24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNG04540 on replicon NC_006692
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006692  CNG04540  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, putative  100 
 
 
484 aa  1003    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11102  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02380)  36.77 
 
 
572 aa  314  1.9999999999999998e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.235915  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37903  deubiquitinating enzyme  36.79 
 
 
481 aa  291  2e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.816359  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_13360  predicted protein  32.93 
 
 
461 aa  256  6e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000134973 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_29340  predicted protein  32.88 
 
 
499 aa  241  2e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.210564  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05186  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07160)  22.72 
 
 
840 aa  62  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000787837  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_5433  predicted protein  21.94 
 
 
316 aa  58.2  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_3954  predicted protein  25.63 
 
 
344 aa  54.3  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40154  predicted protein  25.9 
 
 
319 aa  53.5  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32361  predicted protein  21.09 
 
 
565 aa  53.5  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.136395 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59800  predicted protein  23.53 
 
 
489 aa  51.2  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42571  predicted protein  22.64 
 
 
1319 aa  50.1  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06164  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08440)  22.13 
 
 
2510 aa  47.8  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0773331  normal  0.0726858 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87051  predicted protein  21.16 
 
 
714 aa  47.8  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.168813  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46080  predicted protein  22.34 
 
 
1370 aa  47  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59469  predicted protein  21.45 
 
 
701 aa  46.2  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185317  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62413  predicted protein  31.2 
 
 
848 aa  45.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.776839  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39658  predicted protein  36.84 
 
 
311 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.334345  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_65573  predicted protein  28.12 
 
 
803 aa  45.1  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.227667 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36349  predicted protein  20.91 
 
 
1127 aa  44.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0304624  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06354  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14130)  28.21 
 
 
1418 aa  44.3  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.387584  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42729  predicted protein  53.33 
 
 
1003 aa  43.9  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01600  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 
728 aa  43.9  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06913  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13620)  24.29 
 
 
630 aa  43.5  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.886513 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>