25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_37903 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_37903  deubiquitinating enzyme  100 
 
 
481 aa  979    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.816359  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11102  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02380)  38.2 
 
 
572 aa  344  2.9999999999999997e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.235915  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04540  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, putative  36.31 
 
 
484 aa  272  8.000000000000001e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_13360  predicted protein  31.58 
 
 
461 aa  226  7e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000134973 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_29340  predicted protein  30.24 
 
 
499 aa  184  4.0000000000000006e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.210564  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_3954  predicted protein  26.12 
 
 
344 aa  69.7  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_69820  predicted protein  29.71 
 
 
1340 aa  51.2  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46080  predicted protein  35.71 
 
 
1370 aa  50.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06164  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08440)  34 
 
 
2510 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0773331  normal  0.0726858 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02890  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, putative  24.8 
 
 
1113 aa  49.3  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_65573  predicted protein  36.36 
 
 
803 aa  48.9  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.227667 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03587  Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase (EC 3.1.2.15) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96V54]  32.93 
 
 
766 aa  48.5  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39658  predicted protein  36.67 
 
 
311 aa  48.5  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.334345  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02072  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04720)  21.71 
 
 
1022 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.701074 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36349  predicted protein  32.86 
 
 
1127 aa  47.8  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0304624  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40154  predicted protein  27.41 
 
 
319 aa  47.8  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01600  conserved hypothetical protein  25 
 
 
728 aa  46.6  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46292  predicted protein  28.1 
 
 
772 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87099  predicted protein  27.74 
 
 
830 aa  45.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000037034  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_5433  predicted protein  33.33 
 
 
316 aa  45.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03800  ubiquitin specific protease, putative  42.55 
 
 
599 aa  44.3  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02660  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14, putative  27.74 
 
 
796 aa  44.3  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.989129  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07422  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G06330)  34.12 
 
 
697 aa  44.3  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.942281  hitchhiker  0.000000000000044106 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46434  predicted protein  35.42 
 
 
631 aa  43.9  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_3692  predicted protein  33.33 
 
 
347 aa  43.5  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>