More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4711 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013745  Htur_4711  formyl transferase domain protein  100 
 
 		 325 aa  646    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00446668  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1421  formyl transferase domain protein  70.44 
 
 		 324 aa  447  1e-125  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2219  formyl transferase domain protein  69.21 
 
 		 317 aa  437  1e-121  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.46256  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0654  formyl transferase domain protein  67.2 
 
 		 316 aa  427  1e-118  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2645  formyl transferase domain protein  65.51 
 
 		 316 aa  414  1e-114  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1251  formyl transferase domain protein  62.62 
 
 		 327 aa  372  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0223  formyl transferase domain-containing protein  41.54 
 
 		 289 aa  230  2e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  40.34 
 
 		 287 aa  196  5.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  37.59 
 
 		 300 aa  195  9e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1220  formyltetrahydrofolate deformylase  36.56 
 
 		 274 aa  192  8e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  39.22 
 
 		 300 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0811  formyltetrahydrofolate deformylase  37.55 
 
 		 274 aa  191  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.245806  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0881  formyltetrahydrofolate deformylase  37.55 
 
 		 274 aa  189  7e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2199  formyltetrahydrofolate deformylase  39.05 
 
 		 288 aa  188  9e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0638  formyltetrahydrofolate deformylase  39.49 
 
 		 287 aa  188  9e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  37 
 
 		 283 aa  186  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  39.29 
 
 		 289 aa  186  4e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0467  formyltetrahydrofolate deformylase  39.27 
 
 		 293 aa  186  5e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  36.62 
 
 		 284 aa  185  8e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  40 
 
 		 286 aa  182  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  36.52 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00390951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  38.79 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1343  formyltetrahydrofolate deformylase  38.01 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1008  tRNA nucleotidyltransferase/formyltetrahydrofolate deformylase  37.41 
 
 		 644 aa  180  2.9999999999999997e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00246463  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5699  formyltetrahydrofolate deformylase  36.05 
 
 		 306 aa  179  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.657774 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  37.09 
 
 		 289 aa  179  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1052  formyltetrahydrofolate deformylase  35.71 
 
 		 284 aa  179  7e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000281715  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  36.73 
 
 		 289 aa  179  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0692  formyltetrahydrofolate deformylase  38.77 
 
 		 288 aa  179  8e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1237  formyltetrahydrofolate deformylase  37.5 
 
 		 284 aa  178  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144683  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  38.19 
 
 		 286 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  38.19 
 
 		 286 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  33.21 
 
 		 284 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1440  formyltetrahydrofolate deformylase  37.27 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1445  formyltetrahydrofolate deformylase  37.27 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1476  formyltetrahydrofolate deformylase  37.27 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3669  formyltetrahydrofolate deformylase  37.36 
 
 		 269 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0400805  normal  0.143987 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  38.19 
 
 		 299 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  38.6 
 
 		 285 aa  176  4e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1134  formyltetrahydrofolate deformylase  37.37 
 
 		 281 aa  176  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.409656  normal  0.540867 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  34.39 
 
 		 284 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  34.39 
 
 		 284 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  36.99 
 
 		 284 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2907  formyltetrahydrofolate deformylase  36.9 
 
 		 291 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.520596 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00467  formyltetrahydrofolate deformylase  35.42 
 
 		 267 aa  176  6e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2647  formyltetrahydrofolate deformylase  36.53 
 
 		 300 aa  175  9e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0584  formyltetrahydrofolate deformylase  35.27 
 
 		 291 aa  175  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1023  formyltetrahydrofolate deformylase  37.11 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.124115  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2714  formyltetrahydrofolate deformylase  36.53 
 
 		 300 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2821  formyltetrahydrofolate deformylase  36.53 
 
 		 300 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  36.63 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  38.18 
 
 		 282 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3999  formyltetrahydrofolate deformylase  36.43 
 
 		 274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0534  formyltetrahydrofolate deformylase  36.07 
 
 		 294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0822  formyltetrahydrofolate deformylase  38.13 
 
 		 276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.837326  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2873  formyltetrahydrofolate deformylase  38.71 
 
 		 282 aa  172  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.571166  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  36.27 
 
 		 286 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2417  formyltetrahydrofolate deformylase  35.94 
 
 		 280 aa  172  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000875082  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  33.09 
 
 		 282 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00849533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2713  formyltetrahydrofolate deformylase  35.21 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.775319  hitchhiker  0.00024588 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  37.11 
 
 		 289 aa  172  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01208  formyltetrahydrofolate deformylase  35.59 
 
 		 280 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.673887  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2395  formyltetrahydrofolate deformylase  35.59 
 
 		 280 aa  171  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000016766 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1717  formyltetrahydrofolate deformylase  35.59 
 
 		 280 aa  171  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0183504  normal  0.737156 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1909  formyltetrahydrofolate deformylase  35.59 
 
 		 280 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0165731  normal  0.142161 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1381  formyltetrahydrofolate deformylase  35.59 
 
 		 280 aa  171  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0534896  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01218  hypothetical protein  35.59 
 
 		 280 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534807  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1340  formyltetrahydrofolate deformylase  35.59 
 
 		 280 aa  171  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00174787  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  35.4 
 
 		 296 aa  171  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3286  formyltetrahydrofolate deformylase  34.16 
 
 		 277 aa  170  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647235  hitchhiker  0.00001604 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1397  formyltetrahydrofolate deformylase  35.59 
 
 		 280 aa  170  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1624  formyltetrahydrofolate deformylase  35.42 
 
 		 271 aa  170  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1962  formyltetrahydrofolate deformylase  35.82 
 
 		 282 aa  170  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6765  formyltetrahydrofolate deformylase  34.63 
 
 		 291 aa  170  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1668  formyltetrahydrofolate deformylase  37.23 
 
 		 292 aa  170  3e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000107141  normal  0.242712 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  35.29 
 
 		 288 aa  169  4e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  39.15 
 
 		 287 aa  169  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1367  formyltetrahydrofolate deformylase  33.81 
 
 		 283 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0129513  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1249  formyltetrahydrofolate deformylase  34.07 
 
 		 279 aa  169  6e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4356  formyltetrahydrofolate deformylase  33.81 
 
 		 283 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805788  normal  0.0308915 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0486  formyltetrahydrofolate deformylase  32.36 
 
 		 284 aa  169  6e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2204  formyltetrahydrofolate deformylase  35.23 
 
 		 283 aa  169  7e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1370  formyltetrahydrofolate deformylase  35 
 
 		 317 aa  169  7e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  33.1 
 
 		 287 aa  169  7e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  35.21 
 
 		 287 aa  169  7e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1577  formyltetrahydrofolate deformylase  35.93 
 
 		 277 aa  168  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.200981  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5913  formyltetrahydrofolate deformylase  33.92 
 
 		 296 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1740  formyltetrahydrofolate deformylase  33.22 
 
 		 286 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1007  formyltetrahydrofolate deformylase  33.45 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000029138  hitchhiker  0.000000000000593821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4447  formyltetrahydrofolate deformylase  33.45 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000794151  decreased coverage  0.00000544491 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  37.55 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.571525  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  34.3 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0786  formyltetrahydrofolate deformylase  35.51 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3462  formyltetrahydrofolate deformylase  36.2 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18880  formyltetrahydrofolate deformylase  38.3 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0052951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19121  formyltetrahydrofolate deformylase  37.14 
 
 		 290 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2311  formyltetrahydrofolate deformylase  35.34 
 
 		 280 aa  167  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  35.44 
 
 		 284 aa  167  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  36.23 
 
 		 284 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4314  formyltetrahydrofolate deformylase  32.14 
 
 		 283 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000262425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>