124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45408 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_45408  predicted protein  100 
 
 		 220 aa  447  1e-125  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2002  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.21 
 
 		 173 aa  90.9  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4094  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.75 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0587  hypothetical protein  30.23 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000555119  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06310  ACT domain-containing protein  29.65 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183389  normal  0.204088 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0052  glycine cleavage system transcriptional repressor  28.73 
 
 		 179 aa  77.4  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.824677  normal  0.630988 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2229  amino acid-binding ACT domain protein  30.05 
 
 		 181 aa  77.4  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0964148 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2479  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.46 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5182  ACT domain-containing protein  29.82 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248291  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05930  ACT domain-containing regulatory protein  28.99 
 
 		 172 aa  73.9  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000527553  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3321  amino acid-binding ACT  28.24 
 
 		 170 aa  72  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0383  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.08 
 
 		 172 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000019763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4845  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.08 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92913  predicted protein  32.12 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00941527  normal  0.3672 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0826  amino acid-binding ACT domain protein  26.55 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.892136  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0385  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.08 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000250758  normal  0.230246 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1273  amino acid-binding ACT domain protein  30.34 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0357  ACT domain-containing protein  29.32 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000156308  normal  0.422502 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42571  predicted protein  29.69 
 
 		 1319 aa  69.3  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0896  amino acid-binding ACT domain protein  27.27 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00320944  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2525  glycine cleavage system transcriptional repressor  25.7 
 
 		 177 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2199  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.21 
 
 		 175 aa  68.2  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0596072  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0332  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.6 
 
 		 172 aa  68.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1150  cellulose-binding family II protein  26.86 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.768713 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4699  amino acid-binding ACT  32.61 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0000305264  normal  0.738616 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1697  amino acid-binding ACT domain-containing protein  27.78 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.54674 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0481  ACT domain protein  28.65 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000098406  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1356  amino acid-binding ACT domain-containing protein  26.35 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18740  glycine cleavage system regulatory protein  34.53 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.960027  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3457  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  26.52 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2628  ACT domain-containing protein  26.95 
 
 		 166 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1407  ACT domain-containing protein  26.47 
 
 		 166 aa  61.6  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.222833  normal  0.039362 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2746  amino acid-binding ACT domain-containing protein  27.54 
 
 		 166 aa  61.2  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.989316  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2561  ACT domain-containing protein  27.54 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2735  ACT domain-containing protein  27.54 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2819  amino acid-binding ACT domain protein  26.95 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.198658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1537  amino acid-binding ACT domain-containing protein  26.95 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1532  amino acid-binding ACT domain-containing protein  26.95 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0236669  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1565  amino acid-binding ACT domain-containing protein  26.95 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03152  ACT domain protein  27.65 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3169  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.95 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.765517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1433  amino acid-binding ACT domain-containing protein  25.75 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1500  amino acid-binding ACT domain-containing protein  27.95 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000613254  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1722  ACT domain-containing protein  26.95 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4173  formyl transferase-like  28 
 
 		 385 aa  58.9  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2985  amino acid-binding ACT domain protein  30.58 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0411  amino acid-binding ACT domain protein  24.16 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.404844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1071  amino acid-binding ACT domain protein  29.84 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2032  amino acid-binding ACT domain protein  33.08 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0169147  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2611  glycine cleavage system transcriptional repressor  26.22 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2761  glycine cleavage system transcriptional repressor  26.22 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2851  glycine cleavage system transcriptional repressor  26.22 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02371  DNA-binding transcriptional repressor, regulatory protein accessory to GcvA  26.8 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1190  amino acid-binding ACT domain protein  26.8 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02333  hypothetical protein  26.8 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3496  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.16 
 
 		 181 aa  53.9  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3701  glycine cleavage system transcriptional repressor  26.8 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2975  glycine cleavage system transcriptional repressor  29.03 
 
 		 186 aa  53.9  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.457313 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1136  glycine cleavage system transcriptional repressor  30.3 
 
 		 183 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3180  glycine cleavage system transcriptional repressor  30.23 
 
 		 183 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1197  glycine cleavage system transcriptional repressor  26.8 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2626  glycine cleavage system transcriptional repressor  26.8 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2683  glycine cleavage system transcriptional repressor  28.69 
 
 		 190 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2749  glycine cleavage system transcriptional repressor  28.69 
 
 		 190 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2724  glycine cleavage system transcriptional repressor  28.69 
 
 		 190 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2635  glycine cleavage system transcriptional repressor  28.69 
 
 		 190 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2856  glycine cleavage system transcriptional repressor  28.69 
 
 		 190 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3954  hypothetical protein  24.43 
 
 		 187 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.48734  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3185  glycine cleavage system transcriptional repressor  25.53 
 
 		 176 aa  52.4  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.168662  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0527  amino acid-binding ACT domain protein  27.64 
 
 		 185 aa  52.4  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0493  amino acid-binding ACT domain protein  23.3 
 
 		 165 aa  52.8  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2380  glycine cleavage system transcriptional repressor (Gcv operon repressor)  25.75 
 
 		 175 aa  52.4  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3885  ACT domain-containing protein  25.73 
 
 		 165 aa  52  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4388  hypothetical protein  24.59 
 
 		 185 aa  52  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1662  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  23.3 
 
 		 185 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1547  glycine cleavage system transcriptional repressor  23.86 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4055  amino acid-binding ACT domain protein  25.68 
 
 		 188 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1739  putative glycine cleavage system transcriptional repressor  26.92 
 
 		 180 aa  51.2  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3514  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.08 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.160997  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1246  glycine cleavage system transcriptional repressor  26.06 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002792  glycine cleavage system transcriptional antiactivator GcvR  24.12 
 
 		 180 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3131  glycine cleavage system transcriptional repressor  26.06 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.590147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1361  glycine cleavage system transcriptional repressor  26.06 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.243595  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3969  amino acid-binding ACT domain protein  28.03 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100488  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51280  hypothetical protein  23.5 
 
 		 185 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000412159 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1943  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.15 
 
 		 175 aa  49.7  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2585  amino acid-binding ACT  24.44 
 
 		 168 aa  48.9  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2533  glycine cleavage system regulatory protein  24.32 
 
 		 179 aa  48.5  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0437  ACT domain protein  25.17 
 
 		 173 aa  48.5  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0599  amino acid-binding ACT domain protein  25.17 
 
 		 173 aa  48.5  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3554  amino acid-binding ACT  27.05 
 
 		 189 aa  48.5  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0217681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1847  amino acid-binding ACT domain-containing protein  24.14 
 
 		 184 aa  48.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00121314  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4386  amino acid-binding ACT domain-containing protein  25.41 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.523733  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2431  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.57 
 
 		 179 aa  48.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0267912  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3510  glycine cleavage system transcriptional repressor  28.93 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.261645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0479  ACT domain-containing protein  27.27 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1979  amino acid-binding ACT domain-containing protein  24.28 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00211865  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3976  glycine cleavage system transcriptional repressor  21.26 
 
 		 186 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2949  amino acid-binding ACT domain-containing protein  25 
 
 		 183 aa  45.8  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2591  amino acid-binding ACT domain-containing protein  20.57 
 
 		 183 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000275101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>