41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_59800 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_59800  predicted protein  100 
 
 
489 aa  994    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05186  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07160)  34.4 
 
 
840 aa  211  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000787837  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00100  ubiquitin-specific protease, putative  30.6 
 
 
1099 aa  197  3e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0377728  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42729  predicted protein  23.64 
 
 
1003 aa  98.6  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_2936  predicted protein  26.34 
 
 
344 aa  89.7  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04350  conserved hypothetical protein  23.89 
 
 
576 aa  87.8  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_3954  predicted protein  24.08 
 
 
344 aa  80.5  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_5433  predicted protein  26.44 
 
 
316 aa  77.4  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_3692  predicted protein  22.06 
 
 
347 aa  76.3  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07360  ubiquitin-specific protease, putative  24.34 
 
 
1312 aa  69.3  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62413  predicted protein  24.6 
 
 
848 aa  63.5  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.776839  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02072  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04720)  22.56 
 
 
1022 aa  62  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.701074 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12752  predicted protein  23.49 
 
 
348 aa  61.2  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03587  Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase (EC 3.1.2.15) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96V54]  26.9 
 
 
766 aa  60.8  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39658  predicted protein  31.3 
 
 
311 aa  60.8  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.334345  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59469  predicted protein  23.8 
 
 
701 aa  60.8  0.00000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185317  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31584  predicted protein  27.27 
 
 
618 aa  59.3  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00000066135  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39993  predicted protein  32.61 
 
 
688 aa  58.5  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000426118  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_69820  predicted protein  27.73 
 
 
1340 aa  58.2  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42571  predicted protein  22.03 
 
 
1319 aa  57.4  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15310  predicted protein  24.14 
 
 
190 aa  57.4  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.804518  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1805  hypothetical protein  25 
 
 
339 aa  55.8  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4396  peptidase C19 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2  29.23 
 
 
1517 aa  53.9  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.20461 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6409  predicted protein  21.89 
 
 
334 aa  53.5  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21982  predicted protein  29.61 
 
 
641 aa  53.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01600  conserved hypothetical protein  24.12 
 
 
728 aa  53.1  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87051  predicted protein  26.14 
 
 
714 aa  50.1  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.168813  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06354  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14130)  26.97 
 
 
1418 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.387584  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47704  predicted protein  32.09 
 
 
1183 aa  49.7  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04540  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, putative  23.94 
 
 
484 aa  48.9  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03711  ubiquitin C-terminal hydrolase Ubp8, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12710)  21.51 
 
 
484 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.954307  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06164  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08440)  25.38 
 
 
2510 aa  47  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0773331  normal  0.0726858 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32361  predicted protein  23.61 
 
 
565 aa  46.6  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.136395 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_974  predicted protein  25.18 
 
 
603 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000875731  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02660  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14, putative  26.26 
 
 
796 aa  45.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.989129  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46434  predicted protein  20.11 
 
 
631 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03680  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, putative  23.81 
 
 
1490 aa  45.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.920906  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44745  predicted protein  26.77 
 
 
1075 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.362492  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_90001  Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase  25.85 
 
 
1322 aa  45.1  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02890  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, putative  24.17 
 
 
1113 aa  44.7  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36349  predicted protein  28.39 
 
 
1127 aa  43.9  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0304624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>