86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3182 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3182  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  185  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  hitchhiker  0.00106731 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2118  hypothetical protein  72.83 
 
 		 92 aa  132  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0829  hypothetical protein  76.09 
 
 		 92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0612  hypothetical protein  66.3 
 
 		 92 aa  120  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287518  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1671  hypothetical protein  49.45 
 
 		 100 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313942  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1270  hypothetical protein  50 
 
 		 94 aa  100  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1378  hypothetical protein  51.09 
 
 		 93 aa  99.4  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000129759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3283  hypothetical protein  47.78 
 
 		 99 aa  97.8  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1354  hypothetical protein  48.89 
 
 		 93 aa  96.7  9e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14440  hypothetical protein  47.67 
 
 		 89 aa  94.4  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2117  hypothetical protein  48.86 
 
 		 90 aa  94.4  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1723  hypothetical protein  45.45 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0409  hypothetical protein  46.59 
 
 		 89 aa  92.8  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.168136  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1126  hypothetical protein  44.57 
 
 		 100 aa  92.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000365501  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0230  hypothetical protein  47.67 
 
 		 90 aa  90.9  6e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.867874  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0758  hypothetical protein  46.51 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.140436 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0918  hypothetical protein  46.51 
 
 		 90 aa  89.4  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0844317  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1683  hypothetical protein  47.67 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1019  hypothetical protein  44.32 
 
 		 87 aa  87.4  6e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1534  hypothetical protein  46.51 
 
 		 90 aa  87.4  7e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0587  hypothetical protein  44.32 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1034  hypothetical protein  45.35 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2075  ACT domain-containing protein  39.77 
 
 		 114 aa  84.7  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1017  ACT domain-containing protein  47.78 
 
 		 95 aa  84  7e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.890596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1499  ACT domain-containing protein  38.2 
 
 		 90 aa  81.6  0.000000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0122  ACT domain-containing protein  44.32 
 
 		 89 aa  81.3  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0342  ACT domain-containing protein  43.02 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0970  hypothetical protein  40.45 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2268  hypothetical protein  42.7 
 
 		 90 aa  80.1  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05450  hypothetical protein  40.45 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.670978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2658  hypothetical protein  40.45 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2798  hypothetical protein  39.33 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.019428  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2005  hypothetical protein  47.67 
 
 		 91 aa  79  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.388818 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1747  hypothetical protein  41.86 
 
 		 89 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0169419  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1174  ACT domain protein  39.77 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.440111 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4121  ACT domain-containing protein  40.66 
 
 		 92 aa  75.1  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0861831  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0912  hypothetical protein  47.67 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.187165 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1181  hypothetical protein  38.04 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.254415  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1031  hypothetical protein  35.96 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0944  hypothetical protein  37.08 
 
 		 90 aa  70.5  0.000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1470  hypothetical protein  38.64 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.461191  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0439  ACT domain-containing protein  36.05 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11620  ACT domain-containing protein  38.64 
 
 		 89 aa  65.1  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0156  hypothetical protein  39.77 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.936337  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0941  ACT domain-containing protein  31.82 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0440922  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2949  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.63 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4711  formyl transferase domain protein  33.33 
 
 		 325 aa  53.9  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00446668  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0479  ACT domain-containing protein  44 
 
 		 183 aa  52.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0621  amino acid-binding ACT domain protein  32.26 
 
 		 187 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3703  glycine cleavage system regulatory protein-like  32.97 
 
 		 183 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  30.23 
 
 		 400 aa  51.2  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1251  formyl transferase domain protein  29.63 
 
 		 327 aa  51.2  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2645  formyl transferase domain protein  32.1 
 
 		 316 aa  50.1  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0493  amino acid-binding ACT domain protein  29.63 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1421  formyl transferase domain protein  30.86 
 
 		 324 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2533  glycine cleavage system regulatory protein  41.94 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0654  formyl transferase domain protein  30.86 
 
 		 316 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1965  ACT domain-containing protein  37.04 
 
 		 183 aa  48.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3457  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  34.21 
 
 		 185 aa  47.4  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0527  amino acid-binding ACT domain protein  29.11 
 
 		 185 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4707  amino acid-binding ACT domain-containing protein  43.14 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4333  normal  0.012003 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3514  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.43 
 
 		 186 aa  43.9  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.160997  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  29.41 
 
 		 412 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  24.71 
 
 		 404 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4055  amino acid-binding ACT domain protein  30.14 
 
 		 188 aa  42.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3554  amino acid-binding ACT  30.67 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0217681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2199  amino acid-binding ACT domain-containing protein  26.67 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0596072  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  31.33 
 
 		 420 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4273  amino acid-binding ACT domain-containing protein  42.55 
 
 		 179 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340897  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2219  formyl transferase domain protein  27.5 
 
 		 317 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.46256  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0278  amino acid-binding ACT domain protein  23.68 
 
 		 196 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.305725  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92913  predicted protein  32.1 
 
 		 181 aa  42  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00941527  normal  0.3672 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  29.09 
 
 		 398 aa  41.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4386  amino acid-binding ACT domain-containing protein  35 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.523733  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1500  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.76 
 
 		 166 aa  41.2  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000613254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3969  amino acid-binding ACT domain protein  38.3 
 
 		 188 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100488  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1847  amino acid-binding ACT domain-containing protein  35.42 
 
 		 184 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00121314  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  29.41 
 
 		 438 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  39.58 
 
 		 404 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13058  phosphoserine phosphatase  25.64 
 
 		 409 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.128552 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  27.45 
 
 		 410 aa  40.8  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0896  amino acid-binding ACT domain protein  33.33 
 
 		 173 aa  40.8  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00320944  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  28.24 
 
 		 407 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  30.14 
 
 		 406 aa  40.4  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02138  glycine cleavage system transcriptional repressor  32.73 
 
 		 187 aa  40.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11679  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1775  metal dependent phosphohydrolase  47.62 
 
 		 735 aa  40.4  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.717267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>