30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_29340 on replicon NC_011684
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011684  PHATRDRAFT_29340  predicted protein  100 
 
 		 499 aa  1037    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.210564  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_13360  predicted protein  36.58 
 
 		 461 aa  263  6e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000134973 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04540  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, putative  32.18 
 
 		 484 aa  219  7.999999999999999e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11102  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02380)  30.51 
 
 		 572 aa  217  4e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.235915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37903  deubiquitinating enzyme  30.24 
 
 		 481 aa  184  4.0000000000000006e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.816359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42729  predicted protein  24.63 
 
 		 1003 aa  70.1  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46080  predicted protein  26.01 
 
 		 1370 aa  67  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04350  conserved hypothetical protein  22.43 
 
 		 576 aa  60.5  0.00000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05186  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07160)  23.08 
 
 		 840 aa  58.2  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000787837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15310  predicted protein  22.69 
 
 		 190 aa  54.7  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.804518  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02890  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, putative  22.61 
 
 		 1113 aa  53.1  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03711  ubiquitin C-terminal hydrolase Ubp8, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12710)  21.59 
 
 		 484 aa  51.2  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.954307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87099  predicted protein  24.51 
 
 		 830 aa  50.1  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000037034  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07422  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G06330)  31.79 
 
 		 697 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.942281  hitchhiker  0.000000000000044106 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_2936  predicted protein  33.33 
 
 		 344 aa  49.7  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06913  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13620)  23.62 
 
 		 630 aa  48.5  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.886513 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_5433  predicted protein  33.33 
 
 		 316 aa  47.4  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_65573  predicted protein  31.43 
 
 		 803 aa  47  0.0009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.227667 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_3954  predicted protein  25.32 
 
 		 344 aa  46.6  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62413  predicted protein  26.8 
 
 		 848 aa  46.2  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_90001  Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase  22.38 
 
 		 1322 aa  46.6  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47704  predicted protein  34.4 
 
 		 1183 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39658  predicted protein  25.26 
 
 		 311 aa  45.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.334345  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_3692  predicted protein  21.26 
 
 		 347 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03680  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, putative  32.11 
 
 		 1490 aa  45.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.920906  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03800  ubiquitin specific protease, putative  26.63 
 
 		 599 aa  45.8  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42571  predicted protein  26.62 
 
 		 1319 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40154  predicted protein  31.36 
 
 		 319 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46434  predicted protein  33.85 
 
 		 631 aa  44.7  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06354  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14130)  28.99 
 
 		 1418 aa  44.7  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.387584  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>