46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH02890 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006693  CNH02890  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, putative  100 
 
 
1113 aa  2327    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_90001  Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase  33.62 
 
 
1322 aa  598  1e-169  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36349  predicted protein  34.75 
 
 
1127 aa  543  1e-153  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0304624  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06164  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08440)  30.97 
 
 
2510 aa  138  7.000000000000001e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0773331  normal  0.0726858 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_5433  predicted protein  31.39 
 
 
316 aa  120  9.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00640  conserved hypothetical protein  27.78 
 
 
1209 aa  114  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.334737  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32361  predicted protein  27.58 
 
 
565 aa  105  4e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.136395 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46080  predicted protein  25.9 
 
 
1370 aa  103  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_3954  predicted protein  27.59 
 
 
344 aa  103  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03711  ubiquitin C-terminal hydrolase Ubp8, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12710)  25.47 
 
 
484 aa  97.8  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.954307  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08074  MATH and UCH domain protein, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_5G01750)  24.71 
 
 
1319 aa  97.1  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.499613 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46434  predicted protein  23.19 
 
 
631 aa  85.1  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87051  predicted protein  30.19 
 
 
714 aa  85.1  0.000000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.168813  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03587  Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase (EC 3.1.2.15) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96V54]  29 
 
 
766 aa  84.3  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_3692  predicted protein  25.38 
 
 
347 aa  84  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07360  ubiquitin-specific protease, putative  27.37 
 
 
1312 aa  80.9  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15310  predicted protein  27.41 
 
 
190 aa  80.5  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.804518  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04350  conserved hypothetical protein  23.87 
 
 
576 aa  79.7  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01600  conserved hypothetical protein  25.45 
 
 
728 aa  77  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6409  predicted protein  23.42 
 
 
334 aa  74.3  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4512  predicted protein  26.11 
 
 
312 aa  74.3  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.873462  normal  0.145734 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4022  predicted protein  37.38 
 
 
377 aa  73.2  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0632274  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40154  predicted protein  25.74 
 
 
319 aa  72  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59469  predicted protein  23.99 
 
 
701 aa  69.7  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185317  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21982  predicted protein  36.63 
 
 
641 aa  69.7  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12752  predicted protein  25.44 
 
 
348 aa  69.7  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39658  predicted protein  24.81 
 
 
311 aa  69.7  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.334345  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46292  predicted protein  25.34 
 
 
772 aa  69.7  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03800  ubiquitin specific protease, putative  25.3 
 
 
599 aa  67.8  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39993  predicted protein  24.44 
 
 
688 aa  65.1  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000426118  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02072  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04720)  26.29 
 
 
1022 aa  65.1  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.701074 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05186  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07160)  26.9 
 
 
840 aa  64.7  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000787837  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0770  hypothetical protein  27.48 
 
 
343 aa  62.8  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_13360  predicted protein  24.57 
 
 
461 aa  59.3  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000134973 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_2936  predicted protein  22.38 
 
 
344 aa  58.5  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00100  ubiquitin-specific protease, putative  24.8 
 
 
1099 aa  57.4  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0377728  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_17041  predicted protein  21.52 
 
 
379 aa  54.3  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.852844  normal  0.0273457 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_29340  predicted protein  22.61 
 
 
499 aa  53.1  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.210564  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_62908  predicted protein  20.2 
 
 
879 aa  51.6  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62413  predicted protein  20.73 
 
 
848 aa  50.1  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.776839  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1805  hypothetical protein  24.12 
 
 
339 aa  50.1  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_69820  predicted protein  31.58 
 
 
1340 aa  50.1  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37903  deubiquitinating enzyme  24.8 
 
 
481 aa  49.3  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.816359  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03680  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, putative  30.97 
 
 
1490 aa  47  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.920906  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4396  peptidase C19 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2  27.82 
 
 
1517 aa  46.2  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.20461 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31772  predicted protein  24 
 
 
382 aa  44.7  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>