55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_3692 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_3692  predicted protein  100 
 
 
347 aa  732    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07360  ubiquitin-specific protease, putative  39.62 
 
 
1312 aa  269  5e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12752  predicted protein  40.28 
 
 
348 aa  258  1e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39993  predicted protein  47.34 
 
 
688 aa  197  3e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000426118  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62413  predicted protein  32.11 
 
 
848 aa  194  3e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.776839  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_2936  predicted protein  33.05 
 
 
344 aa  191  2e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47704  predicted protein  48.42 
 
 
1183 aa  184  1.0000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03680  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, putative  46.67 
 
 
1490 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.920906  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02072  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04720)  28.91 
 
 
1022 aa  166  6.9999999999999995e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.701074 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_69820  predicted protein  40.82 
 
 
1340 aa  163  5.0000000000000005e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06354  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14130)  41.8 
 
 
1418 aa  159  5e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.387584  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_974  predicted protein  42.36 
 
 
603 aa  155  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000875731  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21982  predicted protein  37.76 
 
 
641 aa  136  7.000000000000001e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42729  predicted protein  28.42 
 
 
1003 aa  125  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_5433  predicted protein  27.71 
 
 
316 aa  123  5e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39658  predicted protein  27.39 
 
 
311 aa  122  9e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.334345  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04350  conserved hypothetical protein  28.69 
 
 
576 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4512  predicted protein  29.43 
 
 
312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.873462  normal  0.145734 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32361  predicted protein  25.14 
 
 
565 aa  101  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.136395 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59469  predicted protein  25.14 
 
 
701 aa  97.8  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185317  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_62908  predicted protein  24.71 
 
 
879 aa  97.1  5e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15310  predicted protein  33.53 
 
 
190 aa  90.1  5e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.804518  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6409  predicted protein  24.06 
 
 
334 aa  86.7  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02890  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, putative  25.38 
 
 
1113 aa  84  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00640  conserved hypothetical protein  24.31 
 
 
1209 aa  81.3  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.334737  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_3954  predicted protein  24.59 
 
 
344 aa  80.1  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44745  predicted protein  27.97 
 
 
1075 aa  80.1  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.362492  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36349  predicted protein  24.78 
 
 
1127 aa  78.2  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0304624  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46434  predicted protein  23.2 
 
 
631 aa  77.8  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05186  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07160)  22.43 
 
 
840 aa  78.2  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000787837  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01600  conserved hypothetical protein  24.75 
 
 
728 aa  78.6  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28684  predicted protein  23.8 
 
 
474 aa  76.6  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_90001  Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase  24.78 
 
 
1322 aa  75.9  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59800  predicted protein  22.98 
 
 
489 aa  73.6  0.000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03711  ubiquitin C-terminal hydrolase Ubp8, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12710)  27.07 
 
 
484 aa  73.2  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.954307  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42571  predicted protein  24.23 
 
 
1319 aa  70.1  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03800  ubiquitin specific protease, putative  24.03 
 
 
599 aa  69.3  0.00000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87051  predicted protein  25.47 
 
 
714 aa  68.6  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.168813  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03587  Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase (EC 3.1.2.15) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96V54]  29.85 
 
 
766 aa  67  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00100  ubiquitin-specific protease, putative  24.23 
 
 
1099 aa  64.7  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0377728  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06164  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08440)  23.88 
 
 
2510 aa  65.1  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0773331  normal  0.0726858 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46080  predicted protein  24.11 
 
 
1370 aa  64.3  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87099  predicted protein  21.72 
 
 
830 aa  63.2  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000037034  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07422  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G06330)  24.4 
 
 
697 aa  61.2  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.942281  hitchhiker  0.000000000000044106 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02660  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14, putative  20.54 
 
 
796 aa  60.1  0.00000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.989129  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_17041  predicted protein  20.11 
 
 
379 aa  55.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.852844  normal  0.0273457 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40154  predicted protein  26.6 
 
 
319 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46292  predicted protein  21.71 
 
 
772 aa  51.2  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_65573  predicted protein  22.37 
 
 
803 aa  51.6  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.227667 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01280  conserved hypothetical protein  22.64 
 
 
562 aa  51.2  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04458  snRNP assembly factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07520)  27.93 
 
 
616 aa  49.7  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.472172  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31584  predicted protein  24.24 
 
 
618 aa  47.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00000066135  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2491  predicted protein  26.28 
 
 
423 aa  46.6  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000443928  normal  0.292142 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_29340  predicted protein  21.26 
 
 
499 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.210564  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37903  deubiquitinating enzyme  33.33 
 
 
481 aa  43.5  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.816359  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>