97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1017 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1017  ACT domain-containing protein  100 
 
 		 95 aa  190  5e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.890596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0944  hypothetical protein  51.72 
 
 		 90 aa  94.7  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2117  hypothetical protein  51.72 
 
 		 90 aa  93.6  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1181  hypothetical protein  51.72 
 
 		 92 aa  93.2  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.254415  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0122  ACT domain-containing protein  54.02 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1378  hypothetical protein  50.57 
 
 		 93 aa  89.4  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000129759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1683  hypothetical protein  47.06 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2075  ACT domain-containing protein  40.66 
 
 		 114 aa  86.7  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1723  hypothetical protein  43.68 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0970  hypothetical protein  42.05 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05450  hypothetical protein  40.91 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.670978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1270  hypothetical protein  46.15 
 
 		 94 aa  84  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0918  hypothetical protein  45.35 
 
 		 90 aa  84  7e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0844317  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3182  hypothetical protein  47.78 
 
 		 92 aa  84  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  hitchhiker  0.00106731 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0612  hypothetical protein  47.78 
 
 		 92 aa  83.6  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287518  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0230  hypothetical protein  47.06 
 
 		 90 aa  83.6  9e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.867874  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1499  ACT domain-containing protein  42.05 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0342  ACT domain-containing protein  48.84 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0409  hypothetical protein  44.83 
 
 		 89 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.168136  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1534  hypothetical protein  43.53 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1126  hypothetical protein  40.66 
 
 		 100 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000365501  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0587  hypothetical protein  42.53 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11620  ACT domain-containing protein  51.16 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14440  hypothetical protein  44.83 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1354  hypothetical protein  42.86 
 
 		 93 aa  80.9  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3283  hypothetical protein  45.98 
 
 		 99 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1019  hypothetical protein  44.19 
 
 		 87 aa  79.3  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1671  hypothetical protein  37.89 
 
 		 100 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313942  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2798  hypothetical protein  39.08 
 
 		 90 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.019428  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1174  ACT domain protein  38.95 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.440111 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2268  hypothetical protein  37.5 
 
 		 90 aa  77  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2118  hypothetical protein  45.05 
 
 		 92 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2658  hypothetical protein  37.93 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1031  hypothetical protein  37.5 
 
 		 90 aa  75.1  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1470  hypothetical protein  41.86 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.461191  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0156  hypothetical protein  40.7 
 
 		 88 aa  73.6  0.0000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.936337  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0758  hypothetical protein  41.86 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.140436 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1034  hypothetical protein  43.53 
 
 		 90 aa  72.8  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1747  hypothetical protein  40.23 
 
 		 89 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0169419  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4121  ACT domain-containing protein  42.05 
 
 		 92 aa  69.3  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0861831  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0829  hypothetical protein  42.86 
 
 		 92 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0941  ACT domain-containing protein  33.72 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0440922  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2005  hypothetical protein  40.45 
 
 		 91 aa  61.2  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.388818 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0439  ACT domain-containing protein  34.48 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0912  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.187165 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0493  amino acid-binding ACT domain protein  35.37 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02138  glycine cleavage system transcriptional repressor  41.1 
 
 		 187 aa  52  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11679  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0621  amino acid-binding ACT domain protein  38.46 
 
 		 187 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0479  ACT domain-containing protein  38.81 
 
 		 183 aa  50.8  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2949  amino acid-binding ACT domain-containing protein  35.9 
 
 		 183 aa  50.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2199  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.25 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0596072  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1847  amino acid-binding ACT domain-containing protein  36.71 
 
 		 184 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00121314  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  36.11 
 
 		 400 aa  47.8  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  37.25 
 
 		 404 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3514  amino acid-binding ACT domain-containing protein  34.18 
 
 		 186 aa  47.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.160997  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  32.88 
 
 		 429 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3554  amino acid-binding ACT  35.71 
 
 		 189 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0217681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4711  formyl transferase domain protein  31.17 
 
 		 325 aa  46.2  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00446668  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  38.78 
 
 		 429 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1883  formyltetrahydrofolate deformylase  39.13 
 
 		 291 aa  45.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  31.51 
 
 		 404 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0527  amino acid-binding ACT domain protein  29.73 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3703  glycine cleavage system regulatory protein-like  33.33 
 
 		 183 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  30 
 
 		 404 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  36.73 
 
 		 418 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  36.73 
 
 		 418 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  37.84 
 
 		 404 aa  44.7  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2479  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.86 
 
 		 183 aa  44.3  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  30.14 
 
 		 404 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1421  formyl transferase domain protein  31.08 
 
 		 324 aa  44.3  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1965  ACT domain-containing protein  52.63 
 
 		 183 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0599  amino acid-binding ACT domain protein  32.89 
 
 		 173 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0437  ACT domain protein  32.89 
 
 		 173 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  28.57 
 
 		 415 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2533  glycine cleavage system regulatory protein  40 
 
 		 179 aa  42.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  28.57 
 
 		 404 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  28.57 
 
 		 404 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  30.14 
 
 		 410 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2903  phosphoserine phosphatase SerB  37.78 
 
 		 410 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.854311  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13058  phosphoserine phosphatase  24.42 
 
 		 409 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.128552 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4386  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.88 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.523733  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2382  formyltetrahydrofolate deformylase  32.93 
 
 		 285 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  31.91 
 
 		 405 aa  41.6  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  35.62 
 
 		 404 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3496  amino acid-binding ACT domain-containing protein  35.82 
 
 		 181 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8574  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  40.74 
 
 		 165 aa  41.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  36 
 
 		 398 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1251  formyl transferase domain protein  29.73 
 
 		 327 aa  40.8  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4707  amino acid-binding ACT domain-containing protein  46.51 
 
 		 170 aa  40.8  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4333  normal  0.012003 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0654  formyl transferase domain protein  29.73 
 
 		 316 aa  40.8  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2023  metal dependent phosphohydrolase  32.81 
 
 		 733 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000900888  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2219  formyl transferase domain protein  35.56 
 
 		 317 aa  40.4  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.46256  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4273  amino acid-binding ACT domain-containing protein  46.51 
 
 		 179 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340897  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0052  glycine cleavage system transcriptional repressor  29.33 
 
 		 179 aa  40.4  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.824677  normal  0.630988 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3457  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  32.39 
 
 		 185 aa  40.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0278  amino acid-binding ACT domain protein  22.97 
 
 		 196 aa  40.4  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.305725  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  28.38 
 
 		 405 aa  40  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>