48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA04350 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA04350  conserved hypothetical protein  100 
 
 
576 aa  1203    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_5433  predicted protein  37.32 
 
 
316 aa  187  4e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42729  predicted protein  31.78 
 
 
1003 aa  162  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59469  predicted protein  28.49 
 
 
701 aa  149  2.0000000000000003e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185317  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4512  predicted protein  29.59 
 
 
312 aa  139  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.873462  normal  0.145734 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07360  ubiquitin-specific protease, putative  28.88 
 
 
1312 aa  121  3e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03711  ubiquitin C-terminal hydrolase Ubp8, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12710)  29.06 
 
 
484 aa  120  9e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.954307  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_3954  predicted protein  27.64 
 
 
344 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39658  predicted protein  28.39 
 
 
311 aa  117  7.999999999999999e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.334345  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_3692  predicted protein  28.69 
 
 
347 aa  116  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32361  predicted protein  26.32 
 
 
565 aa  115  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.136395 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46434  predicted protein  27.22 
 
 
631 aa  111  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02072  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04720)  26.29 
 
 
1022 aa  110  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.701074 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15310  predicted protein  35.47 
 
 
190 aa  109  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.804518  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01600  conserved hypothetical protein  30.59 
 
 
728 aa  105  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03587  Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase (EC 3.1.2.15) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96V54]  28.91 
 
 
766 aa  100  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62413  predicted protein  25.61 
 
 
848 aa  100  6e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.776839  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03800  ubiquitin specific protease, putative  25.32 
 
 
599 aa  100  7e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6409  predicted protein  24.78 
 
 
334 aa  93.6  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_2936  predicted protein  28.09 
 
 
344 aa  90.9  6e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39993  predicted protein  37.25 
 
 
688 aa  90.5  7e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000426118  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12752  predicted protein  26.33 
 
 
348 aa  88.2  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05186  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07160)  23.62 
 
 
840 aa  85.5  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000787837  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46080  predicted protein  25.85 
 
 
1370 aa  84.7  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59800  predicted protein  24.38 
 
 
489 aa  84.7  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36349  predicted protein  23.97 
 
 
1127 aa  84.3  0.000000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0304624  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87051  predicted protein  22.39 
 
 
714 aa  79.3  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.168813  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02890  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, putative  23.87 
 
 
1113 aa  79  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_69820  predicted protein  30.57 
 
 
1340 aa  72.8  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03680  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, putative  28.93 
 
 
1490 aa  69.7  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.920906  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44745  predicted protein  24.07 
 
 
1075 aa  69.3  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.362492  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_90001  Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase  22.19 
 
 
1322 aa  68.6  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00100  ubiquitin-specific protease, putative  21.14 
 
 
1099 aa  65.1  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0377728  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06354  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14130)  33.77 
 
 
1418 aa  64.7  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.387584  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21982  predicted protein  28.65 
 
 
641 aa  61.6  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47704  predicted protein  28.39 
 
 
1183 aa  60.5  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_29340  predicted protein  22.49 
 
 
499 aa  60.5  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.210564  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_974  predicted protein  30.32 
 
 
603 aa  60.5  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000875731  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31584  predicted protein  27.8 
 
 
618 aa  58.9  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00000066135  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00640  conserved hypothetical protein  23.78 
 
 
1209 aa  58.9  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.334737  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40154  predicted protein  24.22 
 
 
319 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_62908  predicted protein  20.68 
 
 
879 aa  50.8  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42571  predicted protein  22.65 
 
 
1319 aa  50.4  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1805  hypothetical protein  31.48 
 
 
339 aa  48.1  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02660  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14, putative  22.44 
 
 
796 aa  48.1  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.989129  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02507  ubiquitin-specific protease, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07555)  22.56 
 
 
524 aa  48.1  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.265191  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4396  peptidase C19 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2  27.97 
 
 
1517 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.20461 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54531  predicted protein  35.71 
 
 
558 aa  44.3  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.737555  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>