47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA07360 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA07360  ubiquitin-specific protease, putative  100 
 
 
1312 aa  2692    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62413  predicted protein  39.45 
 
 
848 aa  296  1e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.776839  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_3692  predicted protein  39.62 
 
 
347 aa  269  2e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12752  predicted protein  36.7 
 
 
348 aa  254  1e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02072  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04720)  37.43 
 
 
1022 aa  250  1e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.701074 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_2936  predicted protein  34.96 
 
 
344 aa  213  2e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03680  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, putative  41.35 
 
 
1490 aa  196  3e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.920906  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39993  predicted protein  45.77 
 
 
688 aa  193  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000426118  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47704  predicted protein  44.16 
 
 
1183 aa  177  9.999999999999999e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06354  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14130)  42.35 
 
 
1418 aa  172  4e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.387584  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_974  predicted protein  37.33 
 
 
603 aa  159  3e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000875731  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_69820  predicted protein  42.05 
 
 
1340 aa  158  7e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42729  predicted protein  28.87 
 
 
1003 aa  133  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_62908  predicted protein  25.74 
 
 
879 aa  131  9.000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21982  predicted protein  35.75 
 
 
641 aa  128  8.000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_5433  predicted protein  29.32 
 
 
316 aa  126  3e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4512  predicted protein  28.07 
 
 
312 aa  124  8e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.873462  normal  0.145734 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04350  conserved hypothetical protein  28.88 
 
 
576 aa  121  7.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39658  predicted protein  26.4 
 
 
311 aa  115  4.0000000000000004e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.334345  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44745  predicted protein  29.43 
 
 
1075 aa  108  7e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.362492  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32361  predicted protein  24.3 
 
 
565 aa  102  5e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.136395 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_3954  predicted protein  25.71 
 
 
344 aa  101  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6409  predicted protein  25.54 
 
 
334 aa  95.9  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03711  ubiquitin C-terminal hydrolase Ubp8, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12710)  24.47 
 
 
484 aa  91.7  8e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.954307  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87051  predicted protein  23.49 
 
 
714 aa  90.9  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.168813  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01600  conserved hypothetical protein  23.38 
 
 
728 aa  89.7  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59469  predicted protein  23.91 
 
 
701 aa  88.6  8e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185317  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05186  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07160)  25.38 
 
 
840 aa  86.3  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000787837  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46434  predicted protein  25.75 
 
 
631 aa  84.3  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15310  predicted protein  31.96 
 
 
190 aa  83.6  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.804518  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03800  ubiquitin specific protease, putative  23.39 
 
 
599 aa  82.4  0.00000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02890  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, putative  26.2 
 
 
1113 aa  82  0.00000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42571  predicted protein  24.64 
 
 
1319 aa  79.7  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03587  Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase (EC 3.1.2.15) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96V54]  23.7 
 
 
766 aa  79.7  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00640  conserved hypothetical protein  23.24 
 
 
1209 aa  75.9  0.000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.334737  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36349  predicted protein  27.33 
 
 
1127 aa  67  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0304624  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59800  predicted protein  23.63 
 
 
489 aa  66.2  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01280  conserved hypothetical protein  22.37 
 
 
562 aa  65.1  0.000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_90001  Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase  23.78 
 
 
1322 aa  63.2  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31584  predicted protein  25.86 
 
 
618 aa  62.4  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00000066135  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07422  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G06330)  22.8 
 
 
697 aa  56.2  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.942281  hitchhiker  0.000000000000044106 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_65573  predicted protein  32.12 
 
 
803 aa  55.1  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.227667 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28684  predicted protein  22.91 
 
 
474 aa  53.1  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87099  predicted protein  20.63 
 
 
830 aa  52.8  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000037034  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02660  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14, putative  21.79 
 
 
796 aa  52  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.989129  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2491  predicted protein  28.17 
 
 
423 aa  47.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000443928  normal  0.292142 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04458  snRNP assembly factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07520)  23.03 
 
 
616 aa  47.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.472172  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>