46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47704 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_47704  predicted protein  100 
 
 		 1183 aa  2477    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39993  predicted protein  43.92 
 
 		 688 aa  225  4.9999999999999996e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000426118  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03680  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, putative  41.46 
 
 		 1490 aa  212  4e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.920906  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06354  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14130)  34.24 
 
 		 1418 aa  203  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.387584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_69820  predicted protein  31.69 
 
 		 1340 aa  191  8e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_3692  predicted protein  48.42 
 
 		 347 aa  185  5.0000000000000004e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12752  predicted protein  47.15 
 
 		 348 aa  177  9.999999999999999e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07360  ubiquitin-specific protease, putative  44.16 
 
 		 1312 aa  177  9.999999999999999e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_974  predicted protein  34.47 
 
 		 603 aa  177  9.999999999999999e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000875731  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21982  predicted protein  35.11 
 
 		 641 aa  141  6e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_2936  predicted protein  38.1 
 
 		 344 aa  122  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62413  predicted protein  34.95 
 
 		 848 aa  118  8.999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.776839  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02072  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04720)  31.98 
 
 		 1022 aa  103  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.701074 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39658  predicted protein  37.11 
 
 		 311 aa  99  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.334345  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32361  predicted protein  30.63 
 
 		 565 aa  76.3  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.136395 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6409  predicted protein  33.54 
 
 		 334 aa  75.9  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03711  ubiquitin C-terminal hydrolase Ubp8, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12710)  30.11 
 
 		 484 aa  73.6  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.954307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_5433  predicted protein  32.14 
 
 		 316 aa  73.2  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_62908  predicted protein  25.96 
 
 		 879 aa  68.2  0.0000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42729  predicted protein  28.28 
 
 		 1003 aa  67.4  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03587  Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase (EC 3.1.2.15) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96V54]  29.94 
 
 		 766 aa  66.6  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44745  predicted protein  30.86 
 
 		 1075 aa  66.2  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.362492  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_3954  predicted protein  33.55 
 
 		 344 aa  66.6  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87051  predicted protein  30.87 
 
 		 714 aa  63.9  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.168813  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04350  conserved hypothetical protein  28.39 
 
 		 576 aa  60.5  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15310  predicted protein  33.87 
 
 		 190 aa  58.9  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.804518  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42571  predicted protein  35.66 
 
 		 1319 aa  58.5  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01600  conserved hypothetical protein  25.5 
 
 		 728 aa  57.4  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59469  predicted protein  27.81 
 
 		 701 aa  57  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4512  predicted protein  29.1 
 
 		 312 aa  55.5  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.873462  normal  0.145734 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31584  predicted protein  28.8 
 
 		 618 aa  53.1  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00000066135  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28684  predicted protein  32.61 
 
 		 474 aa  52.8  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03800  ubiquitin specific protease, putative  31.98 
 
 		 599 aa  52.8  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_65573  predicted protein  28.68 
 
 		 803 aa  50.4  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.227667 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59800  predicted protein  32.09 
 
 		 489 aa  49.7  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_17041  predicted protein  24.82 
 
 		 379 aa  50.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.852844  normal  0.0273457 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05186  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07160)  26.71 
 
 		 840 aa  49.3  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000787837  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04458  snRNP assembly factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07520)  27.97 
 
 		 616 aa  48.5  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.472172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87099  predicted protein  24.07 
 
 		 830 aa  48.5  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000037034  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_90001  Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase  27.63 
 
 		 1322 aa  47.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61453  ubiquitin specific protease  27.48 
 
 		 489 aa  46.6  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.981787  normal  0.483859 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_29340  predicted protein  34.4 
 
 		 499 aa  46.6  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.210564  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02660  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14, putative  29.76 
 
 		 796 aa  46.6  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.989129  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46080  predicted protein  25.84 
 
 		 1370 aa  45.4  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36349  predicted protein  29.73 
 
 		 1127 aa  44.7  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0304624  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54531  predicted protein  28.15 
 
 		 558 aa  44.7  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.737555  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>