41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_90001 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_90001  Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase  100 
 
 		 1322 aa  2714    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02890  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, putative  33.68 
 
 		 1113 aa  611  1e-173  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36349  predicted protein  27.66 
 
 		 1127 aa  390  1e-107  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0304624  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06164  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08440)  27.87 
 
 		 2510 aa  135  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0773331  normal  0.0726858 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_5433  predicted protein  31.75 
 
 		 316 aa  108  5e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46080  predicted protein  27.12 
 
 		 1370 aa  103  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_3954  predicted protein  27.33 
 
 		 344 aa  102  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00640  conserved hypothetical protein  26.04 
 
 		 1209 aa  95.9  5e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.334737  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08074  MATH and UCH domain protein, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_5G01750)  23.98 
 
 		 1319 aa  95.1  7e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.499613 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03711  ubiquitin C-terminal hydrolase Ubp8, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12710)  26.17 
 
 		 484 aa  93.2  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.954307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87051  predicted protein  28.37 
 
 		 714 aa  80.5  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.168813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32361  predicted protein  23.95 
 
 		 565 aa  77.8  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.136395 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03800  ubiquitin specific protease, putative  23.43 
 
 		 599 aa  77.4  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4512  predicted protein  28.65 
 
 		 312 aa  75.9  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.873462  normal  0.145734 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_3692  predicted protein  24.78 
 
 		 347 aa  75.5  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03587  Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase (EC 3.1.2.15) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96V54]  28.41 
 
 		 766 aa  75.5  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01600  conserved hypothetical protein  25.99 
 
 		 728 aa  74.7  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15310  predicted protein  27 
 
 		 190 aa  71.6  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.804518  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05186  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07160)  29.9 
 
 		 840 aa  68.6  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000787837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46434  predicted protein  23.96 
 
 		 631 aa  68.6  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04350  conserved hypothetical protein  22.19 
 
 		 576 aa  68.2  0.0000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59469  predicted protein  25.15 
 
 		 701 aa  68.2  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39658  predicted protein  25.97 
 
 		 311 aa  67  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.334345  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42729  predicted protein  21.94 
 
 		 1003 aa  66.6  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02072  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04720)  24.23 
 
 		 1022 aa  66.6  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.701074 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6409  predicted protein  22.69 
 
 		 334 aa  65.9  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62413  predicted protein  22.14 
 
 		 848 aa  65.1  0.000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40154  predicted protein  25.98 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07360  ubiquitin-specific protease, putative  24.07 
 
 		 1312 aa  63.9  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39993  predicted protein  30.15 
 
 		 688 aa  62  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000426118  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_62908  predicted protein  21.19 
 
 		 879 aa  57.8  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00100  ubiquitin-specific protease, putative  27.95 
 
 		 1099 aa  57.8  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0377728  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12752  predicted protein  23.67 
 
 		 348 aa  57  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21982  predicted protein  28.67 
 
 		 641 aa  55.8  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4022  predicted protein  28.06 
 
 		 377 aa  55.5  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0632274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_65573  predicted protein  24.12 
 
 		 803 aa  52.4  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.227667 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46292  predicted protein  23.33 
 
 		 772 aa  48.5  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47704  predicted protein  27.63 
 
 		 1183 aa  47  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_29340  predicted protein  22.38 
 
 		 499 aa  46.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.210564  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44745  predicted protein  22.28 
 
 		 1075 aa  45.4  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.362492  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_69820  predicted protein  31.93 
 
 		 1340 aa  45.1  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>