40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_974 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_974  predicted protein  100 
 
 
603 aa  1271    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000875731  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03680  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, putative  37.25 
 
 
1490 aa  223  9.999999999999999e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.920906  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39993  predicted protein  44.29 
 
 
688 aa  191  4e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000426118  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12752  predicted protein  43.84 
 
 
348 aa  177  4e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47704  predicted protein  34.47 
 
 
1183 aa  177  7e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_69820  predicted protein  36.27 
 
 
1340 aa  168  2.9999999999999998e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07360  ubiquitin-specific protease, putative  37.33 
 
 
1312 aa  159  1e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06354  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14130)  33.67 
 
 
1418 aa  156  9e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.387584  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_3692  predicted protein  41.15 
 
 
347 aa  155  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21982  predicted protein  38.36 
 
 
641 aa  150  6e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_2936  predicted protein  36.71 
 
 
344 aa  122  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62413  predicted protein  34.06 
 
 
848 aa  112  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.776839  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02072  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04720)  32.78 
 
 
1022 aa  89  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.701074 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39658  predicted protein  31.82 
 
 
311 aa  78.2  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.334345  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6409  predicted protein  33.54 
 
 
334 aa  75.1  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_5433  predicted protein  30.66 
 
 
316 aa  75.5  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42729  predicted protein  30.29 
 
 
1003 aa  71.2  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32361  predicted protein  29.33 
 
 
565 aa  70.5  0.00000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.136395 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4512  predicted protein  31.72 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.873462  normal  0.145734 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03587  Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase (EC 3.1.2.15) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96V54]  30.82 
 
 
766 aa  66.6  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59469  predicted protein  30.71 
 
 
701 aa  65.9  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185317  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04350  conserved hypothetical protein  30.97 
 
 
576 aa  66.2  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_3954  predicted protein  29.52 
 
 
344 aa  62.8  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44745  predicted protein  29.37 
 
 
1075 aa  59.3  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.362492  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01600  conserved hypothetical protein  26.58 
 
 
728 aa  59.3  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03711  ubiquitin C-terminal hydrolase Ubp8, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12710)  24.37 
 
 
484 aa  57.8  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.954307  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05186  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07160)  30.41 
 
 
840 aa  57.8  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000787837  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87051  predicted protein  27.74 
 
 
714 aa  56.6  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.168813  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36349  predicted protein  30.34 
 
 
1127 aa  56.2  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0304624  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46434  predicted protein  31.72 
 
 
631 aa  53.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_62908  predicted protein  24.23 
 
 
879 aa  51.6  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42571  predicted protein  27.7 
 
 
1319 aa  50.8  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15310  predicted protein  23.81 
 
 
190 aa  50.8  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.804518  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87099  predicted protein  22.78 
 
 
830 aa  48.1  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000037034  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59800  predicted protein  28.92 
 
 
489 aa  47.8  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03800  ubiquitin specific protease, putative  29.88 
 
 
599 aa  47.4  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02890  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, putative  30.83 
 
 
1113 aa  47  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_65573  predicted protein  28.15 
 
 
803 aa  45.1  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.227667 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06164  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08440)  30.53 
 
 
2510 aa  44.3  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0773331  normal  0.0726858 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31584  predicted protein  28.36 
 
 
618 aa  43.9  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00000066135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>