15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_18008 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_18008  predicted protein  100 
 
 
844 aa  1747    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87099  predicted protein  37.47 
 
 
830 aa  510  1e-143  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000037034  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02660  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14, putative  30.9 
 
 
796 aa  311  2e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.989129  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07422  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G06330)  32.92 
 
 
697 aa  275  3e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.942281  hitchhiker  0.000000000000044106 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_65573  predicted protein  28.23 
 
 
803 aa  268  2.9999999999999995e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.227667 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62413  predicted protein  25.56 
 
 
848 aa  63.9  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.776839  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06354  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14130)  30.83 
 
 
1418 aa  52.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.387584  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03711  ubiquitin C-terminal hydrolase Ubp8, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12710)  22.07 
 
 
484 aa  52  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.954307  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02072  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04720)  21.77 
 
 
1022 aa  52.4  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.701074 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_2936  predicted protein  28.02 
 
 
344 aa  52  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_69820  predicted protein  26.11 
 
 
1340 aa  49.7  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_3954  predicted protein  22.71 
 
 
344 aa  46.6  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1805  hypothetical protein  34.29 
 
 
339 aa  46.6  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11102  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02380)  75 
 
 
572 aa  45.8  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.235915  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42571  predicted protein  30.33 
 
 
1319 aa  44.3  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>