86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2118 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2118  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  183  6e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0612  hypothetical protein  81.52 
 
 		 92 aa  153  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287518  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3182  hypothetical protein  72.83 
 
 		 92 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  hitchhiker  0.00106731 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0829  hypothetical protein  71.74 
 
 		 92 aa  121  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0230  hypothetical protein  58.14 
 
 		 90 aa  111  3e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.867874  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0918  hypothetical protein  55.81 
 
 		 90 aa  108  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0844317  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1534  hypothetical protein  52.33 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1683  hypothetical protein  53.49 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1671  hypothetical protein  49.45 
 
 		 100 aa  103  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313942  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1270  hypothetical protein  47.25 
 
 		 94 aa  100  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1354  hypothetical protein  47.25 
 
 		 93 aa  99.4  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3283  hypothetical protein  46.67 
 
 		 99 aa  98.2  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1378  hypothetical protein  50 
 
 		 93 aa  97.8  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000129759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0587  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  98.2  4e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14440  hypothetical protein  47.67 
 
 		 89 aa  94.7  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1723  hypothetical protein  48.86 
 
 		 89 aa  92  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0409  hypothetical protein  48.86 
 
 		 89 aa  89.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.168136  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0758  hypothetical protein  45.35 
 
 		 108 aa  87.8  5e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.140436 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2075  ACT domain-containing protein  37.5 
 
 		 114 aa  87  8e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0122  ACT domain-containing protein  45.45 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1034  hypothetical protein  45.35 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1499  ACT domain-containing protein  43.82 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1126  hypothetical protein  43.48 
 
 		 100 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000365501  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2117  hypothetical protein  44.32 
 
 		 90 aa  81.6  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1019  hypothetical protein  45.45 
 
 		 87 aa  80.5  0.000000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2005  hypothetical protein  46.51 
 
 		 91 aa  80.1  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.388818 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0342  ACT domain-containing protein  43.02 
 
 		 90 aa  80.1  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1747  hypothetical protein  43.02 
 
 		 89 aa  79  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0169419  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1181  hypothetical protein  39.13 
 
 		 92 aa  78.6  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.254415  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0944  hypothetical protein  39.33 
 
 		 90 aa  77.4  0.00000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1017  ACT domain-containing protein  45.05 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.890596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1174  ACT domain protein  40.91 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.440111 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4121  ACT domain-containing protein  42.7 
 
 		 92 aa  75.1  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0861831  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1470  hypothetical protein  40.91 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.461191  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0912  hypothetical protein  45.35 
 
 		 90 aa  73.9  0.0000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.187165 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05450  hypothetical protein  37.08 
 
 		 90 aa  73.2  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.670978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2798  hypothetical protein  38.2 
 
 		 90 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.019428  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0970  hypothetical protein  37.08 
 
 		 90 aa  72  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2268  hypothetical protein  37.08 
 
 		 90 aa  70.1  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1031  hypothetical protein  34.83 
 
 		 90 aa  66.6  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2658  hypothetical protein  35.96 
 
 		 90 aa  66.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11620  ACT domain-containing protein  39.77 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2949  amino acid-binding ACT domain-containing protein  36.17 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0439  ACT domain-containing protein  33.72 
 
 		 89 aa  62  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0941  ACT domain-containing protein  32.95 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0440922  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0156  hypothetical protein  39.33 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.936337  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3703  glycine cleavage system regulatory protein-like  31.87 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0493  amino acid-binding ACT domain protein  29.63 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0479  ACT domain-containing protein  31.18 
 
 		 183 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  30.23 
 
 		 400 aa  49.7  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2645  formyl transferase domain protein  30.86 
 
 		 316 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1251  formyl transferase domain protein  28.38 
 
 		 327 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0621  amino acid-binding ACT domain protein  28.09 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0654  formyl transferase domain protein  29.63 
 
 		 316 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0896  amino acid-binding ACT domain protein  28.57 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00320944  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1421  formyl transferase domain protein  32.43 
 
 		 324 aa  45.1  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4711  formyl transferase domain protein  29.63 
 
 		 325 aa  44.3  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00446668  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1965  ACT domain-containing protein  42.55 
 
 		 183 aa  43.9  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2199  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.33 
 
 		 175 aa  43.9  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0596072  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4273  amino acid-binding ACT domain-containing protein  26.51 
 
 		 179 aa  43.9  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340897  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3457  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  32.88 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0052  glycine cleavage system transcriptional repressor  29.27 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.824677  normal  0.630988 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45408  predicted protein  32.35 
 
 		 220 aa  43.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4707  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.92 
 
 		 170 aa  42.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4333  normal  0.012003 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2533  glycine cleavage system regulatory protein  42.55 
 
 		 179 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  31.94 
 
 		 404 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0826  amino acid-binding ACT domain protein  31.25 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.892136  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  39.22 
 
 		 411 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  38.3 
 
 		 418 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2380  glycine cleavage system transcriptional repressor (Gcv operon repressor)  43.75 
 
 		 175 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2975  glycine cleavage system transcriptional repressor  33.33 
 
 		 186 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.457313 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2856  glycine cleavage system transcriptional repressor  44.9 
 
 		 190 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2635  glycine cleavage system transcriptional repressor  44.9 
 
 		 190 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2724  glycine cleavage system transcriptional repressor  44.9 
 
 		 190 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2749  glycine cleavage system transcriptional repressor  44.9 
 
 		 190 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2683  glycine cleavage system transcriptional repressor  44.9 
 
 		 190 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0527  amino acid-binding ACT domain protein  36.17 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1979  amino acid-binding ACT domain-containing protein  37.5 
 
 		 178 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00211865  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3131  glycine cleavage system transcriptional repressor  31.25 
 
 		 204 aa  40.8  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.590147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  38.3 
 
 		 418 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1847  amino acid-binding ACT domain-containing protein  26.25 
 
 		 184 aa  40.8  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00121314  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3510  glycine cleavage system transcriptional repressor  30 
 
 		 228 aa  41.2  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.261645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1361  glycine cleavage system transcriptional repressor  31.25 
 
 		 204 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.243595  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1246  glycine cleavage system transcriptional repressor  31.25 
 
 		 189 aa  40.4  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0278  amino acid-binding ACT domain protein  26.51 
 
 		 196 aa  40.4  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.305725  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2479  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.58 
 
 		 183 aa  40.4  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>