19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46292 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_46292  predicted protein  100 
 
 
772 aa  1607    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00640  conserved hypothetical protein  24.74 
 
 
1209 aa  77.8  0.0000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.334737  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36349  predicted protein  25.51 
 
 
1127 aa  77  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0304624  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02890  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, putative  25.34 
 
 
1113 aa  69.3  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03711  ubiquitin C-terminal hydrolase Ubp8, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12710)  22.47 
 
 
484 aa  56.2  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.954307  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15310  predicted protein  27.36 
 
 
190 aa  55.8  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.804518  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_3954  predicted protein  22.83 
 
 
344 aa  55.1  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03680  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, putative  26.06 
 
 
1490 aa  54.7  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.920906  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06164  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08440)  20.96 
 
 
2510 aa  53.1  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0773331  normal  0.0726858 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07360  ubiquitin-specific protease, putative  22.4 
 
 
1312 aa  51.6  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_3692  predicted protein  21.71 
 
 
347 aa  51.2  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_5433  predicted protein  26.9 
 
 
316 aa  50.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32361  predicted protein  21.12 
 
 
565 aa  48.1  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.136395 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_90001  Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase  23.33 
 
 
1322 aa  48.1  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37903  deubiquitinating enzyme  28.1 
 
 
481 aa  46.2  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.816359  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39993  predicted protein  21.31 
 
 
688 aa  45.4  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000426118  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4512  predicted protein  23.62 
 
 
312 aa  45.1  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.873462  normal  0.145734 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40154  predicted protein  26.46 
 
 
319 aa  45.1  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02072  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04720)  20.92 
 
 
1022 aa  44.3  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.701074 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>