38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_65573 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_65573  predicted protein  100 
 
 
803 aa  1655    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.227667 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02660  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14, putative  36.62 
 
 
796 aa  509  1e-143  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.989129  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07422  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G06330)  39.05 
 
 
697 aa  489  1e-136  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.942281  hitchhiker  0.000000000000044106 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87099  predicted protein  28.98 
 
 
830 aa  301  3e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000037034  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18008  predicted protein  28 
 
 
844 aa  258  2e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32361  predicted protein  24.27 
 
 
565 aa  80.1  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.136395 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02072  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04720)  23.94 
 
 
1022 aa  64.3  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.701074 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06354  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14130)  32.77 
 
 
1418 aa  60.1  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.387584  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59469  predicted protein  22.1 
 
 
701 aa  57.8  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185317  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04170  conserved hypothetical protein  44.44 
 
 
696 aa  57.4  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.557768  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35196  predicted protein  42.59 
 
 
328 aa  55.5  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07360  ubiquitin-specific protease, putative  30.88 
 
 
1312 aa  55.1  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_2936  predicted protein  21.62 
 
 
344 aa  53.5  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42729  predicted protein  25.97 
 
 
1003 aa  53.9  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58891  predicted protein  42.11 
 
 
596 aa  53.1  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0650086  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12752  predicted protein  24.07 
 
 
348 aa  53.5  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62413  predicted protein  22.86 
 
 
848 aa  52  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.776839  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03680  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, putative  28.91 
 
 
1490 aa  52  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.920906  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39993  predicted protein  30 
 
 
688 aa  52.4  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000426118  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31584  predicted protein  30.17 
 
 
618 aa  52  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00000066135  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_90001  Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase  24.12 
 
 
1322 aa  52  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_3692  predicted protein  22.37 
 
 
347 aa  51.6  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10251  RING and UBP finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10360)  38.1 
 
 
503 aa  50.4  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47704  predicted protein  28.68 
 
 
1183 aa  50.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42571  predicted protein  28.46 
 
 
1319 aa  49.7  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03711  ubiquitin C-terminal hydrolase Ubp8, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12710)  21.93 
 
 
484 aa  49.3  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.954307  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37903  deubiquitinating enzyme  36.36 
 
 
481 aa  48.9  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.816359  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6409  predicted protein  25.72 
 
 
334 aa  48.9  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03587  Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase (EC 3.1.2.15) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96V54]  23.86 
 
 
766 aa  48.5  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36349  predicted protein  23.05 
 
 
1127 aa  48.1  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0304624  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_3954  predicted protein  20.91 
 
 
344 aa  47.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11102  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02380)  41.07 
 
 
572 aa  47.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.235915  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94593  predicted protein  36.49 
 
 
377 aa  46.6  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_29340  predicted protein  31.43 
 
 
499 aa  47  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.210564  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34718  predicted protein  36.36 
 
 
475 aa  45.8  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.151191  normal  0.0293051 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_69820  predicted protein  31.36 
 
 
1340 aa  46.2  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_974  predicted protein  28.15 
 
 
603 aa  45.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000875731  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04540  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, putative  30.77 
 
 
484 aa  45.1  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>