50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_32361 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_32361  predicted protein  100 
 
 
565 aa  1174    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.136395 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03711  ubiquitin C-terminal hydrolase Ubp8, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12710)  34.23 
 
 
484 aa  237  3e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.954307  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03800  ubiquitin specific protease, putative  28.32 
 
 
599 aa  206  6e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6409  predicted protein  27.87 
 
 
334 aa  146  1e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_5433  predicted protein  28.53 
 
 
316 aa  123  9e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04350  conserved hypothetical protein  26.32 
 
 
576 aa  115  3e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46434  predicted protein  23.76 
 
 
631 aa  114  5e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44745  predicted protein  25.41 
 
 
1075 aa  114  6e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.362492  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_3954  predicted protein  26.97 
 
 
344 aa  113  8.000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39658  predicted protein  28.09 
 
 
311 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.334345  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01600  conserved hypothetical protein  26.22 
 
 
728 aa  106  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59469  predicted protein  25.71 
 
 
701 aa  106  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185317  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02890  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, putative  27.58 
 
 
1113 aa  105  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03587  Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase (EC 3.1.2.15) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96V54]  29.39 
 
 
766 aa  104  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02072  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04720)  24.87 
 
 
1022 aa  103  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.701074 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42729  predicted protein  26.55 
 
 
1003 aa  102  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07360  ubiquitin-specific protease, putative  24.15 
 
 
1312 aa  102  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62413  predicted protein  26.41 
 
 
848 aa  102  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.776839  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_3692  predicted protein  25.14 
 
 
347 aa  101  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12752  predicted protein  24.26 
 
 
348 aa  101  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87051  predicted protein  31.43 
 
 
714 aa  97.4  7e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.168813  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36349  predicted protein  26.22 
 
 
1127 aa  95.1  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0304624  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_2936  predicted protein  23.25 
 
 
344 aa  93.2  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05186  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07160)  24.18 
 
 
840 aa  92.8  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000787837  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21982  predicted protein  32.52 
 
 
641 aa  88.2  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4512  predicted protein  23.15 
 
 
312 aa  84  0.000000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.873462  normal  0.145734 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39993  predicted protein  30.22 
 
 
688 aa  83.2  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000426118  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_65573  predicted protein  24.27 
 
 
803 aa  80.1  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.227667 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15310  predicted protein  28.12 
 
 
190 aa  79.3  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.804518  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02660  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14, putative  20.2 
 
 
796 aa  78.6  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.989129  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_90001  Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase  23.95 
 
 
1322 aa  77.8  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00640  conserved hypothetical protein  23.78 
 
 
1209 aa  77  0.0000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.334737  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47704  predicted protein  29.56 
 
 
1183 aa  76.3  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_69820  predicted protein  33.68 
 
 
1340 aa  76.6  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07422  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G06330)  22.54 
 
 
697 aa  70.9  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.942281  hitchhiker  0.000000000000044106 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_62908  predicted protein  22.4 
 
 
879 aa  68.2  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03680  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, putative  27.51 
 
 
1490 aa  67.8  0.0000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.920906  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_974  predicted protein  29.33 
 
 
603 aa  63.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000875731  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_13360  predicted protein  19.38 
 
 
461 aa  59.7  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000134973 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06354  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14130)  27.27 
 
 
1418 aa  58.5  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.387584  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42571  predicted protein  21.23 
 
 
1319 aa  56.6  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40154  predicted protein  22.51 
 
 
319 aa  53.9  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1805  hypothetical protein  36.28 
 
 
339 aa  52.8  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06164  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08440)  19.25 
 
 
2510 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0773331  normal  0.0726858 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46292  predicted protein  21.12 
 
 
772 aa  48.1  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06913  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13620)  33.33 
 
 
630 aa  47.8  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.886513 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46080  predicted protein  24.07 
 
 
1370 aa  47.4  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59800  predicted protein  28.27 
 
 
489 aa  46.2  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54531  predicted protein  33.87 
 
 
558 aa  45.4  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.737555  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4396  peptidase C19 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2  31.75 
 
 
1517 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.20461 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>