92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0481 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0481  ACT domain protein  100 
 
 		 172 aa  344  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000098406  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4699  amino acid-binding ACT  88.37 
 
 		 180 aa  307  4e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0000305264  normal  0.738616 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5182  ACT domain-containing protein  75 
 
 		 172 aa  257  7e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248291  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06310  ACT domain-containing protein  69.05 
 
 		 171 aa  229  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183389  normal  0.204088 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4845  amino acid-binding ACT domain-containing protein  71.43 
 
 		 172 aa  226  9e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0587  hypothetical protein  67.86 
 
 		 171 aa  226  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000555119  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05930  ACT domain-containing regulatory protein  65.12 
 
 		 172 aa  216  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000527553  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0385  amino acid-binding ACT domain-containing protein  66.86 
 
 		 172 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000250758  normal  0.230246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0383  amino acid-binding ACT domain-containing protein  66.86 
 
 		 172 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000019763  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0357  ACT domain-containing protein  66.28 
 
 		 172 aa  214  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000156308  normal  0.422502 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4094  amino acid-binding ACT domain-containing protein  63.95 
 
 		 172 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0332  amino acid-binding ACT domain-containing protein  45.12 
 
 		 172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2002  amino acid-binding ACT domain-containing protein  44.58 
 
 		 173 aa  142  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1150  cellulose-binding family II protein  40.35 
 
 		 178 aa  136  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.768713 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1273  amino acid-binding ACT domain protein  42.94 
 
 		 177 aa  136  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2229  amino acid-binding ACT domain protein  44.85 
 
 		 181 aa  133  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0964148 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03152  ACT domain protein  35.54 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3321  amino acid-binding ACT  34.94 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4173  formyl transferase-like  35.33 
 
 		 385 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1433  amino acid-binding ACT domain-containing protein  35.15 
 
 		 166 aa  97.1  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3885  ACT domain-containing protein  30.12 
 
 		 165 aa  96.7  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3169  amino acid-binding ACT domain-containing protein  35.58 
 
 		 164 aa  97.4  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.765517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1356  amino acid-binding ACT domain-containing protein  33.94 
 
 		 168 aa  95.1  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1943  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.73 
 
 		 175 aa  95.1  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1722  ACT domain-containing protein  35.15 
 
 		 166 aa  94  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2628  ACT domain-containing protein  33.94 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2561  ACT domain-containing protein  33.94 
 
 		 166 aa  92  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1697  amino acid-binding ACT domain-containing protein  34.13 
 
 		 165 aa  91.7  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.54674 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1500  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.34 
 
 		 166 aa  91.3  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000613254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2819  amino acid-binding ACT domain protein  34.55 
 
 		 166 aa  91.3  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.198658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1537  amino acid-binding ACT domain-containing protein  34.55 
 
 		 166 aa  91.3  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1532  amino acid-binding ACT domain-containing protein  34.55 
 
 		 166 aa  91.3  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0236669  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2735  ACT domain-containing protein  33.94 
 
 		 166 aa  91.3  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1565  amino acid-binding ACT domain-containing protein  34.55 
 
 		 166 aa  91.3  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18740  glycine cleavage system regulatory protein  32.16 
 
 		 181 aa  90.1  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.960027  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2746  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.68 
 
 		 166 aa  89.4  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.989316  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1407  ACT domain-containing protein  31.74 
 
 		 166 aa  84.7  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.222833  normal  0.039362 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2585  amino acid-binding ACT  35.21 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92913  predicted protein  33.13 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00941527  normal  0.3672 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003104  glycine cleavage system regulatory protein  29.34 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00303201  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0869  hypothetical protein  28.57 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00598997  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02738  hypothetical protein  28.31 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3434  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  23.17 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3675  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  27.88 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3969  amino acid-binding ACT domain protein  30.99 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100488  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42571  predicted protein  29.13 
 
 		 1319 aa  65.1  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4055  amino acid-binding ACT domain protein  30.99 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2533  glycine cleavage system regulatory protein  27.33 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4386  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.82 
 
 		 188 aa  63.9  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.523733  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45408  predicted protein  28.65 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2199  amino acid-binding ACT domain-containing protein  27.65 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0596072  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2546  hypothetical protein  27.22 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.761879 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3514  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.58 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.160997  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0826  amino acid-binding ACT domain protein  23.81 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.892136  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0896  amino acid-binding ACT domain protein  23.81 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00320944  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0052  glycine cleavage system transcriptional repressor  27.88 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.824677  normal  0.630988 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3629  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  24.55 
 
 		 167 aa  60.8  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.894872  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3623  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  22.42 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.640922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2884  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  25.29 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2525  glycine cleavage system transcriptional repressor  23.67 
 
 		 177 aa  57  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3457  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  25.88 
 
 		 185 aa  57  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0411  amino acid-binding ACT domain protein  26.32 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.404844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0493  amino acid-binding ACT domain protein  27.75 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3554  amino acid-binding ACT  25.88 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0217681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2479  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.07 
 
 		 183 aa  54.3  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1979  amino acid-binding ACT domain-containing protein  26.14 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00211865  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2949  amino acid-binding ACT domain-containing protein  23.67 
 
 		 183 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4707  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.21 
 
 		 170 aa  50.8  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4333  normal  0.012003 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0527  amino acid-binding ACT domain protein  24.42 
 
 		 185 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3496  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.27 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1909  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  24.1 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0700677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2431  amino acid-binding ACT domain-containing protein  23.3 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0267912  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1847  amino acid-binding ACT domain-containing protein  22.7 
 
 		 184 aa  48.5  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00121314  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4273  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32 
 
 		 179 aa  47.8  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340897  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002792  glycine cleavage system transcriptional antiactivator GcvR  24.58 
 
 		 180 aa  47.8  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1863  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  25.14 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000211112  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2176  amino acid-binding ACT domain-containing protein  22.73 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00808907  normal  0.900227 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3185  glycine cleavage system transcriptional repressor  24.03 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.168662  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3703  glycine cleavage system regulatory protein-like  25 
 
 		 183 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2591  amino acid-binding ACT domain-containing protein  20.93 
 
 		 183 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000275101  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1791  amino acid-binding ACT domain protein  20.93 
 
 		 183 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000108735  hitchhiker  0.00000000136293 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2553  amino acid-binding ACT domain-containing protein  20.93 
 
 		 183 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000108497  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2668  amino acid-binding ACT domain-containing protein  20.93 
 
 		 183 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000549184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03188  glycine cleavage system transcriptional repressor  23.46 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1965  ACT domain-containing protein  26.49 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2032  amino acid-binding ACT domain protein  27.87 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0169147  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1535  prephenate dehydrogenase  35.59 
 
 		 369 aa  43.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000209792 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1535  prephenate dehydrogenase  37.29 
 
 		 369 aa  43.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0206592  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0690  formyltetrahydrofolate deformylase  55.88 
 
 		 286 aa  43.1  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2380  glycine cleavage system transcriptional repressor (Gcv operon repressor)  23.53 
 
 		 175 aa  42.4  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0230  hypothetical protein  35.09 
 
 		 90 aa  41.6  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.867874  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1734  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  23.08 
 
 		 178 aa  41.2  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.103341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>