4e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782528  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2376  formyltetrahydrofolate deformylase  37.82 
 
 		 293 aa  170  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0552536 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2074  formyltetrahydrofolate deformylase  36.71 
 
 		 288 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01373  formyltetrahydrofolate deformylase  36.3 
 
 		 277 aa  169  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1962  formyltetrahydrofolate deformylase  38.52 
 
 		 282 aa  169  5e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1237  formyltetrahydrofolate deformylase  37.11 
 
 		 284 aa  169  7e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144683  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2236  formyltetrahydrofolate deformylase  35.71 
 
 		 288 aa  169  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0411  formyltetrahydrofolate deformylase  39.3 
 
 		 295 aa  169  8e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.789305  normal  0.762078 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2419  formyltetrahydrofolate deformylase  37.41 
 
 		 287 aa  169  8e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18880  formyltetrahydrofolate deformylase  37.96 
 
 		 282 aa  168  9e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0052951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  38.05 
 
 		 285 aa  168  9e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004096  formyltetrahydrofolate deformylase  35.93 
 
 		 277 aa  168  9e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0262931  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  33.8 
 
 		 290 aa  168  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  37.04 
 
 		 284 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1577  formyltetrahydrofolate deformylase  36.94 
 
 		 277 aa  168  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.200981  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  34.63 
 
 		 288 aa  168  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1265  formyltetrahydrofolate deformylase  36.94 
 
 		 290 aa  168  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>