26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_40154 on replicon NC_011690
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011690  PHATRDRAFT_40154  predicted protein  100 
 
 
319 aa  654    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36349  predicted protein  32.16 
 
 
1127 aa  89  9e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0304624  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02890  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, putative  25.74 
 
 
1113 aa  71.6  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_3954  predicted protein  27.05 
 
 
344 aa  69.3  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_90001  Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase  25.98 
 
 
1322 aa  66.2  0.0000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_5433  predicted protein  24.2 
 
 
316 aa  58.5  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03711  ubiquitin C-terminal hydrolase Ubp8, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12710)  23.64 
 
 
484 aa  55.8  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.954307  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32361  predicted protein  23.1 
 
 
565 aa  55.5  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.136395 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12752  predicted protein  25.91 
 
 
348 aa  53.9  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11102  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02380)  23.65 
 
 
572 aa  53.1  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.235915  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04350  conserved hypothetical protein  24.22 
 
 
576 aa  52  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_3692  predicted protein  26.6 
 
 
347 aa  52  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15310  predicted protein  30.57 
 
 
190 aa  49.3  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.804518  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48002  predicted protein  34.07 
 
 
1239 aa  49.3  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.483888  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4512  predicted protein  29.94 
 
 
312 aa  49.3  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.873462  normal  0.145734 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46292  predicted protein  25.51 
 
 
772 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_69820  predicted protein  27.33 
 
 
1340 aa  47.4  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59469  predicted protein  21.85 
 
 
701 aa  47.8  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185317  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37903  deubiquitinating enzyme  27.41 
 
 
481 aa  47.4  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.816359  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_13360  predicted protein  23.68 
 
 
461 aa  47.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000134973 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06354  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14130)  32.52 
 
 
1418 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.387584  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06164  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08440)  24.52 
 
 
2510 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0773331  normal  0.0726858 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_29340  predicted protein  31.36 
 
 
499 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.210564  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_2936  predicted protein  24.91 
 
 
344 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03587  Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase (EC 3.1.2.15) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96V54]  31.19 
 
 
766 aa  43.9  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39658  predicted protein  30 
 
 
311 aa  43.1  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.334345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>