52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_69820 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_69820  predicted protein  100 
 
 
1340 aa  2766    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06354  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14130)  39.95 
 
 
1418 aa  289  2.9999999999999996e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.387584  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03680  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, putative  38.94 
 
 
1490 aa  236  3e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.920906  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39993  predicted protein  36.15 
 
 
688 aa  193  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000426118  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47704  predicted protein  31.69 
 
 
1183 aa  190  1e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_974  predicted protein  36.27 
 
 
603 aa  168  8e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000875731  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_3692  predicted protein  40.82 
 
 
347 aa  162  3e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07360  ubiquitin-specific protease, putative  42.05 
 
 
1312 aa  158  7e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21982  predicted protein  35.29 
 
 
641 aa  145  5e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12752  predicted protein  38.89 
 
 
348 aa  137  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_2936  predicted protein  37.88 
 
 
344 aa  132  5.0000000000000004e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62413  predicted protein  36.16 
 
 
848 aa  117  1.0000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.776839  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02072  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04720)  27 
 
 
1022 aa  108  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.701074 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39658  predicted protein  35.59 
 
 
311 aa  95.5  6e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.334345  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44745  predicted protein  37.2 
 
 
1075 aa  83.6  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.362492  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32361  predicted protein  33.68 
 
 
565 aa  83.6  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.136395 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6409  predicted protein  35.03 
 
 
334 aa  79  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03711  ubiquitin C-terminal hydrolase Ubp8, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12710)  35.67 
 
 
484 aa  78.6  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.954307  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04350  conserved hypothetical protein  31.21 
 
 
576 aa  78.2  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_5433  predicted protein  28.23 
 
 
316 aa  70.9  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_62908  predicted protein  29.15 
 
 
879 aa  71.2  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01600  conserved hypothetical protein  29.3 
 
 
728 aa  68.2  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42729  predicted protein  31.21 
 
 
1003 aa  67.8  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59469  predicted protein  25.79 
 
 
701 aa  67.4  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185317  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03587  Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase (EC 3.1.2.15) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96V54]  29.19 
 
 
766 aa  66.6  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4512  predicted protein  33.1 
 
 
312 aa  66.2  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.873462  normal  0.145734 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15310  predicted protein  32.89 
 
 
190 aa  65.5  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.804518  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87051  predicted protein  31.63 
 
 
714 aa  65.5  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.168813  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03800  ubiquitin specific protease, putative  34.5 
 
 
599 aa  65.5  0.000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_3954  predicted protein  30.25 
 
 
344 aa  62.8  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05186  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07160)  28.7 
 
 
840 aa  60.8  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000787837  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04458  snRNP assembly factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07520)  28.3 
 
 
616 aa  57.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.472172  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46434  predicted protein  28.48 
 
 
631 aa  57.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28684  predicted protein  30.95 
 
 
474 aa  57  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42571  predicted protein  27.33 
 
 
1319 aa  55.8  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87099  predicted protein  28.57 
 
 
830 aa  55.5  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000037034  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2491  predicted protein  35.85 
 
 
423 aa  55.5  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000443928  normal  0.292142 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31584  predicted protein  35.4 
 
 
618 aa  55.5  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00000066135  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02890  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, putative  28.3 
 
 
1113 aa  55.1  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59800  predicted protein  26.97 
 
 
489 aa  51.6  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37903  deubiquitinating enzyme  29.71 
 
 
481 aa  51.6  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.816359  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54531  predicted protein  29.29 
 
 
558 aa  50.4  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.737555  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02660  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14, putative  29.2 
 
 
796 aa  48.5  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.989129  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07422  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G06330)  31.45 
 
 
697 aa  48.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.942281  hitchhiker  0.000000000000044106 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01280  conserved hypothetical protein  29.51 
 
 
562 aa  47.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40154  predicted protein  28.57 
 
 
319 aa  47.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36349  predicted protein  36.19 
 
 
1127 aa  46.6  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0304624  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11102  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02380)  30.47 
 
 
572 aa  46.6  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.235915  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00100  ubiquitin-specific protease, putative  32.48 
 
 
1099 aa  46.2  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0377728  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_65573  predicted protein  31.36 
 
 
803 aa  46.2  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.227667 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_90001  Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase  31.93 
 
 
1322 aa  45.4  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18008  predicted protein  25.5 
 
 
844 aa  45.1  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>