80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42571 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42571  predicted protein  100 
 
 		 1319 aa  2735    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33768  predicted protein  39.13 
 
 		 276 aa  146  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31584  predicted protein  33.08 
 
 		 618 aa  119  5e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00000066135  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_17041  predicted protein  26.09 
 
 		 379 aa  100  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.852844  normal  0.0273457 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42729  predicted protein  27.4 
 
 		 1003 aa  93.6  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27860  predicted protein  31.22 
 
 		 409 aa  92.8  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.572712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59469  predicted protein  24.87 
 
 		 701 aa  81.6  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_3954  predicted protein  23.97 
 
 		 344 aa  81.3  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07360  ubiquitin-specific protease, putative  25.12 
 
 		 1312 aa  80.1  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12752  predicted protein  25.06 
 
 		 348 aa  80.1  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62413  predicted protein  25.39 
 
 		 848 aa  79.3  0.0000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47364  predicted protein  36.59 
 
 		 226 aa  74.3  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.697411  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4094  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.55 
 
 		 172 aa  70.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_3692  predicted protein  24.49 
 
 		 347 aa  70.5  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45408  predicted protein  29.69 
 
 		 220 aa  68.9  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4845  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.77 
 
 		 172 aa  68.2  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_2936  predicted protein  23.5 
 
 		 344 aa  68.2  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0481  ACT domain protein  29.13 
 
 		 172 aa  65.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000098406  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87099  predicted protein  22.88 
 
 		 830 aa  64.7  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000037034  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2002  amino acid-binding ACT domain-containing protein  34.4 
 
 		 173 aa  64.7  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4699  amino acid-binding ACT  30.47 
 
 		 180 aa  63.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0000305264  normal  0.738616 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0587  hypothetical protein  31.25 
 
 		 171 aa  63.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000555119  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01600  conserved hypothetical protein  22.9 
 
 		 728 aa  63.5  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5182  ACT domain-containing protein  25.3 
 
 		 172 aa  63.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248291  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06310  ACT domain-containing protein  27.11 
 
 		 171 aa  63.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183389  normal  0.204088 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0385  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.23 
 
 		 172 aa  62.4  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000250758  normal  0.230246 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39658  predicted protein  25.39 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.334345  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02660  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14, putative  23.02 
 
 		 796 aa  61.2  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.989129  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7358  predicted protein  30.46 
 
 		 184 aa  60.8  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.61572  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05930  ACT domain-containing regulatory protein  30.71 
 
 		 172 aa  60.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000527553  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03680  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, putative  27.39 
 
 		 1490 aa  59.7  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.920906  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2229  amino acid-binding ACT domain protein  30.18 
 
 		 181 aa  58.9  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0964148 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47704  predicted protein  35.66 
 
 		 1183 aa  58.5  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59800  predicted protein  21.79 
 
 		 489 aa  57.8  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32361  predicted protein  21.48 
 
 		 565 aa  58.2  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.136395 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4173  formyl transferase-like  27.87 
 
 		 385 aa  58.2  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06354  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14130)  29.57 
 
 		 1418 aa  57  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.387584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0896  amino acid-binding ACT domain protein  25 
 
 		 173 aa  57  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00320944  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_69820  predicted protein  27.33 
 
 		 1340 aa  56.6  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05186  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07160)  24.26 
 
 		 840 aa  56.6  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000787837  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0357  ACT domain-containing protein  28.46 
 
 		 172 aa  56.6  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000156308  normal  0.422502 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39993  predicted protein  27.22 
 
 		 688 aa  56.2  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000426118  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07422  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G06330)  25.7 
 
 		 697 aa  55.8  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.942281  hitchhiker  0.000000000000044106 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0052  glycine cleavage system transcriptional repressor  28.79 
 
 		 179 aa  55.8  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.824677  normal  0.630988 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_5433  predicted protein  23.81 
 
 		 316 aa  55.5  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1273  amino acid-binding ACT domain protein  31.82 
 
 		 177 aa  55.5  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6409  predicted protein  24.3 
 
 		 334 aa  55.5  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31436  predicted protein  26.9 
 
 		 238 aa  55.1  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0440287  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22819  predicted protein  26.11 
 
 		 185 aa  55.1  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.134884  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18740  glycine cleavage system regulatory protein  25.16 
 
 		 181 aa  55.1  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.960027  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0383  amino acid-binding ACT domain-containing protein  27.69 
 
 		 172 aa  54.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000019763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30479  predicted protein  24.74 
 
 		 240 aa  53.9  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03587  Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase (EC 3.1.2.15) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96V54]  21.75 
 
 		 766 aa  52.8  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_62908  predicted protein  22.85 
 
 		 879 aa  52.4  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04350  conserved hypothetical protein  22.65 
 
 		 576 aa  51.6  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3457  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  24.44 
 
 		 185 aa  51.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_974  predicted protein  27.7 
 
 		 603 aa  50.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000875731  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0332  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.69 
 
 		 172 aa  49.7  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_65573  predicted protein  28.46 
 
 		 803 aa  50.1  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.227667 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2479  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.82 
 
 		 183 aa  49.7  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42565  predicted protein  29.35 
 
 		 417 aa  49.7  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.19029  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03711  ubiquitin C-terminal hydrolase Ubp8, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12710)  25.27 
 
 		 484 aa  49.7  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.954307  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3885  ACT domain-containing protein  25.14 
 
 		 165 aa  49.3  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3185  glycine cleavage system transcriptional repressor  28.91 
 
 		 176 aa  49.3  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.168662  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44745  predicted protein  25 
 
 		 1075 aa  48.9  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.362492  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0826  amino acid-binding ACT domain protein  25.78 
 
 		 184 aa  47.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.892136  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21982  predicted protein  32.54 
 
 		 641 aa  47.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0411  amino acid-binding ACT domain protein  25.74 
 
 		 184 aa  47.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.404844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1863  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  27.61 
 
 		 178 aa  46.6  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000211112  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_13360  predicted protein  23.86 
 
 		 461 aa  46.6  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000134973 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02267  ubiquitin C-terminal hydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G06440)  33.33 
 
 		 744 aa  47  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.296883  normal  0.917621 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46434  predicted protein  23.58 
 
 		 631 aa  46.2  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2533  glycine cleavage system regulatory protein  25.68 
 
 		 179 aa  46.2  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4512  predicted protein  24.56 
 
 		 312 aa  46.6  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.873462  normal  0.145734 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_29340  predicted protein  26.62 
 
 		 499 aa  45.4  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.210564  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0527  amino acid-binding ACT domain protein  21.55 
 
 		 185 aa  45.4  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1407  ACT domain-containing protein  22.09 
 
 		 166 aa  45.4  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.222833  normal  0.039362 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1847  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.13 
 
 		 184 aa  45.1  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00121314  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1150  cellulose-binding family II protein  19.55 
 
 		 178 aa  45.1  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.768713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1943  amino acid-binding ACT domain-containing protein  24.84 
 
 		 175 aa  45.1  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>