50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42729 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42729  predicted protein  100 
 
 		 1003 aa  2077    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_5433  predicted protein  36.26 
 
 		 316 aa  190  1e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04350  conserved hypothetical protein  31.68 
 
 		 576 aa  162  4e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4512  predicted protein  33.33 
 
 		 312 aa  137  8e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.873462  normal  0.145734 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59469  predicted protein  26.13 
 
 		 701 aa  134  7.999999999999999e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185317  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07360  ubiquitin-specific protease, putative  28.76 
 
 		 1312 aa  132  3e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_3954  predicted protein  28.18 
 
 		 344 aa  128  5e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_3692  predicted protein  28.84 
 
 		 347 aa  124  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62413  predicted protein  27.98 
 
 		 848 aa  124  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.776839  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05186  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07160)  26.85 
 
 		 840 aa  114  7.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000787837  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02072  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04720)  25.55 
 
 		 1022 aa  114  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.701074 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46434  predicted protein  31.91 
 
 		 631 aa  111  7.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03711  ubiquitin C-terminal hydrolase Ubp8, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12710)  29.87 
 
 		 484 aa  108  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.954307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87051  predicted protein  28.2 
 
 		 714 aa  107  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.168813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_2936  predicted protein  26.91 
 
 		 344 aa  105  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00100  ubiquitin-specific protease, putative  26.86 
 
 		 1099 aa  103  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0377728  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12752  predicted protein  26.19 
 
 		 348 aa  103  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32361  predicted protein  26.55 
 
 		 565 aa  102  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.136395 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15310  predicted protein  30.84 
 
 		 190 aa  101  7e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.804518  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39658  predicted protein  29.12 
 
 		 311 aa  99.8  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.334345  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03587  Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase (EC 3.1.2.15) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96V54]  27.21 
 
 		 766 aa  98.6  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42571  predicted protein  27.4 
 
 		 1319 aa  90.5  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01600  conserved hypothetical protein  24.36 
 
 		 728 aa  87.8  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44745  predicted protein  26.27 
 
 		 1075 aa  86.7  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.362492  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39993  predicted protein  33.92 
 
 		 688 aa  85.5  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000426118  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6409  predicted protein  25.83 
 
 		 334 aa  84.7  0.000000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_62908  predicted protein  23.6 
 
 		 879 aa  84.3  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36349  predicted protein  24.72 
 
 		 1127 aa  84.3  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0304624  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03680  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, putative  30.37 
 
 		 1490 aa  81.6  0.00000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.920906  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59800  predicted protein  28.18 
 
 		 489 aa  77.8  0.0000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31584  predicted protein  28.9 
 
 		 618 aa  70.5  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00000066135  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1805  hypothetical protein  26.43 
 
 		 339 aa  68.2  0.0000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47704  predicted protein  28.28 
 
 		 1183 aa  67.4  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03800  ubiquitin specific protease, putative  24.18 
 
 		 599 aa  67.4  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_974  predicted protein  28.65 
 
 		 603 aa  66.2  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000875731  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_90001  Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase  25.5 
 
 		 1322 aa  65.5  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46080  predicted protein  23.1 
 
 		 1370 aa  64.7  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06354  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14130)  27 
 
 		 1418 aa  64.3  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.387584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21982  predicted protein  29.65 
 
 		 641 aa  63.5  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_69820  predicted protein  27.96 
 
 		 1340 aa  62.4  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00640  conserved hypothetical protein  24.17 
 
 		 1209 aa  60.1  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.334737  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_29340  predicted protein  27.98 
 
 		 499 aa  59.7  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.210564  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87099  predicted protein  30.33 
 
 		 830 aa  53.1  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000037034  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_65573  predicted protein  25.97 
 
 		 803 aa  53.5  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.227667 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_13360  predicted protein  21.59 
 
 		 461 aa  50.8  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000134973 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11102  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02380)  44.9 
 
 		 572 aa  49.7  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.235915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0770  hypothetical protein  31.2 
 
 		 343 aa  46.2  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4396  peptidase C19 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2  28.76 
 
 		 1517 aa  45.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.20461 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06164  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08440)  20.99 
 
 		 2510 aa  45.1  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0773331  normal  0.0726858 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02660  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14, putative  24.33 
 
 		 796 aa  45.1  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.989129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>