60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1354 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1354  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  185  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1270  hypothetical protein  77.17 
 
 
94 aa  143  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3283  hypothetical protein  70.45 
 
 
99 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1671  hypothetical protein  66.29 
 
 
100 aa  123  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313942  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1378  hypothetical protein  54.84 
 
 
93 aa  108  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000129759  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2117  hypothetical protein  54.55 
 
 
90 aa  102  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14440  hypothetical protein  56.98 
 
 
89 aa  101  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2118  hypothetical protein  47.25 
 
 
92 aa  99.4  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1723  hypothetical protein  52.27 
 
 
89 aa  99.4  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0409  hypothetical protein  52.27 
 
 
89 aa  98.2  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.168136  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1534  hypothetical protein  51.72 
 
 
90 aa  97.8  5e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3182  hypothetical protein  48.89 
 
 
92 aa  96.7  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  hitchhiker  0.00106731 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0758  hypothetical protein  51.16 
 
 
108 aa  95.1  3e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.140436 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0587  hypothetical protein  45.45 
 
 
90 aa  92.8  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1683  hypothetical protein  46.59 
 
 
90 aa  92.8  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1034  hypothetical protein  50.57 
 
 
90 aa  91.7  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2075  ACT domain-containing protein  47.73 
 
 
114 aa  90.9  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0612  hypothetical protein  45.56 
 
 
92 aa  89  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287518  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0230  hypothetical protein  45.45 
 
 
90 aa  88.6  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.867874  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1747  hypothetical protein  50 
 
 
89 aa  88.2  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0169419  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0918  hypothetical protein  44.83 
 
 
90 aa  88.2  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0844317  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1126  hypothetical protein  42.86 
 
 
100 aa  87.8  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000365501  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05450  hypothetical protein  47.19 
 
 
90 aa  87.4  6e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.670978  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2798  hypothetical protein  51.14 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.019428  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0970  hypothetical protein  47.19 
 
 
90 aa  85.5  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0829  hypothetical protein  50 
 
 
92 aa  84.7  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1499  ACT domain-containing protein  44.94 
 
 
90 aa  82.4  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2268  hypothetical protein  48.31 
 
 
90 aa  82.8  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1031  hypothetical protein  44.94 
 
 
90 aa  81.6  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2658  hypothetical protein  47.19 
 
 
90 aa  81.3  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1017  ACT domain-containing protein  42.86 
 
 
95 aa  80.9  0.000000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.890596  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0342  ACT domain-containing protein  44.19 
 
 
90 aa  80.1  0.000000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0944  hypothetical protein  45.45 
 
 
90 aa  79  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1174  ACT domain protein  46.59 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.440111 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1019  hypothetical protein  42.05 
 
 
87 aa  76.6  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1181  hypothetical protein  42.7 
 
 
92 aa  75.9  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.254415  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2005  hypothetical protein  47.19 
 
 
91 aa  74.3  0.0000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.388818 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0912  hypothetical protein  52.33 
 
 
90 aa  73.9  0.0000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.187165 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0122  ACT domain-containing protein  42.05 
 
 
89 aa  72  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4121  ACT domain-containing protein  39.33 
 
 
92 aa  71.6  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0861831  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1470  hypothetical protein  44.32 
 
 
112 aa  70.5  0.000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.461191  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0439  ACT domain-containing protein  39.77 
 
 
89 aa  67  0.00000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0156  hypothetical protein  40.91 
 
 
88 aa  66.2  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.936337  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0941  ACT domain-containing protein  38.64 
 
 
88 aa  63.2  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0440922  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11620  ACT domain-containing protein  39.77 
 
 
89 aa  58.2  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0479  ACT domain-containing protein  40.26 
 
 
183 aa  53.5  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2949  amino acid-binding ACT domain-containing protein  37.33 
 
 
183 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  33.33 
 
 
400 aa  50.8  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0621  amino acid-binding ACT domain protein  31.96 
 
 
187 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1965  ACT domain-containing protein  39.13 
 
 
183 aa  49.7  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0493  amino acid-binding ACT domain protein  31.58 
 
 
165 aa  48.1  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  32.18 
 
 
404 aa  45.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3703  glycine cleavage system regulatory protein-like  29.67 
 
 
183 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  29.07 
 
 
398 aa  44.7  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2479  amino acid-binding ACT domain-containing protein  33.78 
 
 
183 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2199  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.38 
 
 
175 aa  41.6  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0596072  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0896  amino acid-binding ACT domain protein  39.44 
 
 
173 aa  42  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00320944  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  36.23 
 
 
404 aa  41.2  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1421  formyl transferase domain protein  33.8 
 
 
324 aa  40.8  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1251  formyl transferase domain protein  35.21 
 
 
327 aa  40  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>