60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1031 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1031  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  185  1e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2658  hypothetical protein  80 
 
 
90 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2268  hypothetical protein  75.56 
 
 
90 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05450  hypothetical protein  67.78 
 
 
90 aa  132  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.670978  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0970  hypothetical protein  68.89 
 
 
90 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2798  hypothetical protein  70 
 
 
90 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.019428  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1174  ACT domain protein  59.09 
 
 
112 aa  107  5e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.440111 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1499  ACT domain-containing protein  51.11 
 
 
90 aa  101  3e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1723  hypothetical protein  48.86 
 
 
89 aa  90.9  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0409  hypothetical protein  47.73 
 
 
89 aa  89  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.168136  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2117  hypothetical protein  46.67 
 
 
90 aa  89  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0587  hypothetical protein  44.44 
 
 
90 aa  87  7e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1126  hypothetical protein  45.56 
 
 
100 aa  86.3  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000365501  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1671  hypothetical protein  46.07 
 
 
100 aa  86.7  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313942  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14440  hypothetical protein  47.73 
 
 
89 aa  85.5  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2075  ACT domain-containing protein  45.45 
 
 
114 aa  83.6  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1378  hypothetical protein  42.05 
 
 
93 aa  83.6  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000129759  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1354  hypothetical protein  44.94 
 
 
93 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1683  hypothetical protein  45.56 
 
 
90 aa  81.3  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1181  hypothetical protein  43.33 
 
 
92 aa  80.9  0.000000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.254415  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1270  hypothetical protein  45.45 
 
 
94 aa  80.5  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0944  hypothetical protein  38.89 
 
 
90 aa  79  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1534  hypothetical protein  44.44 
 
 
90 aa  77.4  0.00000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0918  hypothetical protein  45.56 
 
 
90 aa  77  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0844317  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3283  hypothetical protein  40.91 
 
 
99 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0230  hypothetical protein  44.44 
 
 
90 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.867874  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1470  hypothetical protein  43.18 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.461191  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1017  ACT domain-containing protein  37.5 
 
 
95 aa  75.1  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.890596  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1747  hypothetical protein  43.02 
 
 
89 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0169419  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1019  hypothetical protein  40.91 
 
 
87 aa  73.6  0.0000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0122  ACT domain-containing protein  38.64 
 
 
89 aa  73.6  0.0000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3182  hypothetical protein  35.96 
 
 
92 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  hitchhiker  0.00106731 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0342  ACT domain-containing protein  35.56 
 
 
90 aa  72.4  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0156  hypothetical protein  40.91 
 
 
88 aa  70.9  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.936337  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1034  hypothetical protein  36.67 
 
 
90 aa  70.5  0.000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0758  hypothetical protein  34.44 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.140436 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0439  ACT domain-containing protein  37.5 
 
 
89 aa  68.9  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0941  ACT domain-containing protein  38.64 
 
 
88 aa  68.6  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0440922  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2118  hypothetical protein  34.83 
 
 
92 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0612  hypothetical protein  33.71 
 
 
92 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287518  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11620  ACT domain-containing protein  36.36 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1421  formyl transferase domain protein  39.47 
 
 
324 aa  59.3  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4121  ACT domain-containing protein  35.96 
 
 
92 aa  58.9  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0861831  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1251  formyl transferase domain protein  39.47 
 
 
327 aa  58.2  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0829  hypothetical protein  35.96 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2219  formyl transferase domain protein  39.73 
 
 
317 aa  55.1  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.46256  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0654  formyl transferase domain protein  34.21 
 
 
316 aa  54.3  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2005  hypothetical protein  37.08 
 
 
91 aa  53.9  0.0000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.388818 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2645  formyl transferase domain protein  32.89 
 
 
316 aa  53.5  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1965  ACT domain-containing protein  37.97 
 
 
183 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0479  ACT domain-containing protein  50 
 
 
183 aa  52.8  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0912  hypothetical protein  36.67 
 
 
90 aa  53.5  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.187165 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4711  formyl transferase domain protein  36.49 
 
 
325 aa  51.6  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00446668  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2949  amino acid-binding ACT domain-containing protein  43.64 
 
 
183 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3554  amino acid-binding ACT  35.53 
 
 
189 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0217681  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0621  amino acid-binding ACT domain protein  28.41 
 
 
187 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0896  amino acid-binding ACT domain protein  38.36 
 
 
173 aa  43.5  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00320944  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3703  glycine cleavage system regulatory protein-like  25.29 
 
 
183 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8574  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  38.33 
 
 
165 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3457  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  33.77 
 
 
185 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>