More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0223 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0223  formyl transferase domain-containing protein  100 
 
 		 289 aa  590  1e-168  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0654  formyl transferase domain protein  41.84 
 
 		 316 aa  239  4e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2645  formyl transferase domain protein  41.49 
 
 		 316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2219  formyl transferase domain protein  41.13 
 
 		 317 aa  231  1e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.46256  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4711  formyl transferase domain protein  41.54 
 
 		 325 aa  230  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00446668  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1421  formyl transferase domain protein  40.99 
 
 		 324 aa  227  2e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1251  formyl transferase domain protein  38.68 
 
 		 327 aa  222  6e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  38.46 
 
 		 296 aa  188  7e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  40 
 
 		 300 aa  186  5e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0638  formyltetrahydrofolate deformylase  38.01 
 
 		 287 aa  183  3e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  37.91 
 
 		 284 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  40.74 
 
 		 284 aa  182  5.0000000000000004e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2199  formyltetrahydrofolate deformylase  38.73 
 
 		 288 aa  178  7e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  35.14 
 
 		 284 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  35.14 
 
 		 284 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0692  formyltetrahydrofolate deformylase  37.69 
 
 		 288 aa  177  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  38.01 
 
 		 300 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1668  formyltetrahydrofolate deformylase  36.57 
 
 		 292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000107141  normal  0.242712 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  37.78 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00390951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  37.72 
 
 		 286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  36.3 
 
 		 287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0467  formyltetrahydrofolate deformylase  35.79 
 
 		 293 aa  172  6.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  36.09 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1977  formyltetrahydrofolate deformylase  35.27 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  36.09 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  37.4 
 
 		 283 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2713  formyltetrahydrofolate deformylase  36.4 
 
 		 282 aa  167  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.775319  hitchhiker  0.00024588 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  34.48 
 
 		 282 aa  168  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1909  formyltetrahydrofolate deformylase  36.78 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0165731  normal  0.142161 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01208  formyltetrahydrofolate deformylase  36.78 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.673887  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2417  formyltetrahydrofolate deformylase  36.78 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000875082  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2311  formyltetrahydrofolate deformylase  36.02 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01218  hypothetical protein  36.78 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534807  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1340  formyltetrahydrofolate deformylase  36.78 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00174787  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2395  formyltetrahydrofolate deformylase  36.78 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000016766 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1717  formyltetrahydrofolate deformylase  36.78 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0183504  normal  0.737156 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1381  formyltetrahydrofolate deformylase  36.78 
 
 		 280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0534896  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1397  formyltetrahydrofolate deformylase  36.78 
 
 		 280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  33.93 
 
 		 284 aa  166  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  35.07 
 
 		 282 aa  166  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1946  formyltetrahydrofolate deformylase  36.02 
 
 		 280 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1572  formyltetrahydrofolate deformylase  36.02 
 
 		 280 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1976  formyltetrahydrofolate deformylase  36.02 
 
 		 282 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1883  formyltetrahydrofolate deformylase  36.02 
 
 		 280 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.26854 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2204  formyltetrahydrofolate deformylase  35.66 
 
 		 283 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1889  formyltetrahydrofolate deformylase  36.02 
 
 		 280 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.291619 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  34.69 
 
 		 285 aa  165  8e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4234  formyltetrahydrofolate deformylase  33.45 
 
 		 284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.761125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0811  formyltetrahydrofolate deformylase  35.96 
 
 		 274 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.245806  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2277  formyltetrahydrofolate deformylase  36.02 
 
 		 282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.262231  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2425  formyltetrahydrofolate deformylase  33.93 
 
 		 284 aa  164  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0881  formyltetrahydrofolate deformylase  35.96 
 
 		 274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2419  formyltetrahydrofolate deformylase  36.53 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1389  formyltetrahydrofolate deformylase  35.63 
 
 		 280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.336408  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1220  formyltetrahydrofolate deformylase  35.58 
 
 		 274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  35.74 
 
 		 289 aa  163  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1265  formyltetrahydrofolate deformylase  37.17 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90141  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1134  formyltetrahydrofolate deformylase  37.27 
 
 		 281 aa  163  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.409656  normal  0.540867 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0706  formyltetrahydrofolate deformylase  35.07 
 
 		 282 aa  162  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1962  formyltetrahydrofolate deformylase  35.66 
 
 		 282 aa  162  6e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2080  formyltetrahydrofolate deformylase  35.63 
 
 		 282 aa  162  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0789639  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  35.07 
 
 		 282 aa  162  7e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2334  formyltetrahydrofolate deformylase  35.63 
 
 		 282 aa  162  7e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000680969  normal  0.0350893 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  35.58 
 
 		 299 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1971  formyltetrahydrofolate deformylase  36.05 
 
 		 282 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0499985  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  35.21 
 
 		 286 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  35.21 
 
 		 286 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  35.21 
 
 		 286 aa  162  9e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1370  formyltetrahydrofolate deformylase  33.33 
 
 		 317 aa  161  1e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  37.64 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  34.72 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0912  formyltetrahydrofolate deformylase  37.69 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  37.4 
 
 		 283 aa  160  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01373  formyltetrahydrofolate deformylase  36.08 
 
 		 277 aa  159  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  34.7 
 
 		 282 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3286  formyltetrahydrofolate deformylase  39.15 
 
 		 277 aa  159  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647235  hitchhiker  0.00001604 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004096  formyltetrahydrofolate deformylase  35.32 
 
 		 277 aa  159  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0262931  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  34.7 
 
 		 285 aa  159  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1549  formyltetrahydrofolate deformylase  37.17 
 
 		 285 aa  159  6e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5200  formyltetrahydrofolate deformylase  31.32 
 
 		 281 aa  159  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  32.71 
 
 		 283 aa  159  7e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1192  formyltetrahydrofolate deformylase  34.83 
 
 		 283 aa  158  8e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2907  formyltetrahydrofolate deformylase  35.34 
 
 		 291 aa  158  9e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.520596 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1100  formyltetrahydrofolate deformylase  34.83 
 
 		 283 aa  158  9e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.862849  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2640  formyltetrahydrofolate deformylase  35.85 
 
 		 277 aa  158  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.200065  normal  0.516834 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1440  formyltetrahydrofolate deformylase  35.34 
 
 		 288 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1476  formyltetrahydrofolate deformylase  35.34 
 
 		 288 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1445  formyltetrahydrofolate deformylase  35.34 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1052  formyltetrahydrofolate deformylase  37.97 
 
 		 284 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000281715  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1577  formyltetrahydrofolate deformylase  36.47 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.200981  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0786  formyltetrahydrofolate deformylase  35.42 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1081  formyltetrahydrofolate deformylase  35.45 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  32.84 
 
 		 288 aa  157  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2122  formyltetrahydrofolate deformylase  33.09 
 
 		 297 aa  156  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.479975  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2714  formyltetrahydrofolate deformylase  36.43 
 
 		 300 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  34.83 
 
 		 283 aa  156  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2647  formyltetrahydrofolate deformylase  36.43 
 
 		 300 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2821  formyltetrahydrofolate deformylase  36.43 
 
 		 300 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0584  formyltetrahydrofolate deformylase  34.46 
 
 		 291 aa  155  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  33.45 
 
 		 284 aa  155  8e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.571525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>