26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK00100 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006680  CNK00100  ubiquitin-specific protease, putative  100 
 
 
1099 aa  2232    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0377728  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59800  predicted protein  30.82 
 
 
489 aa  192  2.9999999999999997e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42729  predicted protein  27.11 
 
 
1003 aa  106  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_3954  predicted protein  26.91 
 
 
344 aa  69.7  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15310  predicted protein  31.71 
 
 
190 aa  69.7  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.804518  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04350  conserved hypothetical protein  24.6 
 
 
576 aa  64.3  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_3692  predicted protein  23.96 
 
 
347 aa  64.3  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_5433  predicted protein  24.58 
 
 
316 aa  63.5  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12752  predicted protein  22.8 
 
 
348 aa  62.8  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87051  predicted protein  25.69 
 
 
714 aa  61.2  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.168813  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39658  predicted protein  24.71 
 
 
311 aa  59.7  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.334345  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02072  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04720)  22.31 
 
 
1022 aa  59.3  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.701074 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02890  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, putative  24.8 
 
 
1113 aa  57  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03587  Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase (EC 3.1.2.15) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96V54]  26.02 
 
 
766 aa  57  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_90001  Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase  27.95 
 
 
1322 aa  55.5  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1992  Excalibur domain-containing protein  31.94 
 
 
334 aa  53.1  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00268093  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6409  predicted protein  23.97 
 
 
334 aa  50.8  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00091  signal recognition particle docking protein FtsY  39.34 
 
 
439 aa  50.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.290056  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59469  predicted protein  27.27 
 
 
701 aa  50.4  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185317  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36349  predicted protein  25.89 
 
 
1127 aa  48.5  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0304624  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_69820  predicted protein  23 
 
 
1340 aa  48.9  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0010  signal recognition particle-docking protein FtsY  36.84 
 
 
430 aa  47.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62413  predicted protein  20.58 
 
 
848 aa  46.6  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.776839  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2206  hypothetical protein  24.36 
 
 
228 aa  45.8  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_62908  predicted protein  21.67 
 
 
879 aa  45.8  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31584  predicted protein  26.17 
 
 
618 aa  45.8  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00000066135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>