53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12752 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_12752  predicted protein  100 
 
 		 348 aa  724    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_3692  predicted protein  40.28 
 
 		 347 aa  258  1e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07360  ubiquitin-specific protease, putative  36.7 
 
 		 1312 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39993  predicted protein  52.6 
 
 		 688 aa  206  3e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000426118  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62413  predicted protein  31.41 
 
 		 848 aa  187  2e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03680  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, putative  46.94 
 
 		 1490 aa  187  3e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.920906  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_2936  predicted protein  33.15 
 
 		 344 aa  180  4e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47704  predicted protein  47.15 
 
 		 1183 aa  177  2e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_974  predicted protein  43.84 
 
 		 603 aa  177  2e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000875731  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21982  predicted protein  46.5 
 
 		 641 aa  168  1e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02072  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04720)  28.65 
 
 		 1022 aa  150  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.701074 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06354  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14130)  39.9 
 
 		 1418 aa  144  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.387584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_69820  predicted protein  38.89 
 
 		 1340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_62908  predicted protein  27.81 
 
 		 879 aa  115  8.999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_5433  predicted protein  29.3 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_3954  predicted protein  27.07 
 
 		 344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03587  Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase (EC 3.1.2.15) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96V54]  27.1 
 
 		 766 aa  109  9.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39658  predicted protein  27 
 
 		 311 aa  102  8e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.334345  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32361  predicted protein  24.26 
 
 		 565 aa  101  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.136395 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42729  predicted protein  26.05 
 
 		 1003 aa  100  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4512  predicted protein  25.71 
 
 		 312 aa  98.2  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.873462  normal  0.145734 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6409  predicted protein  28.85 
 
 		 334 aa  98.2  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59469  predicted protein  27.57 
 
 		 701 aa  92  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185317  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03711  ubiquitin C-terminal hydrolase Ubp8, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12710)  27.45 
 
 		 484 aa  91.7  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.954307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87051  predicted protein  28.52 
 
 		 714 aa  89.4  8e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.168813  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04350  conserved hypothetical protein  26.33 
 
 		 576 aa  88.2  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01600  conserved hypothetical protein  26.09 
 
 		 728 aa  87.8  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15310  predicted protein  34.29 
 
 		 190 aa  81.6  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.804518  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44745  predicted protein  24.94 
 
 		 1075 aa  82  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.362492  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42571  predicted protein  25.06 
 
 		 1319 aa  80.1  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05186  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07160)  25.62 
 
 		 840 aa  79.7  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000787837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31584  predicted protein  29.49 
 
 		 618 aa  75.1  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00000066135  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02890  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, putative  25.44 
 
 		 1113 aa  69.7  0.00000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06164  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08440)  23.3 
 
 		 2510 aa  69.7  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0773331  normal  0.0726858 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28684  predicted protein  24.47 
 
 		 474 aa  65.5  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00640  conserved hypothetical protein  26.29 
 
 		 1209 aa  64.3  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.334737  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36349  predicted protein  26.33 
 
 		 1127 aa  60.5  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0304624  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59800  predicted protein  23.6 
 
 		 489 aa  59.7  0.00000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02660  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14, putative  22.97 
 
 		 796 aa  59.3  0.00000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.989129  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_90001  Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase  23.67 
 
 		 1322 aa  57.4  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40154  predicted protein  25.91 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07422  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G06330)  22.22 
 
 		 697 aa  54.3  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.942281  hitchhiker  0.000000000000044106 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00100  ubiquitin-specific protease, putative  22.52 
 
 		 1099 aa  53.9  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0377728  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_65573  predicted protein  24.07 
 
 		 803 aa  53.5  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.227667 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04458  snRNP assembly factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07520)  23.51 
 
 		 616 aa  52.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.472172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46434  predicted protein  21.91 
 
 		 631 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_17041  predicted protein  22.98 
 
 		 379 aa  49.7  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.852844  normal  0.0273457 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_13360  predicted protein  34.95 
 
 		 461 aa  49.3  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000134973 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87099  predicted protein  21.29 
 
 		 830 aa  47.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000037034  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61453  ubiquitin specific protease  29.13 
 
 		 489 aa  46.6  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.981787  normal  0.483859 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2491  predicted protein  22.35 
 
 		 423 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000443928  normal  0.292142 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11102  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02380)  23.63 
 
 		 572 aa  43.5  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.235915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59020  predicted protein  25.11 
 
 		 792 aa  42.7  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200991  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>